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| 凱爾西·J·米克勞斯 | 您好，歡迎來到 JMP Discovery Online。 今天我將討論不良事件總結和臨床試驗分析。 |
| 我是 SAS JMP 生命科學部門高級分析小組的高級經理，我們與客戶密切合作，在他們的研究中使用基因組和臨床數據。 |
| 因此，在詳細介紹使用 JMP 進行不良事件分析之前，我想先介紹我們團隊創建的 JMP Clinical 軟體。 |
| JMP Clinical 是產品系列之一，目前包括五種官方產品以及插件，它們可以擴展 JMP，真正讓您擁有任意類型的垂直應用程式或 JMP 擴充功能。 |
| 我的開發團隊支援 JMP Genomics 和 JMP Clinical。 JMP Genomics 和 JMP Clinical 分別是基於 JMP 構建的客製化垂直應用程序，用於基因組研究和臨床試驗研究。 |
| 今天我將討論我們如何在 JMP Clinical 中建立評論和分析 |
| 正在進行臨床試驗安全性和早期療效分析的製藥業。 |
| JMP Clinical的最初目的以及這款產品的慫恿其實是透過對FDA的協助，FDA是JMP的重度用戶 |
| 還有他們的 CDER 小組，即藥物評估與研究中心。 他們的醫學審查員通常使用 JMP 來幫助審查藥物提交。 |
| 他們喜歡它。 他們對此非常有成就。 但他們發現的一件事是，某些重複操作，尤其是針對非常標準的臨床數據，可能會非常痛苦。 |
| 這裡的例子是一種稱為“位移圖”的想法，用於實驗室測量 |
| 您可以將實驗室的試驗平均值與治療組的基線進行比較。 為了創建這個，至少需要八到十個步驟 |
| 在 JMP 介面中開啟數據，標準化數據，將其子集到基線與試驗中，分別為那些將其合併回來的群組進行統計，然後透過實驗室測試拆分該數據，以便您可以製作此類圖表對於每個實驗室。 |
| 這甚至還沒有達到圖形生成器中建構它的步驟數。 |
| 所以 JMP 顯然可以做到這一點，但我們想做的是解決他們對這種非常標準的臨床數據類型的痛苦 |
| 例如，使用一鍵式實驗室班次圖。 事實上，我們希望在我們的基礎設施中創建臨床評論，我們稱之為評論構建器 |
| 這些是一鍵式標準化可重複審查，適用於評估藥物安全性和有效性的臨床試驗研究中所需或預期的許多高度通用的標準分析和視覺化。 |
| 因此，自從第一次為移位圖創建自訂應用程式以來，JMP Clinical 已經不斷發展 |
| 成為全方位服務的臨床...臨床試驗分析軟體，涵蓋醫學監測和臨床數據科學、醫學寫作團隊、生物識別和生物統計學，以及與臨床試驗收集相關的研究數據的數據管理。 |
| 這既適用於安全性和有效性，也適用於臨床資料收集中可能發現的操作完整性或操作異常。 |
| 我們發現 JMP Clinical 的一些關鍵功能是 |
| 對於使用 JMP 介面進行任何類型分析的人尤其有用 |
| 是諸如虛擬連結之類的東西。 因此，我們有一個全球審查主題過濾器的想法，我將在不良事件演示期間向您展示它， |
| 這確實允許您將臨床試驗中受試者的人口統計資訊或人口統計資料整合並連結到收集的所有臨床領域數據。 |
| 這種架構是透過 JMP 介面內的虛擬連線和行狀態同步來實現的， |
| 讓您能夠真正進行即時互動式審查，而在臨床試驗資料分析中可能進行的所有類型的分析中，只需很少甚至無需進行資料操作。 |
| 我們在軟體中新增的另一個新功能也利用了 JMP 資料過濾器的一些功能，以及 |
| 在建立 JMP 指標列時，這種能力能夠在您互動式審查臨床試驗資料時， |
| 找到有趣的訊號，在這個例子中，顯示的螢幕截圖是在臨床試驗中發生嚴重不良事件的受試者，找到那些有趣的訊號， |
| 立即建立一個指標標記，該標記與您在 JMP Clinical 中的研究一起儲存在元資料中 |
| 這適用於您可能執行的所有其他類型的分析。 所以你可以說，我現在想查看發生嚴重不良事件的患者與未發生嚴重不良事件的患者的實驗室結果，看看是否存在可能與不良事件嚴重程度發生相關的異常情況。 |
| 我還將透過 JMP Clinical 展示的另一個功能以及圍繞不良事件分析的演示是 |
| 我們已將 JMP Clinical API 內建於系統中。 提供、創建和開發垂直應用程式最困難的事情之一 |
| 具有開箱即用的一鍵式報告的是 |
| 你已經完成了 90%，然後客戶可能會說，哦，好吧，我真的想調整它，或者我真的想以這種方式查看它，或者我需要更改資料視圖的顯示方式。 |
| 因此，我們的開發團隊一直在努力做的事情之一就是使用 JMP 腳本 JSL |
| 將 API 引入臨床審查，控制對象、顯示、儀表板、分析，甚至進入臨床審查的資料集。 因此，我還將在不良事件分析中展示其中的一些內容。 |
| 現在我們已經了解了 JMP Clinical 的概況，讓我們稍微回顧一下不良事件和臨床試驗的實質內容。 |
| 其實有兩種關鍵的思考方式。 臨床試驗的安全審查方面通常是對可能發生的不良事件進行計數和百分比。 |
| 許多醫生、監察員或審查員經常使用這些數據來了解醫療異常情況，你知道，某種不良事件開始出現 |
| 更常見的是，使用一種可能具有醫學意義的治療方法。 |
| 還有統計訊號檢測，即統計評估以不尋常的速度發生的不良事件的想法 |
| 一個治療組與另一個治療組的比較。 例如，這裡是一個傳統的靜態表，您可以在圍繞臨床試驗不良事件分析的許多類型的研究、提交或交流中看到該表。 |
| 基本上它是一個帶有計數百分比的靜態表，如果它更面向統計，您還會看到諸如置信區間和 p 值之類的內容 |
| 圍繞比值比、相對風險或利率差異等問題。 |
| 另一種檢視方式也可以是視覺方式，而不是使用表格格式，因此訊號偵測，例如比值比或風險差異 |
| 例如，在這種情況下，可能會使用圖形產生器來顯示某些不良事件發生率的統計分析結果以及治療組之間的差異。 |
| 這是兩個例子。 事實上，從我們所做的工作以及與我們合作的客戶來看，他們如何看待和分析不良事件， |
| JMP 臨床系統現在提供幾種常見的不良事件分析，從簡單的計數和百分比到發生率或發生率 |
| 統計指標，如風險差異、相對風險、優勢比，包括一些暴露調整事件時間分析。 |
| 我們還可以使我們適合的模型類型變得更加複雜，並真正進入混合模型或貝葉斯模型，以及找到具有不良事件差異的某些訊號。 |
| 我們也大量使用這些數據來審查醫學寫作敘述或病患檔案中的醫學數據。 |
| 因此，現在我將直接進入 JMP Clinical，並圍繞許多常見分析進行回顧。 |
| 因此，您會注意到 JMP Clinical 的一件事是，它看起來並不完全像 JMP，但它確實像。 |
| 它是一個組合的整合解決方案，具有大量自訂 JSL 腳本來建立我們自己的介面類型。 例如，我們的入門視窗列出了研究、評論和設定。 |
| 我已經建立了評論 |
| 這裡 |
| 這是使用我們的範例尼卡達平資料。 這是隨產品附帶的數據。 JMP 範例庫中也提供了它。 |
| 這是一項真正的臨床試驗，研究的是蜘蛛網膜下腔出血。 約有 900 名患者。 |
| 因此，我們審查的第一個選項卡所關注的只是這些患者的人口統計特徵的分佈，男性與女性的比例，他們的種族分類， |
| 他們接受的治療組是什麼，數據的獲取地點等等。所以這很常見，就像了解臨床試驗的臨床數據的第一步一樣。 |
| 您會注意到這裡有一個報告導航器，它顯示了我們在此建置的審核中可用的其餘分析類型。 |
| 我將快速瀏覽每個選項卡，向您展示我們可以透過臨床試驗資料集查看不良事件的所有不同方式。 |
| 現在，臨床試驗收集資料的典型方式是稱為 CDISC 格式的國際標準， |
| 這通常意味著我們有一個非常堆疊的資料集格式。 在這裡我們可以看到它，每個受試者都有多個記錄，表明隨著時間的推移可能發生的不同不良事件。 |
| 該數據將與人口統計數據配對，如該人口統計數據所示，每個主題佔一行。 我們有大約 900 名患者，您會在第一份報告中看到，我們有大約 5,000 或 5,500 條發生的不同不良事件的記錄。 |
| 因此，這可能是許多評估不良事件訊號的醫學監測人員和醫學審查人員最常使用的報告。 |
| 我們這裡基本上是一個儀表板，它將圖形生成器計數圖與隨附的表格相結合，因為它們習慣於查看此類表格。 |
| 現在，JMP 的真正價值在於其交互性以及直接到數據的動態鏈接，以便您可以選擇數據中的任何位置並在兩個位置查看它。 或者更強大的是，您可以透過以下方式控制您的觀點 |
| 列切換器。 |
| 現在，我們實際上可以從研究治療的分佈轉向性別與種族。 你會注意到種族，如果我們記得的話，我們有很多人 |
| 在這項研究中，白色，所以當我們按百分比或計數查看時，這不是一個很好的圖，因此我們可能會標準化並顯示百分比。 |
| 我們也可以決定查看不良事件的總體計數。 |
| 使用它作為列切換器的另一部分是能夠讓您知道對這些事件進行分類。 這是嚴重的不良事件嗎？ 事情的嚴重程度如何？ |
| 他們康復後的結果是還是沒有？ 是什麼原因造成的？ 與研究藥物有關嗎？ |
| 所有這些都是醫學審查經常提出的問題，以發現有趣的或異常的信號以及發生的不良事件。 |
| 現在，您可能已經在此儀表板中註意到的一件事是，我在這裡有一個控制組作為列切換器，它實際上控制我的圖表和表格。 因此，當我切換到嚴重性時，這張表也會改變。 |
| 這是透過大量專門針對我們目的的自訂 JSL 腳本完成的，但是 |
| 我告訴你一個秘密，在16 中，列切換器的開發人員將允許我們擁有這種類型的靈活性，這樣您就可以將多個平台物件綁定到同一個列切換器中以驅動複雜的分析。 |
| 我將回到這個發生圖，儘管它看起來很簡單。 這是另一個例子，它實際上是在觀察總體發生情況，其中某些不良事件可能在同一受試者身上多次發生。 |
| 我將回到這些，但快速瀏覽其餘的分析和這些評論，然後再回到簡單的圖形產生器和表格分佈報告的一些複雜性。 |
| 我們審查的下一部分是不良事件事件螢幕。 因此，我們在這裡從僅關注計數和頻率或可能的發病率來取得進展 |
| 進入更多的統計框架來測試一個治療組與另一個治療組中某些不良事件發生率的差異。 |
| 在這裡，我們用火山圖來表示這一點。 因此，我們實際上可以看到，與安慰劑組相比，接受尼卡地平治療的治療組中靜脈炎、低血壓和等體溫尿的發生率更高。 |
| 因此，我們實際上可以選擇這些並深入研究不良事件的非常常見的觀點，這也是我們對細胞圖的相對風險， |
| 當您只查看那些可能具有臨床或統計顯著差異的有趣訊號時，很多時候仍然更容易閱讀。 |
| 有時臨床試驗需要很長時間。 有時他們會持續幾週，就像這項研究只有幾週，但有時他們會持續數年。 |
| 因此，有時隨著試驗的進展，考慮不良事件事件的差異是很有趣的。 我們也有這個能力 |
| 發生率螢幕報告，您實際上可以將研究日分成幾個部分，以了解不良事件的發生率如何隨時間變化。 |
| 證明這一點的一個好方法可能是使用此處的火山爆發圖，該圖顯示了這些訊號在研究進展過程中如何變化。 |
| 因此，另一個強大的想法，特別是當你有更長的臨床試驗或更複雜的臨床試驗時， |
| 不是只關注受試者之間的直接發生率，您可以考慮他們發生事件的時間或這些不良事件發生的暴露調整率。 |
| 這就是我們在時間範圍內提供的事件分析，再次在火山圖中顯示，使用 Kaplan Meier 測試在此處查看 |
| 臨床試驗中發生的某些事件的發生時間的差異。 這裡的好處之一是您可以選擇這些事件並深入查看 JMP |
| 生存平台，以獲得治療組之間可能具有不同事件結果時間的每種不良事件的完整詳細資訊。 |
| 事件發生時間的另一種形式通常稱為發生密度比，這是曝光調整的發生密度的想法。 基本上，這裡的差異在於，它不是使用一些更傳統的比例風險或 Kaplan Meier 分析，這更像是 |
| 根據他們實際接觸藥物的時間進行調整的泊松分佈。 我們可以再次查看那些重要訊號 |
| 並使用具有不良事件訊號檢測功能的特定類型模型的廣義線性模型深入查看 JMP 中的類似報告。 |
| 實際上，我們甚至提供一些非常複雜的貝葉斯分析。 因此，此類數據的其中一件事通常是不良事件 |
| 存在於某些身體系統或類別......器官類別。 因此，我們可以將許多帖子或先驗知識強加到這些模型中。 因此，我們的一些客戶及其生物辨識團隊決定在查看不良事件時使用相當複雜的模型。 |
| 所以，到目前為止，我們已經從我所說的考慮非常簡單的資料分佈視圖開始了 |
| 進入分佈並將不良事件圖計算到非常複雜的統計分析中。 |
| 我現在要回來，回到什麼是簡單的計數和頻率信息，我想花一些時間在這裡展示我們擁有的 JMP 交互性的強大功能。 |
| 正如您所記得的，這裡的區別之一是該表是一個堆疊表，其中包含每個受試者發生的所有不良事件， |
| 我們的人口統計表（我們知道有 900 名受試者）是獨立的。 所以我們想要的不是靜態圖， |
| 就像我們這裡的內容，或 PDF 格式的典型報告中的內容，但我們希望能夠互動式地探索我們的數據 |
| 並查看我們的資料子組，看看這些百分比會如何變化。 現在，困難在於百分比計算需要來自不同表中的主題計數。 |
| 因此，我們實際上是透過公式完成的...例如建立列公式來動態控制選擇時百分比的重新計算，無論是在分類事件中 |
| 或者，更強大的是，使用我們的評論主題過濾工具。 例如，在這裡，我們透過治療來研究所有受試者。 |
| 也許是嚴重與不嚴重的不良事件，但我們可以使用這個全域資料篩選器，它會影響我們審查中的每個主題層級報告 |
| 並立即改變我們的人口統計群體並將我們的百分比更改為 |
| 與這種類型的子組探索互動。 所以在這裡，現在我們實際上可以對白人女性進行分組，看看她們的不良事件百分比和才能是什麼，或者您可能想更細緻地了解每個站點，他們的數據在不同站點上是如何變化的。 |
| 因此，我們真正擁有的不是提交套件或臨床分析，生物辨識團隊在其中 |
| 將 70 個不同的圖表和表格交給醫學審查者進行檢查、篩選，他們有能力在一個介面中創建數百個不同的表格、不同的子集和不同的圖形。 |
| 事實上，您確實可以篩選出那些有趣的類別。 所以如果他們正在尋找嚴重的不良事件 |
| 他們想盡快了解與藥物治療相關的嚴重不良事件，現在我們從 900 名患者中減少到一個非常小的子集 |
| 九名患者經歷了被認為與治療有關的嚴重不良事件。 因此，作為醫學評論員，Ithen 可能希望了解這些患者的所有臨床細節。 |
| 很快，我就可以使用報告中的一個操作按鈕深入了解所謂的完整病患檔案。 |
| 因此，我們現在可以看到所有信息，而不是摘要級別，而是在受試者個人級別上隨時間推移發生在該患者身上的所有信息， |
| 包括當他們發生嚴重不良事件時以及同時進行的實驗室或重要測量。 |
| 我們的 JMP 臨床系統的其他主要用途之一以及醫學審查、醫學監測是醫學寫作團隊。 因此，用另一種方式來看待這個問題，而不是在圖形中甚至在表格中（這些是患者資料表），您實際上可以到這裡 |
| 並產生自動敘述。 |
| 所以在這裡我們要真正啟動 |
| 到我們的不良事件敘事世代。 同樣，我們的 JMP Clinical 的優勢和價值之一是依賴標準數據的垂直應用程式 |
| 是我們只需透過研究就可以了解所有資料及其預先格式化的方式。 所以我們在這裡能做的實際上就是運行這個敘述 |
| 那將會寫給我們 |
| 每一個發生的不良事件的真實故事。 |
| 這將開啟一個 Word 文檔 |
| 其中包含該受試者的所有詳細資訊、他們的人口統計、他們的病史，以及每個不良事件以及與這些不良事件相關的結果或其他問題。 |
| 我們可以一次為一名患者執行此操作，甚至可以一次為所有 900 名患者執行此操作，包括 |
| 更複雜的細節，例如實驗室測量、生命徵象、基準或之前。 因此，醫學評論家發現，能夠標準地獲取資料來源並且在從數字表到實際敘述的資料傳輸中不出錯是非常有價值的。 |
| 所以我認為僅僅透過這一點你就可以真正看到這些分佈視圖的一些力量，這些 |
| 計數圖可讓您深入了解非常精細的資料等級。 這種使用主題過濾器的能力 |
| 查看臨床試驗中的整個患者群體或您可能發現的相關亞群。 |
| 現在，關於我們的全域過濾器透過虛擬連接運作的方式的一件事是，這只是通常顯示有關人口統計資訊的資訊。 |
| 我們在該系統中編寫的其他自訂工具之一是能夠選擇所有發生嚴重不良事件的受試者。 |
| 我們可以得出一個人口標誌，然後在進一步分析中使用它 |
| 或者我們甚至可以將該受試者的過濾器設置到我們的全局過濾器中，現在我們只關注嚴重的......發生嚴重不良事件的受試者，大約......臨床試驗中的近300 名患者發生了嚴重的不良事件。嚴重不良事件。 |
| 現在，即使是這份報告，您也會看到實際上是經過過濾的。 因此，第二份報告是不良事件分佈的不同類型，這是我們最新版本的新增內容，即發病率。 |
| 在這裡，我們的想法不是標準化或除以計算發生事件的受試者數量的百分比。 如果您要在不同國家/地區進行正在進行的試驗或長期試驗或研究試驗，這些試驗的啟動時間不同， |
| 您可能想實際查看不良事件發生的速度。 這就是它正在計算的。 因此，在這種情況下，我們實際上會細分到任何發生嚴重不良事件的受試者。 我們可以看到發生率 |
| 在病人的歲月裡。 例如，您看，第一個事件在安慰劑組中每 10 個患者年發生約 86 次，而安慰劑組則為 71 次 |
| 尼卡地平中。 所以這其實是為了治療蜘蛛網膜下腔出血，如果你不接受活性藥物治療，顱內壓可能會增加。 |
| 這些百分比也是完全動態的，這些發生率。 因此，這些都是由自動輸入表格的 JMP 公式完成的 |
| 尊重不同的人群，因為他們是由這個全局過濾器選擇的。 因此，我們可以看看美國境內的比率及其變化，例如，包括基於來自美國的患者的標準化患者年數。 |
| 因此，儘管這些報告看起來非常簡單，但 JSL 編碼的複雜性超出了將其建置到儀表板的範圍，這基本上是我們團隊整天所做的事情。 |
| 我們嘗試這樣做，以便您擁有一個儀表板，可以幫助您輕鬆探索您所知道的數據，而無需進行所有這些可能變得非常複雜的操作。 |
| 現在我想展示的最後一件事就是這個習俗的想法 |
| 報告或定制報告。 因此，這也是展示這一點的好地方，因為我們在這裡關注的是不良事件的發生率。 因此，我們正在關注每個事件。 |
| 我們有計數，或者您也可以將其更改為按患者年份發生頻率的發生率。 另一種觀點可能是真的希望看到這些不良事件隨時間的推移而發生。 |
| 所以我想透過我們的臨床 API 快速展示這一點。 所以這裡的數據表完全可供您使用。 |
| 我首先需要做的事情之一就是創建一個數字日期變量，我們有一個小部件可以在數據表中執行此操作，我將把它轉換為數字日期。 現在你會注意到最後有一個新列 |
| 不良事件的數字開始日期時間。 您還會注意到這裡所有的力量都來自公式。 這些實際上都是根據創建這些視圖的人群動態重新生成的公式。 |
| 現在我們有了包含這些數據的數位日期，現在我們可能想要增強此分析以包括新類型的繪圖。 |
| 我有一個腳本可以做到這一點。 我馬上要做的一件事就是在我們的月份和年份的資料集中創建幾個額外的欄位。 |
| 接下來的 JSL 是我們的臨床 API 呼叫。 我不會詳細討論這一點，除非這是一種讓我們陷入困境的方式 |
| 臨床審查和訪問這些部分。 所以當我運行這段程式碼時， |
| 它實際上將在我的臨床回顧中插入一個新的部分。 現在，我對臨床試驗中所有受試者逐月發生的不良事件有了新的看法。 |
| 因此，即使使用此自訂視圖，權力之一仍然是該表仍然虛擬地加入到我們的主要群組中，仍然可以完全 |
| 響應該虛擬連接全域主題過濾器。 因此，只需一點自訂 API JSL 程式碼，我們就可以獲得這些非常標準的開箱即用報告，並使用我們自己的分析類型對其進行自訂。 |
| 所以我知道這是對 JMP Clinical 的大量概述，但是，以及該系統可以執行的臨床不良事件分析類型，以及對於在製藥行業或製藥行業從事臨床試驗的人員來說很常見的分析， |
| 但我希望即使您不在製藥領域工作，也能發現本節有價值且有趣。 最好的之一 |
| JMP Clinical 的範例只是 JSL 的極端擴展和強大功能，可創建令人難以置信的自訂應用程式。 |
| 因此，也許您沒有處理不良事件，但您在這裡看到的一些內容可以激發您在 JMP 中為您自己的分析類型建立自訂儀表板或自訂外掛程式。 |
| 謝謝。 |
