分析こんにちは！
私はJMPと統計の両方に完全に慣れていないので、いくつかのデータを分析するのを手伝ってください（添付ファイルを参照）。
私は微生物学者として働いており、発酵槽ごとに2つの異なるスライドガラスで4つの異なる発酵から細菌を染色しました。染色により色のついた細胞構造が得られますが、スライドガラスごとに2枚の写真を撮りました。私は今知りたい：
1）写真の染色された細胞構造の量の違いが発酵槽（A / B / C / D）に依存しているか、単にスライドガラスに依存している場合。
2）発酵槽間で染色された構造物の総量の差が大きい場合。
JMPでこれを行うにはどうすればよいですか？助けてくれてとても感謝しています！
宜しくお願いします、
ウルリカ
分析Re：アナリティクス研究を実施し、分析を検討するというこの一般的な慣行は危険であると私は言わなければなりません。逆です。スタディからのデータが分析をサポートすることを確認する唯一の方法は、分析を念頭に置いて開始することです！
写真は最低レベルです ' 実験ユニット 'したがって、分析に直接入力しないでください。それらは、仮説検定で使用される実験誤差を推定するために使用されます。スライドは実験ユニットの次のレベルであり、モデルとして「 ランダム効果 」したがって、実際には、4つのレベルを持つ1つのカテゴリカル発酵槽と2つのレベルを持つ別の（ネストされた）カテゴリカル因子Slideがあります。これらは4つだけの発酵槽であると思いますので、固定効果について知りたいと思います（たとえば、発酵槽Aの応答は他のものよりも高い）。この状況は「二元配置分散分析」によって簡単に処理できます。
私はあなたのデータテーブルを見ただけです。スプレッドシートからインポートされたようです。JMPを使用して実験を設計するときにJMPによって作成された期待される列のプロパティが欠落している可能性があります。また、ソートにより、エラーの独立性をチェックして回帰モデルの仮定を検証する可能性がなくなりました。並べ替えは、実際に調査をどのように実行したかという疑問も引き起こします。完全に無作為化されているのか、それとも一部の要素の変更頻度が少ないのか。その答えは、分析に大きな違いをもたらします。
このようなモデルの結果は次のとおりです。
発酵槽とスライドの間に大きな違いはないようです。変更されたデータテーブルを添付し、[モデルのフィット]ダイアログと[最小二乗法]プラットフォームのスクリプトを保存しました。
Re：アナリティクスに追加 @ markbailey＃@ markbailey＃ の優れたアドバイスです。ここで、いくつかの考慮事項があります。
1。応答変数（色付きの構造）の変更はどれほど実際に重要ですか？あなたが気にかける、または科学的に興味のある変化の最小の増分は何ですか？
2。写真は、測定システムのコンポーネントと見なすことができます。 写真で何が行われますか？応答は写真からどのように定量化されますか？
3。 データセットの変動性プロットは次のとおりです。
ご覧のとおり、かなりの変動があります。スライド内 ■4および8（この測定エラーですか？）。 これは最終的に、定量分析に大きな影響を与えます。 これはまた、発酵槽ごとの変動を検出することを困難にする可能性があります。
Re：アナリティクスどうもありがとうございます @ markbailey＃@ markbailey＃ あなたの助けに！あなたは本当に私のデータを別の方法で見させました。写真から色付きの構造を数えることは手動で行われましたが、写真は偏見を避けるために私の同僚によってコード化されました。異なるスライドになる染色は、1つの発酵液から同時に2つのスライドで実行されました。次に、さらに2枚のスライドの染色を行いましたが、別の発酵液については同様です。はい、データはExcelシートからインポートされました。
ここであなたが書いたものを調べ、統計についてもう少し読みます。助けてくれてありがとう！
宜しくお願いします、
ウルリカ
Re：アナリティクスどうもありがとうございます @statman あなたの入力のために！
わからない応答変数の変化の多くは、実際に重要です。私は得たものよりも発酵槽間の大きな違いを見たいと思います:) 素敵なプロットをありがとう！これにより、この実験との違いを確認できない可能性が高くなります。
宜しくお願いします、
ウルリカ
