带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板我已使用您的文件并为 MSD 96 孔多重板创建了图谱文件,每孔有 10 个点。 我已将 10 个点命名为“1”至“10”,并将整个井命名为“11”,所有这些都在零件 ID 列中。 形状 ID 仍然是使用 LetterNumber 符号的 96 个孔。这看起来很棒,但是当我使用它时,指定“地图角色”,我只对整个孔进行着色,而不是每个孔中的各个点。如何在地图角色中访问形状文件的零件 ID 部分?
谢谢,
马丁
@马克贝利
回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板对,那是正确的。 有一列使用与用于定义名称和 XY 文件的名称相同的名称。 您可以基于串联制定一个易于使用的方案。 对您来说很方便(Well 和 Spot),对 JMP 来说也很方便(位置)。 例如:
Capture.JPG
因此,位置值是名称和 XY 形状文件中使用的名称。 但该计划完全取决于您。 我试图使我的原始方案尽可能简单明了,因为我打算在 JMP 社区中发布它。
回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板如果我理解你@马克贝利, 96 个孔中的每个孔中的 10 个点都将获得自己的形状 ID(总共 960 个)。 这意味着我需要在名称文件中为每个形状指定一个唯一的名称。 通常,我的分析有两列:一列代表“Well”,例如 B5 或 H10,一列代表“spot”,例如 1 或 8。 我想我需要在分析表中创建一个使用井/点标识符的新列,并且我可以与地图名称文件第二列相匹配。 那是对的吗? 或者,有没有办法让地图名称文件中的两列代表 Well 和 Spot,可以在我的分析表中的地图角色中使用?回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板是的,就是这个想法。 但你没有不连续的区域。 零件 ID 始终为 1。
与单个响应相对应的形状是孔中的一个点。 每种形状大概只有一个部分。 这种一对一的映射与我用于原始板孔的映射相同。
回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板好的。 那么Part ID有什么用呢? 仅适用于不相邻的地区,例如美国,美国大陆、夏威夷和阿拉斯加都属于同一个国家?
那么形状 ID 代表国家/地区,而零件 ID 只是不连续的区域?
谢谢您的帮助。回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板我道歉。 我犯了一个错误。 响应值与形状的映射是关键。 因此,您不应该对每个点都使用零件特征。 每个点都应该有自己的形状。 然后映射就可以工作了。
回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板因此,数据表中引用的形状基于名称文件中的第二列,对吗?这是我的姓名文件中的一个片段:
Martin_0-1590164395266.png
但我所做的是为 XY 文件中的每个形状 ID 添加 10 个额外的零件 ID(96 个孔中的每个点一个)。因此,对于 XY 文件中的每个形状 ID,我有 11 个零件 ID(10 个用于点,1 个用于外圆)。我的最终图表如下所示:
Martin_1-1590164672420.png
为了使用单个点,而不是外部 96 个孔,我们如何使用孔号和点号的组合?我以为它有不同的零件 ID,但似乎无法使用它们。
回复:带有斑点图文件的多重 MSD 96 孔板图形生成器使用形状文件来渲染具有几何解释的数据。 形状由两个 JMP 数据表(名称和 XY)定义。 JMP 发布了这些文件所需格式的规范。 JMP 安装了多对地理实体的形状文件。 但您可以为任何自定义几何图形制作自己的形状文件。 您只需要遵循规范,它应该可以正常工作。
我使用该规范制作了标准 96 孔板的形状文件。 该规范提供了使每个形状由多个部分组成的方法。 因此,您可以制作自己的形状文件,每个形状(板孔)有 10 个部分(点)来显示嵌套数据。
回复:多路复用 MSD 96 孔板及斑点图文件根据您的描述,您的形状文件似乎设置正确,每个孔包含 10 个单独的部分(点),分别标记为 1-10,并且整个孔在“部分 ID”列中标记为“11”。您面临的问题是,当您将“孔”指定为“映射角色”时,JMP 只会识别整个孔,而不会识别其中的单个点。发生这种情况的原因是,JMP 使用“映射角色”中的值来匹配形状文件中“名称”列中的内容,而不是“部分 ID”列中的内容。
要可视化每个96 孔板模板中的单个点,您需要确保每个点(即孔内的每个部分)都有一个唯一的标识符,该标识符将孔和点的信息以与您的数据表一致的格式组合在一起。例如,您可以将孔的位置(如 A1、B1 等)与点编号连接起来,例如“A1_1”、“A1_2”等,并在形状文件和数据表的“名称”列中使用该组合值。然后,在图形生成器中,您可以将该组合值指定为“地图角色”,JMP 将单独匹配每个点。
我在制作细胞因子面板时也遇到过类似的情况,需要在96孔板模板上显示每个点的信号强度,而使用这种命名策略效果非常好。如果您需要一个直观的起点或灵感,这个网站提供了各种模板,帮助我仔细检查布局逻辑。
回复:多重 MSD 96 孔板及斑点图文件关键在于,“映射角色”需要引用标识各个形状部分的字段,而不仅仅是父井。由于您的形状文件在“部件 ID”列中包含 10 个点 ID 以及整个井的 ID,因此仅按井进行映射自然会将完整的 96 孔形状视为单个对象。
我会在数据表中将井号和点号分开,创建一个唯一的映射键来组合这两个值,然后在形状定义和映射角色中始终使用同一个键。这样,JMP 就能区分 A01-1 和 A01-2 之类的井号,同时保留 A01 作为父井。
这种结构化的孔板映射方法也便于在将坐标和布局导入 JMP 之前进行验证。96 孔板模板( https://96wellplatetemplate.com )可用于检查标准的 A-H 和 1-12 孔排列以及自定义点结构,尤其是在验证多重孔布局时。
重要的是要确保 Map Role 使用的值与各个形状标识符相对应,而不仅仅是代表 96 口井的形状 ID。