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Trama 3D della struttura cristallina

Qualcuno ha fatto questo, c'è qualche esempio?

Vorrei usare le capacità di disegno 3D di JMP per comprendere la posizione degli atomi in un reticolo cristallino, per tracciare alcuni piani cristallografici ecc.

GraficaRi: trama 3D della struttura cristallina

Hmm, non penso che sia facile da fare. I nodi (noti anche come molecole) potrebbero essere rappresentati da punti, usando il colore per colonna (per l'elemento). Tuttavia la parte difficile sarebbe la connessione corretta e le possibili braccia libere. 

 

Sarei felice se qualcuno conoscesse una soluzione o ne avesse già implementata una, mi piacerebbe vederla funzionare. 

my2cents

Ri: trama 3D della struttura cristallinaSe hai le coordinate della cella unitaria, puoi semplicemente tracciarla in Scatterplot 3D. Tuttavia, dovresti fare tu le traduzioni per arricchire la cellula unitaria dal set di base che ottieni nei file CIF. Colorare gli atomi dovrebbe essere abbastanza facile in Scatterplot 3D

migliore,

MRi: trama 3D della struttura cristallina

Se stai pensando di scrivere la tua JSL usando 3D SceneBox, Video 4K di Third Branch potrebbe darti alcune idee su ciò che è fattibile. Guarda anche gli esempi nella directory sampledata / scene3d.

Inoltre, controlla Graph3DBox nell'indice di scripting. Non fa molto di più dell'esempio, ma non richiede nemmeno l'apprendimento dei comandi OpenGL.

Graph3DBox in scripting indexGraph3DBox nell'indice di scripting

Ri: trama 3D della struttura cristallina

Grazie Craig, @Craige_Hales . Mi è mancato questo. 

Ri: trama 3D della struttura cristallina

Grazie Craige !

• Sembra che questo video possa essere realizzato con JSL?

https://www.youtube.com/watch?v=KKr91v7yLcM

Ri: trama 3D della struttura cristallina

le parti del pisello dovrebbero essere diritte; le ombre non sono qualcosa che JMP usa OpenGL se non per inganno, come Modello animato di ragno 3D  

@Paul_Nelson 

Ri: trama 3D della struttura cristallina

@Craige_Hales sfortunatamente non sono riuscito a capire come realizzare forme semplici come Sfere, piani e linee nella scena.

Il vettore nell'esempio è molto impressionante, ma ho bisogno anche di forme semplici. Il comando Mostra proprietà offre solo tre possibilità per aggiungere marcatori, ellissoidi e vettori.

La piattaforma è sperimentale, quindi mi consiglieresti di fare scene con molte sfere, alcuni piani e linee in OpenGL o c'è un modo per farlo in Graph 3D Box? Grazie!

 

 

 

  Add Markers [Action] [Scripting Only] (Draws n markers on the plot.)
  Add Ellipsoid [Action] [Scripting Only] (Draws an ellipsoid on the plot.)
  Add Vector [Action] [Scripting Only] (Draws a vector or arrow on the plot.)

Ri: trama 3D della struttura cristallina

Buon uso delle proprietà dello spettacolo per scoprire l'insieme limitato di funzionalità nella casella Graph3D! Se hai bisogno di un disegno generale, dovrai andare con il codice OpenGL di SceneBox. 

 

@Paul_Nelson