減量を決定するためのアドインバイオマスの新製品を紹介するとき、参照製品と比較して減量の観点からこれを特徴付けることがよくあります。すなわち 同じ量の酵素タンパク質が特定の量だけ活性であると判断するのではなく、使用できる酵素がどれだけ少なくても同じ活性が得られるかを判断します。
ほとんどの場合、これは2つの用量反応曲線間の水平方向の違いを読み取るだけで行われますが、このアプローチでは不確実性を系統的に評価することはできません。私たちは現在、この目的のための方法論を開発しました。これは、統計的に視覚的な読み取りよりも少し健全であり、そのような分析をすばやく実行して結果をプロットするために使用できるアドインを作成しました。簡単に言うと、分析は2つ以上の酵素の用量反応データにHill方程式を当てはめることに基づいています。
今後の開発のためのご意見は大歓迎です。MTOFとLCKの支援に感謝します。
Re:減量を決定するためのアドイン来週は何度かチャットすることは間違いないと思います!Re:減量を決定するためのアドイン @JPKO 、来週、ちょっとしたデモをさせていただきます!おそらくExcelにソルバーアドインをロードする必要があります。
ジェスパー
Re:減量を決定するためのアドイン @ jfri0 :おかしい、私は誰かが前にこれを行ったことを誰かが言うのを待っていました-結局のところ、用量削減は酵素製品を比較するための比較的よく確立された基礎です。
私はあなたのマクロを機能させることはできません(私が持っていない可能性のあるライブラリがあるもの)、またはドキュメント(おそらくLUNAがあるもの)を読むことはできませんでしたが、2つのアプローチを比較するのは楽しいかもしれません。私は来週のジャンボリーのバイオエネルギーポスターセッションでこれについてポスターを持っています。あなたがチャットのために立ち寄る時間を見つけることができればそれは素晴らしいでしょう。そして、それもあなたのために行きますあずきっく 
Re:減量を決定するためのアドイン @JPKO ありがとう!スクリプトを分析の下のNovoJMP実験に追加しました: http://gitlab.nzcorp.net/nznarddatascience/NovoJMPAddin/blob/Experimental/NovoJMP.jmpaddin
@ jfri0 Ew .xls 
Re:減量を決定するためのアドインhttp://nz/fast/link.pl?luna = 2002-29536
:-)ジェスパー
Re:減量を決定するためのアドインよかったです!私の最適化されていない散発的にドキュメント化されたコードを気にしないのなら、私はまったく気にしませんか?また、私はHillモデルを使用する代わりにいくつかの方法をいじっています。アドインを投稿してから、代わりに「機械的成長」を使用するように変更しました。パラメーターが1つ少なく、データに明らかに適合しているためです。同じように。これはユーザーが変更したいものかもしれませんが、現時点ではオプションとして実装していません。
完全なスクリプトを以下に貼り付けます。預け入れを希望する場合はお知らせください。
ヨハン
// this script will fit a Mecanistic Growth model to any number of dose-response
// data sets with a minimum of 4 observations each, and calculate the percentage
// difference between the dose needed to achieve a given response.
//
// JPKO@novozymes.com - 19/10 2017
//
Names default to here(1);
dt=current data table();
dt << clear Select;
// delete previous prediction columns
col_name_list = dt << get column names(string);
if (contains(col_name_list, "Prediction formula"),
dt<< delete column("Prediction formula" )
);
// ------- create dialog to define columns ----------
dlg = Column Dialog(
Title( "Specify data columns" ),
groupCol = Col List( "Enzyme", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ) ),
xCol = Col List( "Dose", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ), DataType( "Numeric" ) ),
yCol = Col List( "Response", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ), DataType( "Numeric" ) )
);
// check if user decides to quit.
If( dlg["Button"] == -1,
Throw( "User cancelled" )
);
// process information returned from dialog.
Remove From( dlg );
Eval List( dlg );
dt:groupCol << set property( "Row Order Levels", (1) );
// ----- create dialog to determine the response at which the inverse comparison should be made ------
New Window( "Select response",
<<MODAL></MODAL>Re:減量を決定するためのアドインこれはいいですし、1Gバイオ燃料にも役立つと思います!それをNovoJMPアドインスイートに統合してもよろしいですか?( http://gitlab.nzcorp.net/nznarddatascience/NovoJMPAddin )
問題がなければ、たまたま元のスクリプトファイルを使用できますか?
〜マイケル
Re:減量を決定するためのアドイン以下は、必要な構造を示すデータテーブルの例です。以下は、生成されたプロットのスクリーンダンプです。
