Conférencier | Transcription |
| Anderson Mayfield | Très bien tout le monde, merci d'être à l'écoute. Je m'appelle Anderson Mayfield et je suis assistant scientifique à la NOAA ainsi qu'à l'Université de Miami. |
| Et aujourd'hui, je vais vous parler de certaines des recherches que j'ai menées au cours des 20 dernières années environ pour prédire le sort des coraux de récif. |
| Et parce que je vais essayer de couvrir beaucoup de matériel dans les 35 à 40 prochaines minutes, je veux aller de l'avant et remercier mes agences de financement dès le départ, en particulier NSF, NOAA, |
| Fondation des océans vivants. Une grande partie du travail que j'ai eu la chance de pouvoir faire au cours de ma carrière s'est déroulée à distance |
| des emplacements utilisant des technologies assez nouvelles qui ont tendance à être coûteuses, j'ai donc été vraiment chanceux de m'associer à ces excellentes agences qui ont soutenu ce travail. |
| Je m'intéresse donc à toutes les facettes de la biologie corallienne depuis la biologie cellulaire de base. Comment fonctionnent les cellules au jour le jour. Les cellules sont vraiment bondées comme je vais vous le montrer. |
| J'ai fait un assez long séjour où je faisais essentiellement des études d'aquarium où j'ai défié les coraux avec différents facteurs de stress comme les températures et l'acidification des océans, |
| Niveaux de PCO2. et nous faisions cela dans des microcosmes et des mésocosmes. Nous appelons cela la physiologie environnementale et... je vais en fait vous montrer quelques données à ce sujet aujourd'hui. |
| Ce que j'ai vraiment compris ces dernières années, qui est en quelque sorte le cœur de cette présentation, ce sont les prédictions. |
| Ici, je fais référence au diagnostic moléculaire. Comment savoir si un corail est malade ? On attend généralement qu'il soit presque mort pour le diagnostiquer. Ce que je veux faire, c'est essayer de pousser... |
| le faire passer de cette approche diagnostique rétroactive à une approche plus proactive. Pouvons-nous détecter une diminution subtile de la santé des coraux avant qu'ils ne commencent à tomber malades ? |
| Pouvons-nous faire des prédictions sur ceux qui s'en tireront le mieux dans les décennies à venir et ceux qui ne le seront pas ? |
| C'est donc en quelque sorte le cœur de ce que je fais au quotidien, ainsi que celui dont je vais parler aujourd'hui. |
| Je m'excuse donc auprès de ceux d'entre vous qui ont déjà entendu certaines de mes conférences JMP ; vous allez voir beaucoup de répétitions, |
| mais je veux essentiellement que tout le monde soit sur la même longueur d'onde avec une partie de leur biologie des récifs coralliens qui sera essentielle à la compréhension |
| pourquoi j'ai fait les choses comme je les ai faites. Je vais parler de certains problèmes auxquels sont confrontés les récifs coralliens. Malheureusement, la plupart d'entre nous travaillant maintenant dans le domaine des récifs coralliens, |
| non seulement étudier les récifs coralliens parce qu'ils sont beaux et fascinants, mais aussi parce qu'ils meurent à un rythme aussi rapide. |
| Ensuite, je vais parler de deux approches complètement différentes, mais potentiellement complémentaires, pour prédire le devenir des coraux. L'un d'eux examine essentiellement les tendances mondiales de la température à partir de données satellitaires. C'est ce sur quoi la plupart des gens comptent |
| au moment où nous parlons en ce moment. Ensuite, je vous parlerai de nouvelles données et je vais utiliser JMP pour vous montrer à quelle vitesse vous pouvez obtenir des données d'analytes moléculaires directement à partir de la machine |
| et passez directement à la réalisation de prédictions à l'aide d'une approche basée sur les cellules. Ainsi, au lieu de regarder les modèles de température mondiaux pour faire des prédictions sur la santé des coraux, nous regardons en fait à l'intérieur des cellules coralliennes pour voir si nous pouvons diagnostiquer tout ce qui pourrait mal tourner. |
| Parce que je vais essayer de couvrir tellement de choses dans un laps de temps relativement réduit, je vais intrinsèquement passer sous silence les choses. Donc si vous avez des questions, je télécharge |
| toutes les données que je vais vous montrer aujourd'hui. Il y a des diapositives cachées. Il y a donc certaines choses que vous pouvez me voir faire dans JMP et vous ne comprenez pas ce qui s'est passé. |
| Ils sont en fait dans le PowerPoint. Donc, si vous allez le télécharger, vous pouvez voir les détails analytiques détaillés, étape par étape. |
| Vous pouvez soit le faire. Vous pouvez, vous pouvez, je rends toutes les données en libre accès, le PowerPoint, alors écrivez-moi. Vous pouvez consulter mon site Web personnel que j'ai répertorié ici. |
| Je suis certainement heureux de répondre à toutes les questions. Et je pense que ces données sont importantes. Donc, vous savez, ils ne sont pas encore publiés. Mais, vous savez, n'hésitez pas à les regarder à votre guise. |
| Je pense donc que la plupart des gens ont une idée générale de ce qu'est un récif corallien. Je veux juste jeter la définition dès le départ, c'est une structure à base de carbonate de calcium. |
| Il a été construit par une symbiose animal-plante. Ils aiment l'eau plus chaude. Mais comme vous le verrez bientôt, pas trop chaud. |
| Ils ont tendance à être près de l'équateur et des tropiques, ont tendance à avoir une très grande biodiversité, de poissons, d'invertébrés. Comme vous pouvez le voir sur cette photo, |
| il y a des tonnes de cachettes pour les petits organismes. Cela signifie qu'ils sont des pépinières importantes pour les pêcheries importantes sur le plan commercial et qu'ils tamponnent littéralement le littoral. |
| des côtes contre les dommages causés par les tempêtes et les vagues qui fournissent un certain nombre de services écosystémiques aux humains. Franchement, ce n'est pas pour ça que j'ai étudié les récifs coralliens. Je les étudie parce que je pense |
| Ils sont beaux. J'adore faire de la plongée. Et je pense que les organismes sous-jacents qui construisent le cadre sont vraiment fascinants en eux-mêmes et donc, le corail de récif. |
| Un corail de récif, en fait, ce n'est pas qu'un animal. Il a des cellules végétales spécifiquement des algues dinoflagellées dans environ la moitié de ses tissus. |
| Ces dinoflagellés, que je vous ai montrés ici, ce nom de famille tordant la langue est Symbiodiniaceae, ces dinoflagellés sont photosynthétiquement actifs. Ils fixent le carbone de la lumière du soleil, tout comme le ferait une plante et transfèrent le carbone qu'ils fixent dans leur hôte. |
| Oui. Les coraux peuvent se nourrir; ils ont des cellules piquantes spécialisées appelées nématocystes que tous les cnidaires ont, |
| mais franchement, ils dépendent de leurs endosymbiotes pour la plupart de leurs besoins nutritionnels. Les endosymbiotes reçoivent également |
| quelque chose, ils obtiennent les déchets du corail pour leur métabolisme. Ils se mettent à l'abri. C'est vraiment complexe |
| association mutualiste qui fait l'objet d'études depuis plus de 50 ans, mais il y a encore de nombreuses facettes clés que nous ne comprenons pas. |
| Le fait est que ce que vous devez savoir pour cette conférence, c'est que le corail est composé à deux tiers d'un animal, un tiers d'une plante physiologique |
| point de vue physiologiste. C'est donc à la base l'oxymore physiologique, dans le sens où c'est un animal qui peut photosynthétiser via cette symbiose mutualiste avec l'algue dinoflagellée. |
| Vous voulez comprendre la santé d'un corail, vous allez devoir vous concentrer non seulement sur le corail lui-même, mais sur ses endosymbiotes dinoflagellés. Et ça va en fait au-delà de ça. |
| Les coraux abritent tout un mini-écosystème que nous appelons le microbiome. Il existe une pléthore de bactéries, de virus et de champignons qui vivent sur, à l'intérieur ou même à l'intérieur du squelette corallien. |
| Je ne vais vraiment parler que des dinoflagellés et de l'hôte corallien aujourd'hui, mais il suffit de dire que si vous voulez vraiment avoir une compréhension holistique, vous devez considérer l'ensemble de ce que nous appelons un holobionte entre guillemets, qui est un amalgame d'hôte et de symbiote. |
| Je pense donc que c'est probablement quelque chose que la plupart d'entre vous connaissent déjà. De nombreuses menaces mondiales pèsent sur les récifs coralliens. Il y a des choses comme le développement côtier, qui conduit à la pollution de l'eau de mer. Il y a de la surpêche. |
| En Floride, nous sommes particulièrement concernés par la maladie. À l'heure actuelle, il y en a une appelée maladies de perte de tissu corallien pierreux qui ravage les récifs de Floride. |
| Mais à l'échelle mondiale, ce que je dirais, ce que je risquerais de dire, la plupart des biologistes des coraux considéreraient comme la principale menace pour les récifs coralliens, c'est le changement climatique. La raison |
| ces coraux vivent fondamentalement déjà près du seuil supérieur de leur tolérance thermique. Si vous poussez cette température un peu plus haut |
| que ce qu'ils peuvent prendre, ils vont blanchir. Donc, vous allez voir ce que vous voyez dans cette image ici. Et ce que cela signifie, c'est qu'ils ont soit perdu leurs dinoflagellés. |
| Soit ils les ont expulsés, soit ils les ont digérés. Les dinoflagellants sont peut-être encore dans le corail, mais ils ont perdu leur |
| ces coraux ne peuvent plus faire de photosynthèse, ce qui signifie qu'ils ne peuvent plus se nourrir. |
| S'ils ne sont pas capables de réacquérir rapidement des symbiotes, ou peut-être d'avoir une bouffée d'eau de mer riche en nourriture qui passe devant eux, ils vont mourir de faim et mourir. |
| Donc, généralement, ce que vous voyez, c'est lorsque vous dépassez d'environ un degré Celsius la température maximale moyenne de l'année, c'est à ce moment-là que vous voyez un blanchissement. |
| Et cela est connu depuis des décennies. Donc, ce que la NOAA a fait il y a environ 20 ans, ils ont lancé ce programme appelé Coral Reef Watch. C'est un site vraiment sympa. Je vous recommande de le vérifier. Et c'est basé sur une idée très simple. Vous exposez les coraux à une eau plus chaude que la normale pour eux |
| pendant de longues périodes, c'est universellement mauvais. L'idée est connue sous le nom de semaine de chauffage au degré, je vais donc essayer de l'expliquer. |
| C'est... Je m'excuse pour la faible résolution, mais c'est leur instruction qu'ils incluent sur leur site Web. Passons donc en revue cette figure, car c'est important. |
| Donc, sur l'axe y de gauche, vous avez SST qui signifie température de surface de la mer, c'est-à-dire des données de température déduites par satellite. |
| À droite, nous avons une semaine de chauffage en degrés, qui est essentiellement une intégrale des degrés Celsius au-dessus de la normale multipliée par le temps. Donc, dans ce cas, que la ligne bleue hachurée à environ 29 degrés est la moyenne arrière du mois le plus chaud de l'année, qui dans ce cas semble être peut-être |
| Je suppose en été. |
| Vous commencez donc à accumuler du stress à un degré au-dessus de cette moyenne mensuelle. Ce serait donc 29 plus un = 30. |
| Ainsi, le temps que ces coraux passent au-dessus de 30 degrés, et cet exemple provient de l'atoll de Palmyra, |
| c'est quand vous accumulez ces semaines de chauffage en degrés. Donc, si vous avez un degré Celsius au-dessus du maximum mensuel moyen pendant quatre semaines, ce serait des semaines de chauffage de quatre degrés. |
| Vous aviez deux degrés Celsius au-dessus du maximum mensuel moyen, donc dans ce cas 31, pendant deux semaines, ce serait également des semaines de chauffage de quatre degrés. Donc ça... |
| leur type d'hypothèse sous-jacente est, vous savez, que deux degrés Celsius au-dessus du maximum mensuel moyen pendant deux semaines entraîneront en quelque sorte le même critère de blanchiment |
| comme un degré pendant quatre semaines. Du point de vue d'un physiologiste, il pourrait y avoir des problèmes avec cela, mais je pense que dans l'ensemble, c'est un assez bon |
| métrique. Et quel est leur type de référence sous-jacente, une fois que vous dépassez les semaines de chauffage d'environ quatre degrés, une fois que vous entrez dans cette fenêtre de quatre à huit degrés, vous allez probablement commencer à voir un blanchiment. |
| Donc, |
| ils ont de très beaux gifs sur le site Web qui vous montrent des données passées. Donc, cela regarde la fin, je pense, trois ou quatre mois. |
| Donc, ceci regarde les Caraïbes et là, essentiellement là où vous voyez rouge, c'est quand vous avez les semaines de quatre à huit degrés de chauffage. C'est là qu'ils prédisent que le blanchiment va réellement se produire. |
| Ils ne font pas ... La NOAA elle-même ne fait pas vraiment de vérification au sol, donc |
| ils comptent sur les individus pour, vous savez, envoyer des e-mails et des téléphones en disant : "Hé, vous savez que votre prédiction dans ce récif particulier que j'aime est fausse. |
| Ou c'était vrai." Je pense, vous savez, et ces jours-ci, beaucoup d'entre nous sommes assis à la maison. Nous ne pouvons pas plonger. |
| Ce genre de science in silico est, vous savez, ce sera peut-être le mieux que nous puissions faire. Et cet été, c'est juste, c'est regarder comment les températures progressent et espérer ensuite que les coraux pourront résister à la tempête. |
| Et il existe une approche prédictive totalement différente, je dirais, pour examiner la santé des coraux |
| et cela ne regarde en fait pas ... donc la montre Coral Reef Watch regarde dans un délai d'un an, vous montrant la progression du blanchiment |
| sur la partie la plus chaude de l'année. Et ils s'étendent en fait quatre mois dans le futur. Donc, leurs algorithmes essaieront de projeter |
| comme vous le feriez avec la météo, ce qui va se passer sur ces récifs au cours des quatre prochains mois. Dans ce modèle, qui est une sorte de |
| combinaison de la montre Coral Watch de la NOAA avec certains modèles de l'ONU basés sur la production de changements climatiques de l'IBCC... projections, |
| il regarde quelque chose d'un peu différent. Donc ici, au lieu de voir les températures dans les cellules, vous voyez en fait l'année du début du blanchissement sévère annuel. |
| Qu'est-ce que cela signifie? C'est l'année qu'ils prédisent, sur la base des enregistrements de température et de la protection... des semaines de chauffage en degrés projetés, vous allez commencer à voir le blanchiment |
| chaque année. Et ça fait peur parce que si les coraux blanchissent pendant un an, |
| lors d'un été chaud, par exemple, vous pourriez voir des morts, mais les coraux vont se rétablir. Certains vont s'acclimater. Vous pourriez même voir l'adaptation |
| Lorsque vous commencez à avoir des années répétées de blanchissement, où il n'y a pratiquement pas de répit, c'est à ce moment-là que les coraux vont, les récifs coralliens commencent vraiment à se dégrader. Et vous pouvez voir que c'est effrayant, parce que si vous regardez l'échelle, |
| 2015, c'est évidemment déjà passé. Nous avons des récifs (c'est une carte du sud de la Floride ici), nous avons des récifs dont on prévoit déjà qu'ils blanchiront dans l'intégralité de ces pixels qui mesurent environ 25 kilomètres sur 25, et qu'ils blanchiront déjà chaque année. |
| Donc ce qui m'intéresse, je suis un physiologiste. Je veux... je ne veux pas essayer de contredire ces modèles, ce que je veux essayer de faire |
| est de plonger dans chacun de ces carrés de 25 par 25 kilomètres, car nous savons que ce sont des modèles à l'échelle mondiale. Ils ne te disent pas |
| que chaque corail et dans ces pixels va blanchir. Nous savons qu'il y aura de l'hétérogénéité. Nous savons qu'il y aura des espèces plus fortes. Même au sein des espèces, il y aura des génotypes plus forts. |
| C'est ce qui intéresse les gens comme moi. Peut-on améliorer la résolution spatiale de ces modèles et peut-être même la résolution temporelle en prenant en compte |
| données du corail lui-même ? Il ne s'agit que de regarder la température. Comment pourrions-nous fusionner cela avec la santé des coraux réels ? Donc avant mon arrivée à la NOAA, |
| il y a un an et demi, il y a en fait eu beaucoup de travail effectué dans la partie supérieure des Florida Keys, ce qui est excellent pour moi. Nous avons déjà |
| récifs coralliens, on sait tout de leur océanographie, de leur écologie depuis 20 ou 30 ans. Pour quelqu'un comme moi qui veut partir |
| prélever des échantillons, faire des analyses, faire des prédictions, c'est une très bonne configuration à avoir. Je vais donc parler de quatre sites en particulier, vraiment. Je vais juste parler de Cheeca Rocks, mais je veux juste vous montrer ici que nous avons ceci |
| The Rocks et Cheeca Rocks sont notre genre de sites de récifs côtiers préférés. Little Conch et Crocker Reef sont au large, il y en a en fait beaucoup plus que cela. |
| Mais nous savons, grâce à notre vaste ensemble de données des 20 ou 30 dernières années, que ces récifs côtiers sont plus résistants. |
| Les coraux sont plus forts, les couvertures coralliennes plus hautes, ils résistent mieux aux maladies et aux températures élevées. Et c'est parce qu'ils ont été endurcis par le stress |
| Ces environnements sont catastrophiques. Donc c'est une sorte de paradoxe, ils vivent dans le sale |
| une eau trouble dans laquelle les coraux... une eau riche en nutriments dans laquelle les coraux ne prospéreraient normalement pas, mais ils se sont adaptés ou se sont peut-être acclimatés pour y vivre. Alors maintenant, quand de futurs facteurs de stress s'abattent sur eux, ils sont mieux en mesure d'y résister. Donc |
| alors que les récifs au large sont peut-être ceux où vous souhaitez passer vos vacances, l'eau a ce magnifique aspect caribéen, |
| mais les coraux ressemblent à ce que vous voyez sur la droite. Ce ne sont que de petites plaques de corail. La majeure partie a été tuée par le blanchiment et la maladie. Récifs côtiers, vous pouvez encore voir ces grands |
| massives colonies coralliennes. Cette espèce que vous voyez ici est Orbicella faveolata, et ce sera celle que je présenterai dans cette conférence. |
| Vous pouvez en fait obtenir de très belles images de Cheeca Rocks, en particulier. Certains sanctuaires marins nationaux sur certains sites Web de la NOAA, en particulier celui-ci, vous permettent de faire une plongée virtuelle. |
| Examinons donc les données de température de Cheeco Rocks et considérons-les dans le contexte de ce que je vous disais plus tôt à propos de ces semaines de chauffage en degrés et |
| Prédictions de la montre corallienne de la NOAA. Donc, en fait, j'ai fait cela dans Graph Builder, je dois mentionner que lorsque je vais à JMP plus tard, j'utilise en fait |
| une version bêta de 16. Mais comme je ne vais pas présenter d'outils qui ne sont pas déjà disponibles pour les utilisateurs de JMP 15. |
| Ce seront des choses très basiques. Il n'y a donc rien d'intrinsèquement spécifique au JMP 16 que je vais vous montrer dans cet exposé. |
| Donc ici, j'utilise Graph Builder, ce que j'ai fait, j'ai essayé d'émuler le graphique de montre de corail de la NOAA, mais en me concentrant uniquement sur Cheeca Rocks. Nous avons donc la température de surface de la mer sur l'axe y de gauche, |
| les semaines de chauffage en degrés à droite. Donc, la température moyenne à Cheeca Rocks, donc la température la plus élevée de l'année est en juillet et août. Et il fait 31 degrés, ce qui est déjà très chaud pour un récif corallien. |
| Si vous utilisez le type de recommandation UN NOAA du maximum mensuel moyen plus un, ce serait 32 degrés. Vous vous attendez donc à ce que les coraux commencent à accumuler du stress |
| au-dessus de 32 degrés. Vous calculeriez vos semaines de chauffage en degrés en fonction du moment où la température était supérieure à 32. Cependant, nous savons que c'est en fait trop chaud. Si tu |
| si vos semaines de chauffage en degrés étaient basées sur 32, vous n'atteindriez jamais ce seuil de semaine de chauffage de quatre degrés, que vous pouvez voir ici la ligne rouge hachurée la plus basse. |
| Au lieu de cela, ce que j'ai fait dans ce graphique, c'est que j'ai réinitialisé le calcul de la semaine de chauffage en degrés dans JMP à 31,3. C'est |
| sorte de notre seuil de blanchiment. Nous savons depuis que nous allons si souvent sur ces sites, 32 est trop élevé. Une fois que ces coraux sont au-dessus de 31,3 |
| pendant quatre à huit semaines, c'est à ce moment qu'ils commencent à blanchir. Donc, vous savez que cela ne veut pas dire que les modèles de montres coralliennes de la NOAA sont mauvais, c'est juste à des endroits particuliers, ils pourraient avoir besoin de quelques ajustements avec vos propres observations sur le terrain. |
| Il s'agit donc en fait d'examiner en détail les années pendant lesquelles nous avons étudié Cheeca Rocks. Et vous pouvez voir, nous avons commencé à voir le blanchiment en 2014 et 15 et les semaines de chauffage en degrés au cours de ces années, sur la base de nos 31,3 |
| seuil, qui est la ligne rouge continue, était supérieur à 10, ce qui est beaucoup. |
| Nous nous attendrions donc certainement à voir un blanchissement au cours de ces années. L'anomalie est 2016. 2016 est un peu obscurci dans le graphique, mais vous pouvez voir le haut de celui-ci, le rouge le plus haut |
| colonne est à peu près dans ce stade de base de la semaine de chauffage de neuf à 10 degrés. Les récifs auraient dû blanchir cette année-là, mais ils ne l'ont pas fait. |
| Cela pourrait donc être, vous savez, une acclimatation ou simplement une récupération en général, mais c'est l'année anormale. 2017 a été une année plus fraîche, même si nous avons vu des semaines de réchauffement de huit degrés, les récifs n'ont pas blanchi, mais ensuite 2018 blanchissement, 2019 blanchissement. |
| Et puis je viens de mettre à jour ce matin pour zoomer sur 2020 et malheureusement, lorsque j'ai fait cette présentation pour la première fois il y a quelques semaines, |
| vous savez, nous n'avions aucune menace de blanchiment, mais maintenant vous pouvez voir les barres rouges grimper au-dessus de quatre alors que la température a dépassé 31,3 ces dernières semaines, donc malheureusement nous allons probablement avoir une autre année de blanchiment. |
| Nous avons donc... l'avantage de travailler avec les coraux, c'est qu'ils sont sessiles, donc ils ne bougent pas, sauf quand leurs larves. Ainsi, au sein de ces sites, |
| non seulement pouvons-nous regarder, vous savez, blanchir |
| année après année, nous avons des colonies étiquetées. Nous pouvons les échantillonner à différents moments, nous pouvons voir comment leur physiologie change de concert avec ces changements de température. |
| Et puis nous pourrions en fait, nous avons en fait le luxe, puisque nous savons ce qui se passe chaque année en ce qui concerne le blanchiment, vous savez, nous pouvons rétrospectivement. Nous savons, hé, j'ai pris l'échantillon en mars ; |
| ce corail a blanchi en août. Peut-être pourrions-nous examiner ces biopsies que nous avons prises plus tôt et voir si nous pouvons détecter un stress. |
| Ce que je veux vraiment faire, ce n'est pas tellement regarder la chronologie du processus de blanchiment, parce que je pense que Coral Watch le fait assez bien, |
| plus de blanchiment en été. Nous ne pourrons pas améliorer cela. Peut-être que vous pouvez améliorer un peu le timing. Ce que je veux vraiment savoir, c'est |
| pourquoi dans ce cas particulier, voyez-vous partiellement blanchi (c'est le PB), blanchi (c'est le BL), ou le NB (non blanchi), pourquoi voyez-vous |
| cette hétérogénéité ? Ce n'est pas aussi évident, sauf peut-être que si vous regardez en bas à droite, vous voyez des colonies pâles. Vous voyez des colonies qui ne pâlissent pas. |
| Pourquoi certains coraux sont-ils plus résistants que d'autres ? Pouvons-nous utiliser les informations de ces colonies pour faire un test qui créerait une signature, une protéomique ou une signature moléculaire d'une colonie stressée |
| contre un résilient. C'est ce que je pense serait en fait plus utile. Peut-être pas en mesure de |
| ...pour savoir à l'avance quels coraux vont blanchir en premier ou blanchir en second. Mais nous pourrions être en mesure de savoir, hé, sur la base de mon |
| biopsie, basée sur mon analyse moléculaire et sur la base de mon modèle prédictif résultant, ce corail, je prédis, va être capable de mieux résister au blanchiment de celui-ci ici. |
| C'est un peu mon objectif. Et j'ai essayé de m'y attaquer par le passé, depuis que j'étais doctorant à Hawaï. |
| Il s'agit principalement de faire des trucs d'expression génique, en cherchant à voir si nous pouvons trouver un gène ??? qui poussent une expression dans les coraux qui sont plus sensibles au stress. |
| Et peut-être qu'ils ne sont pas du tout utilisés dans les coraux résilients ou peut-être que c'est l'inverse. Peut-être y a-t-il des gènes qui ne sont utilisés que par les coraux rustiques. Ce sont des choses que nous pouvons mesurer. |
| J'ai découvert plus tard qu'il n'y avait vraiment aucune corrélation entre l'expression des gènes et les concentrations de protéines |
| dans les coraux. Alors oui, vous pouvez toujours utiliser les données génétiques pour l'analyse des biomarqueurs. Les données sur l'expression génétique pourraient encore être très utiles pour faire des prédictions sur la santé des coraux, |
| mais si vous voulez savoir ce qui se passe dans les cellules simultanément, si vous voulez connaître le comportement cellulaire, vous devez en fait regarder les protéines. Vous ne pouvez pas déduire |
| les niveaux de protéines à partir des niveaux d'expression génique, car le R au carré pour les coraux est essentiellement, et pour leurs symbiotes, est essentiellement nul. J'ai donc opéré une sorte de changement radical dans mes recherches sur la protéomique il y a environ deux ou trois ans. |
| Donc, ce que je voulais vous montrer aujourd'hui à l'origine, quand j'ai écrit ce résumé pour la première fois, c'était |
| les données de terrain de nos colonies marquées pour montrer comment leurs signatures protéiques évoluent dans le temps |
| pour les coraux sensibles au stress et résilients. Et ça va être ma première chose que je vais faire quand nos laboratoires rouvriront. Malheureusement, |
| nous ne sommes pas autorisés à faire des travaux de laboratoire en ce moment à cause du COVID. Nous ne sommes pas autorisés à faire du travail sur le terrain. Donc, à la place, je vais vous montrer quelques données expérimentales qui, je pense, pourraient encore être utiles |
| pour arriver à certaines de ces questions. Donc, fondamentalement, nous avons ici notre corail préféré, Orbicella faveolata. |
| Il s'agit d'une palissade des Keys de Floride supérieures. Nous les avons pris de ces quatre sites de champs que je vous ai montrés plus tôt, |
| et nous avons fait une expérience simple. Nous avons fait une étude de cinq jours à une température contrôlée de 30 contre une température très élevée de 33. Ceux-ci seront codés en rouge |
| dans les chiffres, ou peut-être avec un V qui signifie très élevé. Et puis nous avons fait une sorte d'étude plus réaliste avec une exposition de 31 jours à la même température de contrôle, mais à une température élevée plus pertinente pour l'environnement de 32. |
| Vous vous souvenez que 32 pénètre dans cette zone où la plupart des coraux ne peuvent pas résister à une exposition à 32 pendant une période prolongée. |
| Donc ce que j'ai fait... eh bien, ce que je voulais faire, c'était regarder dans les cellules de ces coraux et voir s'il y avait des protéines qui ne se trouvent que dans les coraux qui se décolorent. |
| Y en a-t-il qui ne se trouvent que dans les résilients capables de s'acclimater ? |
| J'ai donc pris des approches protéomiques fusil de chasse. C'est une façon élégante de dire que je viens de séquencer toutes les protéines qui étaient dans cet échantillon avec la spectrométrie de masse. |
| Ce n'est en fait pas simple du tout si vous entrez dans le vif du sujet des analyses moléculaires et du spectromètre de masse. Je ne vais pas entrer dans les détails aujourd'hui, je veux juste mentionner que nous utilisons ce |
| Spectromètre de masse Thermo Fisher appelé Q Exactive. C'est l'un des meilleurs instruments d'analyse jamais développés. C'est incroyable ce qu'il peut faire et sa sensibilité. |
| Mais je tiens à souligner à nouveau que lorsque vous effectuez ces types d'analyses avec du corail, nous obtenons les protéines de corail et vous obtenez des protéines de dinoflagellés. Il est très important de regarder les deux. Vous pourriez avoir .... |
