korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenIch habe vor einigen Wochen an einem interessanten Webinar von Jian Cao über die Verwendung der gemischten Modellplattform teilgenommen, bei dem ich erfahren habe, dass Sie unter MANOVA keine ANOVA-Designs mit wiederholten Messungen einrichten müssen. Dies eröffnet mehr Flexibilität, deshalb wollte ich es versuchen. Ich habe eine Reihe von Korallen ("Pucks" in der angehängten Datendatei), die im Laufe der Zeit wiederholt (als Farbe) gemessen wurden, und ich war daran interessiert, die festen Auswirkungen der Behandlung (zwei Temperaturen), Genotyp (5-6 Genotypen) zu testen ), Uhrzeit (Kalenderdaten) und deren Interaktion. Ich weiß, wie das unter der MANOVA-Plattform gemacht wird, aber wenn ich die beiden festen Effekte zur gemischten Modellplattform hinzufüge, dann "Datum" als wiederholte Maßnahme, passiert eines von zwei Dingen. Entweder gibt es NUR die Ausgabe der festen Effekte aus (dh NICHT den Effekt der Zeit), oder wenn ich auch "Datum" als festen Faktor einbeziehe, führt es zum Absturz, möglicherweise weil die Software "Datum" in sieht zwei Orte. Was Jian offensichtlich getan hat, war, JMP auszutricksen, indem er in seinem Beispiel "Date" etwas anderes nannte. Ich denke, er hatte "Zeit" (Datum x Uhrzeit) als wiederholtes Maß und dann "Datum" (= nur Datum) als festen Faktor. Sicherlich muss ich nicht jedes Mal eine solche Dummy-Variable neu codieren?! Ich denke, ich könnte "Datum" in "Versuchstag" umkodieren und dann "Datum" als wiederholtes Maß und "Versuchstag" als Modell mit festem Faktor verwenden, aber es scheint, dass es einen einfacheren Weg geben muss. Mit anderen Worten, wie richte ich es unter der gemischten Modellplattform so ein, dass ich auch den Zeiteffekt erhalte (wie dies unter der MANOVA-Plattform möglich ist)? Oder sind Interaktionseffekte mit der wiederholten Messung unter einem gemischten Modell (und nur mit MANOVA) NICHT möglich?
Betreff: korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenHallo Anderson,
Sie können sowohl Datum als festen Effekt als auch als wiederholte Spalte in gemischten Modellen verwenden. In Ihrem Fall warnt JMP jedoch, wenn Sie Datum, Behandlung, Genotyp und deren Wechselwirkungen als festen Effekt hinzufügen, dass es lineare Abhängigkeiten zwischen den festen Effekten gibt (ich habe die Spalte Durchschnitt aus Ihren Daten als Y verwendet). Dies scheint nicht mit den gemischten Modellen zu tun zu haben; Sie erhalten dieselbe Warnung, wenn Sie nur ein Standardmodell für kleinste Quadrate wie unten gezeigt ausführen. Wenn Sie nur die drei Haupteffekte hinzufügen, werden die gemischten Modelle ausgeführt.
Ich weiß nicht genau, was die linearen Abhängigkeiten verursacht, aber ich sehe, dass Sie ein unausgeglichenes Design hatten. In meinem Beispiel für wiederholte Messungen aus einem ausgewogenen Design habe ich keine Probleme, das Modell mit den Haupteffekten und Interaktionen auszuführen, wobei die Kalenderdaten sowohl als fester Effekt als auch als wiederholte Spalte verwendet werden. (Beachten Sie, dass ich in meinem Beispiel das Kalenderdatum als Uhrzeit bezeichnet habe.)
Der Trick, den Sie erwähnt haben, ist, dass bei Auswahl von AR (1) als wiederholte Struktur die wiederholte Spalte fortlaufend sein muss. Daher habe ich aus der ursprünglichen Zeitspalte eine fortlaufende Tage-Spalte erstellt.
Betreff: korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenDanke für Ihre Antwort. Ich glaube, ich habe es tatsächlich herausgefunden, und es hat mit dem von Ihnen erwähnten unausgeglichenen Design zu tun. Grundsätzlich handelt es sich um eine Studie, bei der Organismen während der gesamten Studie absterben, sodass die Stichprobengröße mit jedem Bewertungsdatum zunehmend kleiner wird. Wenn Sie sich nur die ersten Studienzeiten ansehen, können Sie, wie Sie sagten, "Datum" als festen Begriff und als wiederholte Maßnahme verwenden, was gut ist, da ich das möchte.
Ich frage mich tatsächlich, ob diese Art von Problemen mit abnehmender Stichprobengröße tatsächlich eine völlig andere Reihe statistischer Ansätze erfordert (wie sie für Überlebensdaten verwendet werden). Vielleicht sollte ich eine neue Diskussion darüber eröffnen: Was ist der beste Ansatz, wenn Ihre Stichprobengröße im Laufe der Zeit aufgrund des Todes von Versuchstieren schrumpft? Wenn Sie versuchen, die MANOVA-Plattform mit solchen fehlenden Datendatensätzen zu verwenden, funktioniert dies überhaupt nicht! Aber ich möchte die späteren Abtastzeiten mit weniger Abtastungen nicht auslassen, da diese möglicherweise die interessantesten sind. Wie auch immer, danke, dass Sie sich damit befasst haben, und entschuldigen Sie, dass Sie eine rote Fahne gehisst haben, als es tatsächlich ein Problem mit meinem Datensatz (und nicht mit der Software) war!Betreff: korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenEntschuldigen Sie mein Geschwafel, aber ich bin ein bisschen verwirrt.
Welche Fragen versuchen Sie zu beantworten? Die "Farbe" ist ein Indikator für die Gesundheit der Koralle? Ich sehe keine Spalte mit der Bezeichnung Farbe? Ich sehe eine Spalte mit der Bezeichnung Durchschnitt. Was ist das? Durchschnitt von was? Wenn es einen Durchschnitt gibt, wie hoch ist die zugehörige Standardabweichung? Machen Sie Fotos von der Koralle und messen Sie dann die Farbe? Haben Sie die Messgenauigkeit quantifiziert? Was ist die Korallenposition?
Die Faktoren, an denen Sie interessiert sind, sind:
1. Behandlung - Temperatur (Werte als stabil und variabel identifiziert?). Warum nicht die Temperaturen aufzeichnen, bei denen Sie experimentieren?
2. Genotyp (Es gibt 6 davon, obwohl Ihr Datensatz 3 Datenpunkte ohne Werte und ohne Foto enthält?). Warum haben Sie die ausgeschlossenen Werte ausgeschlossen? ,
3. Zeit (Damit meinst du Tage?). Ich verstehe das nicht als Faktor? Ich bin mir nicht sicher, warum Sie dies als festen Effekt klassifizieren? Dies ist eigentlich kein manipulierter Faktor? Wären Sie besser dran, eine Antwortvariable zu erstellen, die Zeit ist, um eine bestimmte Farbe zu erreichen? Oder Zeit zu Tode? Oder erstellen Sie eine Regressionslinie mit den wiederholten Messungen über die Zeit und analysieren Sie die Steigung dieser Linie.
Sie haben Ihr Modell nicht angegeben. Sie möchten den linearen Effekt der Behandlung, die linearen und nichtlinearen Begriffe für den Genotyp (bis zur 4. Ordnung?). Wechselwirkungen von Behandlung und Genotyp? Interaktionen mit der Zeit? Ich bin mir nicht sicher, ob das für mich Sinn macht ... meinst du Instabilität?
Betreff: korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenVielen Dank an alle. Ich habe dieses Add-In bereits heruntergeladen. Ich hätte wahrscheinlich auch die Datentabelle erklären sollen, die ich gepostet habe, aber wir hatten im Grunde zwei Temperaturprofile (stabil vs. variabel), mehrere Genotypen und eine Farbintensität ("Durchschnitt", da sie über mehrere Bilder gemittelt wurde). Grundsätzlich wollten wir sehen, ob die Farbintensität (als R-Intensität, die im Wesentlichen umgekehrt mit der Pigmentierung korreliert) für Korallen mit stabiler oder variabler Temperatur, die später hohen Temperaturen ausgesetzt wurden, stärker anstieg. Wenn Sie Datum, Temperaturbehandlung und Genotyp im Modell überprüfen, sehen Sie einige interessante Effekte, die jedoch nicht unbedingt mit der Akklimatisierungstemperaturbehandlung zusammenhängen (der Effekt des Genotyps ist größer). Ein einfacherer Weg wäre gewesen, die Änderung der Farbe über die Zeit zu berechnen und die Zunahme / Abnahme der Farbe in einer Zwei-Wege-ANOVA (Temperaturbehandlung x Genotyp) zu analysieren. Dann wären von Anfang an keine wiederholten ANOVA-Maßnahmen notwendig gewesen!
Betreff: korrekte Formatierung für ANOVA mit wiederholten MessungenHallo @abmayfield
Wenn es um die Spezifikation einer wiederholten Anova-Messung geht, gibt es eine vereinfachte Ergänzung: Vollständiges faktorielles ANOVA-Add-In für wiederholte Messungen
https://www.youtube.com/watch?v=fh8jiFf2z-o
Vielleicht könnte es dir helfen.
Ron
