Se han introducido muchos artículos sobre la comparación de software de análisis estadístico, pero la mayoría de ellos están dirigidos a estadísticos profesionales. En medicina, la gran mayoría de las personas que utilizan software estadístico son en realidad médicos que no se especializan en estadística. Por diversas razones, tuvieron que aprender por sí mismos a utilizar software estadístico. Basado en más de diez años de experiencia en análisis estadístico médico, el autor es muy consciente de las dificultades que enfrentan los médicos al utilizar software estadístico por su cuenta.
Para ayudar a más médicos a deshacerse de esta dificultad, ayúdelos a aprender cómo utilizar JMP para realizar análisis de datos de manera eficiente y mejorar la eficiencia del trabajo diario y la publicación de artículos, de ahora en adelante, el Dr. Feng Guoshuang, un senior de JMP Usuario y estadístico senior, él y su equipo compartirán una serie de estadísticas y análisis de datos, operaciones prácticas de JMP y otro contenido práctico en la plataforma de análisis de datos de JMP. Cada número tiene un tema clásico para ayudar a todos a dominar una nueva habilidad. Vale la pena señalar que estos temas no son solo para médicos, sino que son aplicables a todos los que utilizan el software JMP para realizar análisis de datos.
Este artículo es el primero de una serie de artículos. El Dr. Feng y su equipo comparten su recorrido y experiencia en el uso del software JMP y brindan ejemplos de por qué el software JMP es un software estadístico más adecuado para los médicos. Para facilitar la lectura, el artículo se describe en primera persona.
Entonces, ¿por qué creemos que el software JMP es más adecuado para que lo utilicen los médicos? En realidad, hay muchas razones, aquí te presentamos algunas de las principales:
01 Operación estilo mesa con todas las funciones
Esto es probablemente lo que más preocupa a los médicos. Debido a que la estadística no es el trabajo principal de los médicos, no es necesario dedicar mucho tiempo a aprender software estadístico, y las operaciones basadas en menús definitivamente están más en línea con las necesidades de los médicos que el diseño del programa.
Puede sentir intuitivamente la tabla de funciones de JMP (Figura 1).
Figura 1 Menú de análisis JMP
En la tabla de funciones de análisis, podemos ver algunas características de JMP en la clasificación estadística. No se clasifica simplemente según métodos específicos, sino una clasificación amplia basada en la estructura de los métodos estadísticos.
Por ejemplo, si desea comparar las medias de dos grupos, desde un punto de vista estadístico, la llamada "comparación entre grupos" es en realidad un análisis de un solo factor. El grupo es el índice y el indicador a comparar ( indicador de resultado) es la variable dependiente. Estadística En matemáticas, el argumento se denomina x y la variable dependiente se denomina y. Por lo tanto, la comparación entre grupos significa analizar el impacto de los factores del grupo (iniciador x) en los indicadores de resultados (variable dependiente y).
Por lo tanto, en JMP, todas las comparaciones entre grupos, o más ampliamente, todos los análisis unidireccionales, están contenidos en el menú Ajustar Y por X.
Este enfoque es útil para comprender el pensamiento estadístico. Es posible que algunos médicos no estén acostumbrados al método de JMP al principio, pero una vez que lo utilicen, descubrirán que este método es en realidad más conveniente porque se divide en categorías amplias según métodos estadísticos, lo que es más propicio para comprender las estadísticas. métodos.
Además, el menú JMP se puede cambiar entre chino e inglés en cualquier momento. Para los investigadores científicos que quieran publicar artículos en inglés, primero pueden realizar los resultados del análisis en chino y luego cambiar el idioma directamente en el menú (Documento → Preferencias). Inglés, con efecto inmediato, no es necesario reiniciar. Esto es muy humano.
02 Proceso de análisis más conveniente
En el pasado, en la mayoría del software estadístico basado en menús, cuando deseaba utilizar un determinado método estadístico, hacía clic en el menú correspondiente y luego había varias opciones esperándolo. Una vez completadas todas las configuraciones, haga clic en Aceptar para ingresar directamente. la sección de resultados.
Por ejemplo, supongamos que tenemos un dato (visualización parcial) que se muestra en la Figura 2 y ahora queremos ver si existe una diferencia estadística en las puntuaciones de salud física entre las personas que beben y las que no beben.
Figura 2 Datos de muestra
Si utiliza un determinado software para comparar estos dos grupos, la tabla de funciones de análisis se muestra en la Figura 3. Debe configurar varias cosas, luego confirmar e ingresar a la interfaz de resultados.
Figura 3 Interfaz de análisis de un determinado software estadístico
JMP es diferente. El menú de análisis es muy simple. No hay opciones. Simplemente arrastre y suelte las variables requeridas en la posición correspondiente (Figura 4). No es necesario realizar configuraciones adicionales, JMP determinará automáticamente qué resultados del método deben ingresarse según el tipo de x (categórica o continua, como se muestra en la Figura 4, la variable roja es categórica, la variable azul es continua) y el tipo de y.
En la Figura 4, dado que x es una variable categórica e y es una variable continua, el software selecciona automáticamente el método de "factor único" (consulte la esquina inferior izquierda de la Figura 4, equivalente al análisis de variación). Si xey son categóricos, la esquina inferior izquierda de la Figura 4 se convertirá en "contingencia" (equivalente a la prueba de chi-cuadrado).
Figura 4 Interfaz de análisis JMP
Algunas personas pueden preguntar, no hay opción, entonces, ¿qué pasa si quieres hacer algunos cambios? Por ejemplo, aunque y es una variable continua, ¿qué pasa si no satisface la distribución normal y es necesario probarla sin un número principal? Ésta es la especialidad de JMP. La interfaz de análisis de JMP es muy simple, pero la interfaz de resultados es muy rica y todas las opciones están en la interfaz de resultados (Figura 5).
Cuando hacemos clic en Aceptar en la interfaz de la Figura 4, ingresamos a la interfaz de resultados de JMP (Figura 5). La interfaz resultante es simple por defecto, pero tiene muchas opciones.
Figura 5 La interfaz de resultados del análisis del menú "Ajustar Y con X" en JMP
Como se puede ver en la Figura 5, si desea mostrar otros resultados, puede verificar los métodos que necesita a través del menú desplegable rojo (triángulo rojo) en cualquier momento. Si ya no los necesita, también puede verificarlos. apagado en cualquier momento. Este enfoque hace que el análisis y la exploración de datos sean más convenientes. En otro software, si quieres volver a hacerlo, tienes que volver atrás y hacerlo todo de nuevo. Pero no se usa en JMP. Si desea cambiar el método (por ejemplo, hizo una prueba t y de repente descubrió que los datos pueden no ajustarse a la distribución normal y desea realizar una prueba sin madre), no hay Necesito regresar, solo verifique otros métodos en los resultados. Muy conveniente.
03 Operación semiinteligente
Todos los investigadores clínicos pueden tener un sueño: qué maravilloso sería si pudieran registrar datos en un software y luego dejarlo todo en manos del software.
Aunque no existe un software estadístico totalmente inteligente, un software semiinteligente todavía puede hacerlo. En otras palabras, aunque el software estadístico no puede elegir un método basado exclusivamente en los datos, aún puede ayudarle a tomar una decisión en algunas situaciones específicas. Por ejemplo, si desea comparar las medias de varios grupos, definitivamente no puede usar la prueba t directamente; si desea realizar un análisis de regresión y el resultado son datos categóricos, en la mayoría de los casos, primero considerará la regresión logística. etc. Aquí es donde JMP ayuda a todos a volverse semiinteligentes.
De hecho, según la Figura 4 presentada anteriormente, creo que ya habrá sentido que en el "Fit Y con
Demostremos aún más el rendimiento de JMP en modo semiinteligente.
Ilustremos nuevamente comparando las puntuaciones de salud física de dos grupos de personas que beben y no beben. Primero revisemos los resultados en la Figura 5. Dado que se trata de una comparación entre dos grupos, generalmente se puede considerar la prueba t. Observamos que hay una prueba t en los resultados (“t fusionada” en la Figura 6).
Figura 6 Interfaz de resultados de análisis para comparación entre dos grupos en JMP
Ahora cambiamos una variable de agrupación y comparamos las puntuaciones de salud física entre diferentes clases de función cardíaca. La clasificación de la función cardíaca es una clasificación múltiple y primero se considera el análisis de varianza. Usamos el mismo método de operación que en la Figura 4 (simplemente reemplace el consumo de alcohol en la Figura 4 con la clasificación de la función cardíaca) para obtener la interfaz de resultados del análisis en la Figura 7.
En este momento, se sorprenderá al descubrir que falta la "t fusionada" en la Figura 7.
Figura 7 Interfaz de resultados de análisis para comparaciones de múltiples grupos en JMP
¿por qué? Debido a que la prueba t no se puede utilizar para comparaciones de múltiples grupos, JMP elimina automáticamente los métodos que no se deben utilizar. Esto es muy importante, especialmente para los no estadísticos.
Como otro ejemplo, supongamos que utilizamos la puntuación de salud física como variable dependiente para analizar el impacto de varios otros indicadores en la puntuación de salud física. En general, se puede considerar la regresión lineal.
Arrastramos las variables dependientes y los argumentos a las posiciones correspondientes a través del menú "Ajustar modelo" (Figura 8). Entonces eche un vistazo: JMP selecciona el "método de mínimos cuadrados estándar" (equivalente a la regresión lineal) de forma predeterminada y automáticamente desactiva los dos métodos de regresión logística, dejándolo incapaz de elegir.
Figura 8 Interfaz de análisis del menú “Modelo de ajuste” en JMP
¿Por qué es esto? Debido a que el resultado (puntuación de salud física) es una variable continua, la regresión logística no se puede utilizar para la regresión de variables continuas y la regresión lineal es la más utilizada. Para este error tan básico, JMP le ayuda directamente a evitarlo.
A través de los dos ejemplos anteriores, se puede ver que el software JMP refleja su amor por las especialidades no estadísticas en todos los aspectos y el profesionalismo se puede ver en los detalles, lo cual es realmente bien intencionado.
04 Operación totalmente interactiva
La mayoría del software estadístico trabaja desde los datos hasta los resultados. Después de obtener resultados basados en datos, generalmente es difícil pasar de los resultados a los datos.
Pero JMP es diferente. Los resultados son solo el comienzo del análisis real. No solo se pueden agregar o eliminar los resultados correspondientes según las necesidades (Figura 5), sino que los resultados siempre están relacionados con los datos.
La Figura 9 muestra la distribución de edades, proporciona indicadores de descripción estadística y proporciona gráficos. La clave es que estos gráficos se pueden seleccionar con el mouse, y cuando seleccionas el gráfico de cualquier variable, también se seleccionan las observaciones correspondientes de otras variables.
Por ejemplo, en la Figura 9, hay dos variables, edad y estratificación por edad, cuando seleccionamos los datos correspondientes de la variable edad, encontrará que también se selecciona la variable "estratificación por edad", y "estratificación por edad" La correspondiente en la lista de frecuencias también está seleccionado. Si observa el conjunto de datos, encontrará que estos datos también están seleccionados en el conjunto de datos. En otras palabras, el software JMP no es simplemente "datos → resultados", sino que los datos y los resultados son interactivos. Puede ser "datos → resultados" o "resultados → datos". Los datos y los resultados siempre están relacionados.
Figura 9 Ejemplo de interacción entre datos y resultados en JMP
Algunas personas pueden pensar, ¿de qué sirve esta conexión? Muy útil en trabajos prácticos. Por ejemplo, si desea seleccionar personas que "beben" por separado, ni siquiera necesita usar estas funciones de filtrado. Puede seleccionar "beber" directamente en la imagen y luego se seleccionará simultáneamente en el conjunto de datos (Figura 10), y luego use la función "subconjunto" Simplemente seleccione la información de las personas que beben.
Figura 10 Uso de gráficos para filtrar datos en JMP
Para otro ejemplo, si encontramos un punto anormal en el diagrama de dispersión y queremos ubicar rápidamente los datos, podemos seleccionar directamente el punto en el gráfico, luego ir al conjunto de datos y encontrar que el punto está marcado, y podemos directamente utilice la función de posicionamiento para localizarlo. Esta observación le ahorrará el tiempo de comprobar esta información usted mismo.
05 Otras funciones humanizadas
JMP en realidad tiene muchas funciones fáciles de usar, que son difíciles de terminar en este artículo y se presentarán una por una en series de artículos posteriores. Finalmente, permítanme mencionar algunas funciones más prácticas y que ahorran tiempo.
Por ejemplo, en las tablas de datos JMP, no hay restricciones en los nombres de las variables ni en la denominación de los valores de las variables. No hay problema si es chino, inglés, símbolos especiales, etc. En la actualidad, la mayoría del software estadístico no puede hacer esto y, a menudo, tiene ciertas restricciones en los nombres de las variables, lo que resulta en la necesidad de modificar las cifras una vez obtenidos los resultados, lo cual es demasiado problemático. JMP puede producir directamente el resultado según el nombre de la variable sin modificaciones.
Para otro ejemplo, la función gráfica de JMP es interactiva, a diferencia de otros software estadísticos del pasado: no depende de especificar variables para dibujar gráficos y se puede realizar completamente arrastrando y soltando (Figura 11). Se pueden cambiar libremente varios gráficos. Para cambiar, simplemente haga clic con el mouse (el gráfico superior en la Figura 11, cambia instantáneamente con un clic del mouse).
Figura 11 Visualización de la interfaz de dibujo JMP
Por supuesto, las ventajas de JMP no se limitan a esto: las anteriores son solo algunas experiencias basadas en lo que hemos utilizado en el trabajo real. En la siguiente serie de artículos, también presentaremos las características de JMP en la clasificación y limpieza de datos, gráficos y análisis estadístico uno por uno a través de casos y explicaciones, que creemos que brindarán a todos métodos de análisis más rápidos y eficientes.
