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Trama 3D de estructura cristalina

¿Alguien ha hecho esto? ¿Hay algún ejemplo?

Me gustaría utilizar las capacidades de trazado 3D de JMP para comprender la ubicación de los átomos en una red cristalina, para trazar algunos planos cristalográficos, etc.

GráficosRe: trama 3D de estructura cristalina

Hmm, no creo que esto sea fácil de hacer. Los nudos (también conocidos como moléculas) podrían representarse mediante puntos, usando el color por columna (para el elemento). Sin embargo, la parte difícil sería la conexión correcta y los posibles brazos libres. 

 

Me alegraría si alguien conoce una solución o ya la ha implementado, me encantaría ver que esto funcione. 

my2cents

Re: trama 3D de estructura cristalinaSi tiene las coordenadas de la celda unitaria, podría trazarla en Scatterplot 3D. Sin embargo, tendría que hacer las traducciones usted mismo para desarrollar la celda unitaria a partir del conjunto de bases que obtiene en los archivos CIF. Colorear los átomos debería ser bastante fácil en Scatterplot 3D

mejor,

METRORe: trama 3D de estructura cristalina

Si está pensando en escribir su propio JSL utilizando 3D SceneBox, Video de la tercera rama 4K podría darle algunas ideas sobre lo que es factible. Consulte también los ejemplos en el directorio sampledata / scene3d.

Además, verifique Graph3DBox en el índice de secuencias de comandos. No hace mucho más que el ejemplo, pero tampoco requiere aprender comandos de OpenGL.

Graph3DBox in scripting indexGraph3DBox en el índice de secuencias de comandos

Re: trama 3D de estructura cristalina

Gracias Craig. @Craige_Hales . Me perdí esto. 

Re: trama 3D de estructura cristalina

Gracias Craige !

• ¿Parece que este video se puede hacer con JSL?

https://www.youtube.com/watch?v=KKr91v7yLcM

Re: trama 3D de estructura cristalina

las partes del guisante verde deben ser sencillas; las sombras no son algo que el uso de OpenGL por parte de JMP hace excepto por trucos, como Modelo de araña 3D animado  

@Paul_Nelson 

Re: trama 3D de estructura cristalina

@Craige_Hales desafortunadamente no pude descubrir cómo hacer formas simples como esferas, planos y líneas en la escena.

El Vector en el ejemplo es muy impresionante, pero también necesito formas simples. El comando Mostrar propiedades solo ofrece tres posibilidades para agregar marcadores, elipsoides y vectores.

La plataforma es experimental, entonces, ¿me recomendarías hacer escenas con muchas esferas, algunos planos y líneas en OpenGL o hay alguna forma de hacerlo en Graph 3D Box? ¡Gracias!

 

 

 

  Add Markers [Action] [Scripting Only] (Draws n markers on the plot.)
  Add Ellipsoid [Action] [Scripting Only] (Draws an ellipsoid on the plot.)
  Add Vector [Action] [Scripting Only] (Draws a vector or arrow on the plot.)

Re: trama 3D de estructura cristalina

¡Buen uso de las propiedades de show para descubrir el conjunto limitado de capacidades en el cuadro Graph3D! Si necesita un dibujo general, tendrá que ir con el código OpenGL de SceneBox. 

 

@Paul_Nelson