不測の事態の分析を行うために列のリストをロードできませんこんにちは、
不測の事態の分析を実行したい。Yに使用する列名(注釈)のリストがあります。残念ながら、(間違った)シンタックスでは、最初の列名のみを使用していて、残りは無視されます。
スクリプトの残りの部分はうまく機能しています。
シンタックスを修正するための提案はいただければ幸いです。
ありがとう
セバスチャン
annotationls = {Name("N(BDNF signaling pathway)"), Name("N(Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes))"), Name("N(Immune system)"), Name("N(Inflammasomes)"), Name("N(Inflammatory response pathway)"), Name("N(Innate immune system)"), Name("N(Integrin alpha-2b beta-3 signaling)"), Name("N(Integrin beta-2 pathway)"), Name("N(Integrin beta-4 pathway)"), Name("N(Integrin beta-5 pathway)"), Name("N(Integrin cell surface interactions)"), Name("N(Integrin family cell surface interactions)"), Name("N(Integrin signaling pathway)"), Name("N(Integrin-linked kinase signaling)"), Name("N(Integrin-mediated cell adhesion)")};
modulals = {Name("Modulation - Abs(Fold change)> 1.5 & LogWorth Adj pvalue> 0.01")};
d={"test_article"};
u={"specimen_material_type"};
DGEsum = Data Table( "summary of DGE" );
enrich=DGEsum<<CONTINGENCY></CONTINGENCY>スクリプティングRe:不測の事態の分析を行うために列のリストをロードできませんEval()関数を使用して、入力リストを展開する必要があります。
names default to here(1);
annotationls = {Name("N(BDNF signaling pathway)"),
Name("N(Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes))"),
Name("N(Immune system)"), Name("N(Inflammasomes)"),
Name("N(Inflammatory response pathway)"),
Name("N(Innate immune system)"),
Name("N(Integrin alpha-2b beta-3 signaling)"),
Name("N(Integrin beta-2 pathway)"),
Name("N(Integrin beta-4 pathway)"),
Name("N(Integrin beta-5 pathway)"),
Name("N(Integrin cell surface interactions)"),
Name("N(Integrin family cell surface interactions)"),
Name("N(Integrin signaling pathway)"),
Name("N(Integrin-linked kinase signaling)"),
Name("N(Integrin-mediated cell adhesion)")
};
modulals = {Name("Modulation - Abs(Fold change)> 1.5 & LogWorth Adj pvalue> 0.01")};
d={"test_article"};
u={"specimen_material_type"};
byList = d||u;
DGEsum = Data Table( "summary of DGE" );
enrich=DGEsum<<CONTINGENCY></CONTINGENCY>