우발 사태 분석을 수행하기 위해 열 목록을로드 할 수 없습니다여보세요,
우발 사태 분석을 실행하고 싶습니다. Y에 사용할 열 이름 (주석) 목록이 있습니다. 불행히도 (잘못된) synthax에서는 첫 번째 열 이름 만 사용하고 나머지는 무시됩니다.
나머지 스크립트는 잘 작동합니다.
synthax를 수정하기위한 제안은 감사하겠습니다.
감사
세바스티앙
annotationls = {Name("N(BDNF signaling pathway)"), Name("N(Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes))"), Name("N(Immune system)"), Name("N(Inflammasomes)"), Name("N(Inflammatory response pathway)"), Name("N(Innate immune system)"), Name("N(Integrin alpha-2b beta-3 signaling)"), Name("N(Integrin beta-2 pathway)"), Name("N(Integrin beta-4 pathway)"), Name("N(Integrin beta-5 pathway)"), Name("N(Integrin cell surface interactions)"), Name("N(Integrin family cell surface interactions)"), Name("N(Integrin signaling pathway)"), Name("N(Integrin-linked kinase signaling)"), Name("N(Integrin-mediated cell adhesion)")};
modulals = {Name("Modulation - Abs(Fold change)> 1.5 & LogWorth Adj pvalue> 0.01")};
d={"test_article"};
u={"specimen_material_type"};
DGEsum = Data Table( "summary of DGE" );
enrich=DGEsum<<CONTINGENCY></CONTINGENCY>스크립팅Re : 열 분석을 수행하기 위해 열 목록을로드 할 수 없습니다Eval () 함수를 사용하여 입력 목록을 확장하려고합니다.
names default to here(1);
annotationls = {Name("N(BDNF signaling pathway)"),
Name("N(Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes))"),
Name("N(Immune system)"), Name("N(Inflammasomes)"),
Name("N(Inflammatory response pathway)"),
Name("N(Innate immune system)"),
Name("N(Integrin alpha-2b beta-3 signaling)"),
Name("N(Integrin beta-2 pathway)"),
Name("N(Integrin beta-4 pathway)"),
Name("N(Integrin beta-5 pathway)"),
Name("N(Integrin cell surface interactions)"),
Name("N(Integrin family cell surface interactions)"),
Name("N(Integrin signaling pathway)"),
Name("N(Integrin-linked kinase signaling)"),
Name("N(Integrin-mediated cell adhesion)")
};
modulals = {Name("Modulation - Abs(Fold change)> 1.5 & LogWorth Adj pvalue> 0.01")};
d={"test_article"};
u={"specimen_material_type"};
byList = d||u;
DGEsum = Data Table( "summary of DGE" );
enrich=DGEsum<<CONTINGENCY></CONTINGENCY>
