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Ciao!

 

Sono completamente nuovo sia per JMP che per le statistiche e vorrei un po 'di aiuto con l'analisi di alcuni dati (vedi file allegato).

 

Lavoro come microbiologo e ho batteri colorati da 4 fermentazioni diverse su 2 vetrini diversi per ciascun fermentatore. Le colorazioni danno luogo a strutture cellulari colorate, di cui ho scattato due foto per vetrino. Ora vorrei sapere:

 

1) Se le differenze nelle quantità di strutture cellulari colorate sulle foto dipendono dal fermentatore (A / B / C / D) o semplicemente dal vetrino.

2) Se le differenze nella quantità totale di strutture colorate tra i fermentatori sono significative.

 

Come posso farlo in JMP? Sono molto grato per qualsiasi aiuto!

 

I migliori saluti,

Ulrika

analiticaRi: Analisi

Devo solo dire che questa pratica comune di eseguire lo studio e quindi considerare l'analisi è rischiosa. È al contrario. L'unico modo per essere sicuri che i dati provenienti dallo studio supporteranno l'analisi è iniziare con l'analisi in mente!

 

Le immagini sono al livello più basso " unità sperimentale 'e quindi non entrare direttamente nell'analisi. Saranno utilizzati per stimare l'errore sperimentale utilizzato in qualsiasi test di ipotesi. Le diapositive rappresentano il livello successivo di unità sperimentale e inseriscono il modello come " effetto casuale .' Quindi davvero hai un fermentatore categorico con quattro livelli e un altro fattore categorico (nidificato) Slide con due livelli. Presumo che questi siano gli unici quattro fermentatori, quindi si desidera conoscere gli effetti fissi (ad esempio, la risposta del fermentatore A è superiore rispetto agli altri). Questa situazione è facilmente gestita da un'analisi bidirezionale della varianza.

 

Ho appena guardato la tua tabella dei dati. Sembra che sia stato importato da un foglio di calcolo forse perché mancano le proprietà della colonna previste create da JMP durante la progettazione dell'esperimento con JMP. Inoltre, l'ordinamento ha eliminato la possibilità di verificare l'indipendenza degli errori per verificare l'assunzione del modello di regressione. L'ordinamento pone anche la domanda su come è stato effettivamente condotto lo studio: è completamente randomizzato o alcuni fattori sono stati cambiati meno spesso? Questa risposta fa un'enorme differenza nell'analisi.

 

Ecco il risultato di un tale modello:

 

 

Non sembra esserci una differenza significativa tra i fermentatori o le diapositive. Ho allegato la tabella dei dati modificata e lo script salvato per la finestra di dialogo Adatta modello e la piattaforma Adatta i minimi quadrati.

Ri: Analisi

Aggiunta a @markbailey Ottimo consiglio, ecco alcune cose a cui pensare:

1. Quanto di un cambiamento nella variabile di risposta (Strutture colorate) ha un significato pratico? Qual è l'incremento più piccolo di cambiamento a cui tieni o di interesse scientifico?

2. Le immagini possono essere considerate componenti del sistema di misurazione.  Cosa si fa con le immagini? Come viene quantificata la risposta dalle immagini?

3.  Ecco un diagramma di variabilità per il set di dati:

 Come puoi vedere c'è molta variabilità all'interno della diapositiva s 4 e 8 (questo errore di misurazione?).  Questo alla fine avrà un grande impatto su qualsiasi analisi quantitativa.  Ciò renderà probabilmente difficile rilevare la variabilità da fermentatore a fermentatore.

Ri: Analisi

Grazie mille @markbailey per il tuo aiuto! Mi hai fatto davvero guardare i miei dati in un modo diverso. Il conteggio delle strutture colorate delle immagini è stato eseguito manualmente, ma le immagini sono state codificate dal mio collega per evitare distorsioni. La colorazione, risultante nelle diverse diapositive, è stata eseguita su due diapositive contemporaneamente da una fermentata. Quindi è stata eseguita la colorazione di altre due diapositive, ma per un'altra fermentata e così via. Sì, i dati sono stati importati da un foglio Excel.

 

Esaminerò ciò che hai scritto qui e leggerò anche un po 'di più sulle statistiche. Grazie ancora per l'aiuto!

 

I migliori saluti,

Ulrika

Ri: Analisi

Grazie mille @statman per il tuo contributo!

 

Non sono sicuro h il fatto che un cambiamento nella variabile di risposta abbia un significato pratico. Preferirei vedere differenze maggiori tra i fermentatori rispetto a quello che ho ottenuto . Grazie per la bella trama! È più chiaro che probabilmente non sarò in grado di vedere alcuna differenza da questo esperimento.

 

I migliori saluti,

Ulrika