스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트귀하의 파일을 사용하여 웰당 10개의 스팟이 있는 MSD 96 웰 멀티플렉스 플레이트에 대한 맵 파일을 만들었습니다. 부품 ID 열에 10개 지점의 이름을 "1"부터 "10"까지, 우물 전체의 이름을 "11"로 지정했습니다. Shape ID는 여전히 LetterNumber 표기법을 사용하는 96개 웰입니다.이것은 훌륭해 보이지만 이것을 사용하려고 할 때 맵 역할의 경우 각 웰 내의 개별 지점이 아닌 전체 웰에만 색상을 지정합니다.맵 역할에서 모양 파일의 부품 ID 부분에 어떻게 액세스합니까?
감사해요,
남자 이름
@마크_베일리
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트네, 맞습니다. 이름 및 XY 파일을 정의하는 데 사용된 것과 동일한 이름을 사용하는 열이 하나 있습니다. 연결을 기반으로 사용하기 쉬운 구성표를 만들 수 있습니다. 사용자에게는 쉽고(Well and Spot), JMP(위치)에는 쉽습니다. 예를 들어:
Capture.JPG
따라서 위치 값은 이름 및 XY 모양 파일에 사용된 이름입니다. 그러나 계획은 전적으로 귀하에게 달려 있습니다. JMP 커뮤니티에 공개하려고 했기 때문에 원래 계획을 최대한 간단하고 쉽게 만들려고 노력했습니다.
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트내가 당신을 이해한다면 @마크_베일리 , 96개의 우물 각각에 있는 10개의 지점은 각각 고유한 모양 ID(총 960개)를 갖게 됩니다. 이는 이름 파일에서 각 모양에 고유한 이름을 지정해야 함을 의미합니다. 일반적으로 내 분석에는 두 개의 열이 있습니다. 하나는 Well(예: B5 또는 H10)에 대한 것이고 다른 하나는 Spot(예: 1 또는 8)에 대한 것입니다. Well/Spot 식별자를 사용하는 분석 테이블에 새 열을 만들어야 하고 지도 이름 파일의 두 번째 열과 일치시킬 수 있을 것 같습니다. 그 맞습니까? 아니면 분석 테이블의 맵 역할에 사용할 수 있는 Well과 Spot을 나타내는 맵 이름 파일에 두 개의 열을 포함할 수 있는 방법이 있습니까?Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트예, 그게 바로 아이디어입니다. 그러나 인접하지 않은 영역은 없습니다. 부품 ID는 항상 1입니다.
단일 응답에 해당하는 모양은 우물의 한 지점입니다. 각 모양에는 아마도 단 하나의 부분만 있을 것입니다. 이 일대일 매핑은 원본 플레이트 웰에 사용한 것과 동일합니다.
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트좋아요. 이때 사용되는 부품 ID는 무엇입니까? 비연속 지역(예: 미국 본토, 하와이 및 알래스카가 모두 같은 국가의 일부인 미국)에만 해당됩니까?
그렇다면 Shape ID는 국가를 나타내고 부품 ID는 단지 비연속 영역이 될까요?
도와 주셔서 감사합니다.Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트사과드립니다. 제가 실수를. 모양에 대한 응답 값의 매핑이 핵심입니다. 따라서 각 지점마다 부품 기능을 사용해서는 안됩니다. 각 지점은 고유한 모양이어야 합니다. 그러면 매핑이 작동합니다.
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트따라서 데이터 테이블에서 참조되는 모양은 이름 파일의 두 번째 열을 기반으로 합니다. 그렇죠?이것은 내 이름 파일의 클립입니다.
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하지만 제가 한 일은 XY 파일의 각 모양 ID에 대해 10개의 추가 부품 ID(96개 웰의 각 지점에 하나씩)를 추가한 것입니다.따라서 XY 파일의 각 모양 ID에 대해 11개의 부품 ID(스폿용 10개, 외부 원용 1개)가 있습니다.내 최종 그래프는 다음과 같습니다.
Martin_1-1590164672420.png
외부 96개 Well 대신 개별 Spot을 사용하려면 Well Number와 Spot Number의 조합을 어떻게 사용합니까?다른 부품 ID를 사용하는 줄 알았는데 사용할 수 없는 것 같습니다.
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트그래프 빌더는 모양 파일을 사용하여 기하학적 해석으로 데이터를 렌더링합니다. 모양은 두 개의 JMP 데이터 테이블(이름 및 XY)로 정의됩니다. JMP는 이러한 파일의 필수 형식에 대한 사양을 게시했습니다. JMP는 지리적 개체에 대한 여러 쌍의 모양 파일과 함께 설치됩니다. 그러나 사용자 정의 형상에 대해 자신만의 모양 파일을 만들 수 있습니다. 사양을 따르기만 하면 문제 없이 작동할 것입니다.
나는 이 사양을 사용하여 표준 96웰 플레이트용 모양 파일을 만들었습니다. 사양은 각 모양이 두 개 이상의 부품으로 구성되는 수단을 제공합니다. 따라서 중첩된 데이터를 표시하기 위해 모양(플레이트 웰)당 10개의 부품(스팟)으로 구성된 자신만의 모양 파일을 만들 수 있습니다.
Re: 스팟 맵 파일이 포함된 멀티플렉스 MSD 96 웰 플레이트설명하신 내용을 보면, 셰이프 파일이 웰당 10개의 개별 부분(스팟)으로 구성되어 있고, 각 웰에는 1~10까지 레이블이 지정되어 있으며, 파트 ID 열에는 웰 전체가 "11"로 레이블이 지정되어 있는 것으로 보입니다. 그런데 문제는 맵 역할로 "웰"을 할당하면 JMP가 웰 전체만 인식하고 웰 내의 개별 스팟은 인식하지 못한다는 것입니다. 이는 JMP가 맵 역할의 값을 사용하여 셰이프 파일의 이름 열에 있는 값과 일치시키기 때문에 발생하는 문제이며, 파트 ID 열과는 관련이 없습니다.
각 96웰 플레이트 템플릿 내의 개별 스팟을 시각화하려면 각 스팟(즉, 웰 내의 각 부분)에 데이터 표와 일치하는 형식으로 웰 정보와 스팟 정보를 결합하는 고유 식별자가 있는지 확인해야 합니다. 예를 들어, 웰 위치(예: A1, B1 등)와 스팟 번호(예: "A1_1", "A1_2" 등)를 연결하고, 이 결합된 값을 셰이프 파일의 이름 열과 데이터 표 모두에 사용할 수 있습니다. 그런 다음 Graph Builder에서 이 결합된 값을 맵 역할로 지정하면 JMP가 각 스팟을 개별적으로 매칭합니다.
96웰 플레이트 템플릿 에 각 지점별 신호 강도를 표시해야 하는 사이토카인 패널에서 비슷한 상황을 겪었는데, 이 명명 전략이 완벽하게 작동했습니다. 시각적인 시작점이나 영감이 필요하다면 이 사이트에서 레이아웃 로직을 다시 확인하는 데 도움이 되는 다양한 템플릿을 찾을 수 있습니다.
제목: 멀티플렉스 MSD 96웰 플레이트(스팟 맵 파일 포함) 관련핵심은 맵 역할이 상위 유정뿐만 아니라 개별 형상 부분을 식별하는 필드를 참조해야 한다는 것입니다. 형상 파일의 'Part ID' 열에 10개의 스팟 ID와 전체 유정 ID가 포함되어 있으므로, 유정별로만 매핑하면 96개 유정으로 구성된 전체 형상이 하나의 객체로 처리됩니다.
데이터 테이블에서 유정 및 지점 식별자를 분리하고 두 값을 결합하는 고유 매핑 키를 생성한 다음, 해당 키를 형상 정의 및 맵 역할에서 일관되게 사용하는 것이 좋습니다. 이렇게 하면 JMP가 A01-1과 A01-2를 구분하면서 A01을 상위 유정으로 유지할 수 있습니다.
이러한 구조화된 플레이트 매핑 방식을 사용하면 JMP로 가져오기 전에 좌표와 레이아웃을 더 쉽게 확인할 수 있습니다. 특히 멀티플렉스 레이아웃을 검증할 때, 96웰 플레이트 템플릿( https://96wellplatetemplate.com )을 활용하면 표준 A-H 및 1-12웰 배열과 사용자 지정 스팟 구조를 함께 확인할 수 있습니다.
중요한 것은 Map Role에서 사용하는 값이 96개의 유정을 나타내는 Shape ID뿐만 아니라 개별 형상 식별자와 일치하는지 확인하는 것입니다.
