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ricreare la mappa dei colori dal clustering gerarchico nel generatore di grafici

Gentile comunità JMP

L'opzione cluster a due vie nel cluster gerarchico fornisce una mappa dei colori davvero eccezionale che ridimensiona ogni colonna individualmente, in modo tale che se ho una colonna con valori elevati non oscura il resto delle colonne. Considerando che se provo a creare il grafico nel generatore di grafici, ad esempio come mappa di calore, le variabili si ridimensionano insieme e perdo molti dati, poiché vengono visualizzati solo i casi estremi. Il problema è che il cluster gerarchico fa confusione con il mio ordine di etichette.

Quindi, come posso ricreare una mappa dei colori che mantenga lo stesso ordine di etichetta della mia tabella di dati ma abbia la caratteristica unica di ridimensionare individualmente ciascuna variabile?

Grazie!

GraficaOggetto: ricreare la mappa dei colori dal clustering gerarchico nel generatore di grafici

Ci scusiamo per il ritardo nella risposta.Sono nuovo nel forum.Sono d'accordo con gli altri sul fatto che puoi farlo bene in Graphs>Cell plot , per creare una heatmap personalizzabile con controllo sul ridimensionamento.Tuttavia, ho alcuni semplici suggerimenti.Innanzitutto, rappresenta i tuoi dati come una matrice con la variabile su cui vuoi controllare la scala come colonne e l'altra variabile nella dimensione X. Quando scegli Cell plot under graph, posiziona tutte le variabili di colonna nella casella Y, risposta, quindi seleziona l'intestazione di una colonna che contiene le altre variabili (righe) elencate e posizionala nella casella che dice "etichetta" (non X) .Assicurati di deselezionare la casella sottostante che dice scala uniforme.Ora tutte le tue categorie Y sono ridimensionate indipendentemente l'una dall'altra.Se fai clic sul triangolo rosso capovolto puoi selezionare "legenda" e tirare su la scala per ogni singola colonna. Se hai ancora problemi all'interno di una singola colonna, poiché un valore anomalo è il colore che sbiadisce gli altri valori, probabilmente dovresti tracciare i punteggi Z come accennato in una risposta precedente.Tuttavia, anche in questo caso puoi ancora perdere colore.In genere, ciò che le persone fanno è impostare un limite per i valori superiore e inferiore consentiti e, per il caso dei valori Z, di solito impostiamo tale limite a Z = -3 e +3 in modo che tutti i valori rientrino nel mezzo.Assicurati solo che la tua legenda indichi che un valore può essere maggiore o uguale (o minore o uguale) ai limiti scelti.Puoi facilmente trasformare i tuoi valori in excel con la formula = mediana (-X, valore cella, Y) dove X e Y sono i limiti inferiore e superiore consentiti. In allegato è riportato un esempio di una delle mie mappe di calore realizzata in questo modo. Le scale sembrano tutte uguali perché ho impostato i limiti superiore e inferiore a 3, -3. Se ogni valore Y ha gli stessi limiti superiore e inferiore, allora potresti anche selezionare la casella della scala in modo uniforme. Ma ancora una volta puoi impostare i limiti superiore e inferiore desiderati per ciascuna colonna.Basta trasformare i dati in Excel per farlo manualmente prima di tracciare. Inoltre puoi fare clic con il tasto destro sulla mappa termica per eliminare le linee di confine tra celle o quadrati.Spero che aiuti.

Mitch

 

Oggetto: ricreare la mappa dei colori dal clustering gerarchico nel generatore di grafici

CIAO @ezorlo ,

È difficile dirlo con certezza dalle tue visualizzazioni, ma sembra che i tuoi dati potrebbero essere nel formato "impilato" in base all'output della mappa di calore che hai fornito. Sarebbe utile vedere una tabella di esempio per vedere come sono organizzati i tuoi dati poiché il clustering può essere eseguito con dati "impilati" (alti) o "come al solito" (larghi) ... ma ci proverò .  

 

La "mappa dei colori" che vuoi produrre può essere eseguita utilizzando la piattaforma Graph->Cell Plot, tuttavia, i tuoi dati dovrebbero essere nel formato "wide". Se la mia ipotesi è corretta e i tuoi dati sono impilati, utilizza l'utilità Tabelle-> Dividi per riorganizzare i tuoi dati inserendo "sviluppo" nel ruolo Dividi per, "Dati" nel ruolo Dividi colonne e "Etichetta" nel gruppo ruolo (ho basato questi ruoli sull'output della mappa di calore che hai fornito). Potrebbe essere necessario ricorrere alla tabella risultante in modo che corrisponda all'ordine desiderato.

 

Ora usa la piattaforma Graph->Cell Plot sulla nuova tabella: posiziona le nuove colonne di dati (none, young, ecc.) nel ruolo Y, Response e "Label" nel ruolo Label. Questo dovrebbe generare il diagramma di celle che stai cercando.

 

Ancora una volta, se questo non funziona per te, potrebbe essere necessario fornire ulteriori informazioni (preferibilmente alcuni dati di esempio).

-Jerry

Oggetto: ricreare la mappa dei colori dal clustering gerarchico nel generatore di grafici

Hai provato ad attivare la proprietà Row Order nella colonna con le tue etichette?

 

Oggetto: ricreare la mappa dei colori dal clustering gerarchico nel generatore di graficiCIAO,
Non sono sicuro di aver ragione, ma sembra che i dati del clustering bidirezionale siano stati standardizzati dalle colonne (opzione standard per il clustering gerarchico) mentre la mappa termica ricreata utilizza la scala originale.
In tal caso, è possibile standardizzare facilmente i dati selezionando le colonne dei dati > fare clic con il pulsante destro del mouse sull'intestazione > selezionare Nuova colonna formula > Distribuzione > Standardizzata. Quindi, utilizza la colonna standardizzata come variabile Color nella mappa di calore.
Spero possa essere d'aiuto.
Migliore,
ST