선량 감소를 결정하기위한 추가 기능바이오 매스에 새로운 제품을 도입 할 때 우리는 종종 참조 제품에 비해 용량 감소 측면에서이를 특성화합니다. 즉 같은 양의 효소 단백질이 일정량만큼 더 활동적이라는 것을 결정하는 대신, 우리가 사용할 수있는 효소가 얼마나 적 으면서도 동일한 활성을 얻을 수 있는지 결정하고 싶습니다.
대부분 우리는 두 선량-반응 곡선 사이의 수평 적 차이를 간단히 읽음으로써 이것을 수행했지만,이 접근법은 불확실성의 체계적인 평가를 허용하지 않습니다. 우리는 이제이 퍼 퓨즈에 대한 방법론을 개발했습니다. 이것은 시각적으로 읽는 것보다 통계적으로 좀 더 소리가납니다. 그리고 그러한 분석을 신속하게 수행하고 결과를 플로팅하는 데 사용할 수있는 추가 기능을 만들었습니다. 간단히 말해서, 분석은 두 개 이상의 효소에 대한 용량 반응 데이터에 Hill 방정식을 맞추는 것을 기반으로합니다.
추가 개발을위한 모든 의견은 환영합니다. 도움을 주신 MTOF 및 LCK에게 감사드립니다.
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능확실히 다음 주에 여러 번 채팅 할 거라고 생각합니다!Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능 @JPKO , 다음 주에 간단한 데모를 드리겠습니다! Excel에서 Solver 추가 기능을로드해야 할 수 있습니다.
Jesper
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능 @ jfri0 : 재미 있네요. 누군가가 전에이 일을했다고 말해 줄 사람을 기다리고 있었어요. 결국 용량 감소는 효소 제품 비교를위한 비교적 잘 확립 된 기반입니다.
매크로를 작동 시키거나 (내가 가지고 있지 않은 라이브러리가있는 것) 문서를 읽을 수는 없지만 (아마 LUNA가있는 것) 두 가지 접근 방식을 비교하는 것이 재미있을 수 있습니다. 다음 주 잼버리에서 열리는 바이오 에너지 포스터 세션에 이것에 대한 포스터가 있습니다. 채팅을 위해 들를 시간이 있다면 좋을 것입니다. 그리고 그것은 당신에게도갑니다 안녕하세요. 
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능 @JPKO 감사! 분석에서 NovoJMP Experimental에 스크립트를 추가했습니다. http://gitlab.nzcorp.net/nznarddatascience/NovoJMPAddin/blob/Experimental/NovoJMP.jmpaddin
@ jfri0 Ew .xls 
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능http : //nz/fast/link.pl? luna = 2002-29536
제스퍼
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능네가 좋다 니 기쁘다! 최적화되지 않은 산발적으로 문서화 된 코드에 신경 쓰지 않는다면 전혀 신경 쓰지 않겠습니까? 또한 Hill 모델을 사용하는 것에 대한 몇 가지 대안을 조금 엉망으로 만들었으며 추가 기능을 게시 한 후 매개 변수가 하나 적고 데이터에 분명히 맞기 때문에 대신 "기계적 성장"을 사용하도록 변경했습니다. 게다가. 이것은 사용자가 변경하고 싶을 수도 있지만이 시점에서 옵션으로 구현하지 않았습니다.
전체 스크립트는 아래에 붙여 넣습니다. 차라리 입금을 원하시면 알려주세요.
요한
// this script will fit a Mecanistic Growth model to any number of dose-response
// data sets with a minimum of 4 observations each, and calculate the percentage
// difference between the dose needed to achieve a given response.
//
// JPKO@novozymes.com - 19/10 2017
//
Names default to here(1);
dt=current data table();
dt << clear Select;
// delete previous prediction columns
col_name_list = dt << get column names(string);
if (contains(col_name_list, "Prediction formula"),
dt<< delete column("Prediction formula" )
);
// ------- create dialog to define columns ----------
dlg = Column Dialog(
Title( "Specify data columns" ),
groupCol = Col List( "Enzyme", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ) ),
xCol = Col List( "Dose", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ), DataType( "Numeric" ) ),
yCol = Col List( "Response", Min Col( 1 ), Max Col( 1 ), DataType( "Numeric" ) )
);
// check if user decides to quit.
If( dlg["Button"] == -1,
Throw( "User cancelled" )
);
// process information returned from dialog.
Remove From( dlg );
Eval List( dlg );
dt:groupCol << set property( "Row Order Levels", (1) );
// ----- create dialog to determine the response at which the inverse comparison should be made ------
New Window( "Select response",
<<MODAL></MODAL>Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능이것은 좋으며 1G 바이오 연료에도 도움이 될 것이라고 생각합니다! NovoJMP 추가 기능 제품군에 통합해도 될까요? ( http://gitlab.nzcorp.net/nznarddatascience/NovoJMPAddin )
괜찮다면 원본 스크립트 파일을 사용할 수 있습니까?
~ 마이클
Re : 용량 감소를 결정하기위한 추가 기능다음은 필요한 구조를 보여주는 예제 데이터 테이블입니다. 아래는 생성 된 플롯의 화면 덤프입니다.
