分析工具嗨！
我對JMP和統計資料都是陌生的，希望對分析某些數據有幫助（請參閱附件）。
我是一名微生物學家，在每個發酵罐的2個不同載玻片上，對4種不同發酵產生的細菌進行了染色。染色導致細胞結構變色，我在每個載玻片上拍攝了兩張照片。我現在想知道：
1）如果照片上染色的細胞結構量的差異取決於發酵罐（A / B / C / D）或僅取決於載玻片。
2）如果發酵罐之間的染色結構總量差異顯著。
如何在JMP中執行此操作？我非常感謝您的幫助！
最好的祝福，
烏利卡
分析工具回复：分析我只需要說這種進行研究然後考慮進行分析的常見做法是有風險的。這是倒退。確保來自研究的數據將支持分析的唯一方法是從考慮分析開始！
圖片是最低級別的試點 ”，因此請勿直接進入分析。它們將用於估計在任何假設檢驗中使用的實驗誤差。幻燈片是實驗單元的下一個級別，並以“ 隨機效應 。”因此，實際上您有一個具有四個級別的分類發酵罐，另一個（嵌套的）分類因子Slide具有兩個級別。我假設這是僅有的四個發酵罐，所以您想了解固定效果（例如，發酵罐A的響應是否高於其他發酵罐）。通過“方差的雙向分析”可以輕鬆處理這種情況。
我只是看了你的數據表。似乎是從電子表格導入的，可能是因為缺少了在設計JMP實驗時由JMP創建的預期列屬性。而且，排序消除了檢查誤差的獨立性以驗證回歸模型假設的可能性。排序還引出了您如何實際運行研究的問題：它是完全隨機的還是某些因素發生的變化更少？這個答案在分析中有很大的不同。
這是這種模型的結果：
發酵罐或載玻片之間似乎沒有顯著差異。我為“擬合模型”對話框和“擬合最小二乘”平台附加了修改後的數據表和保存的腳本。
回复：分析加到 @markbailey 的絕佳建議，以下是一些需要考慮的事項：
1。響應變量（彩色結構）的多少變化具有實際意義？您關心或具有科學意義的最小變化增量是多少？
2。圖片可以被認為是測量系統的組成部分。 圖片如何處理？如何從圖片中量化響應？
3。 這是數據集的變異圖：
如您所見，有很多可變性幻燈片內 s 4和8（此測量錯誤嗎？）。 這最終將對任何定量分析產生重大影響。 這也可能使檢測發酵罐之間的差異變得困難。
回复：分析非常感謝 @markbailey 您的幫助！您確實讓我以另一種方式查看了我的數據。圖片中彩色結構的計數是手動執行的，但是圖片由我的同事編碼以避免任何偏差。從一種發酵物中同時對兩張載玻片進行染色，從而產生不同的載玻片。然後對另外兩個載玻片進行染色，但對另一個發酵液進行染色等等。是的，數據是從Excel工作表導入的。
我將調查您在這裡寫的內容，並閱讀更多有關統計的信息。再次感謝您的幫助！
最好的祝福，
烏利卡
回复：分析非常感謝 @statman 供您輸入！
我不確定h 因為響應變量的大部分變化都具有實際意義。我希望看到發酵罐之間的差異比我獲得的:)大。謝謝你的情節！更清楚地表明，我可能無法看到該實驗的任何區別。
最好的祝福，
烏利卡
