红外光谱和色谱功能数据的应用我有一个关于在红外光谱和色谱上使用 Functional Data Explorer 的问题。下面粘贴了示例波形,我正试图让客户向我发送数据表。该应用程序将使用这些作为 DOE 的响应。对于红外光谱,在特定波数处出现峰很有趣。对于色谱法,时间点(x 轴是时间)的曲线下面积很有趣。还讨论了对齐 x 轴和减去基础响应。
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/spectrpy/infrared/infrared.htm
https://www.researchgate.net/figure/High-performance-liquid-chromatography-HPLC-chromatograms-of-the-flavonoids-in-CN30_fig1_281614653


回复:红外光谱和色谱功能数据的应用嘿马丁,
你的建议 P-Splines 是我一直在使用 FDE 玩的东西。到目前为止,我还没有尝试过 FT,但我也怀疑它是否会比样条拟合更好……至少对于光谱数据而言。我发现似乎效果很好的一件事是使用 Rows as Functions 而不是堆叠数据。我在 NIR 和质谱数据方面取得了很好的结果,行作为函数和 P-Splines。我确实遇到了核磁共振数据的一些困难,但我需要重新访问该数据以尝试一些新事物。
不过,最终,我使用 PLS 或 Gen Reg 来拟合预测模型,并且我在 Gen Reg 中使用扫描弹性网络来找到一些非常好的预测模型,这些模型在连续和二项式响应数据方面与 PLS 模型相当或更好。
回复:红外光谱和色谱功能数据的应用我相信 JMP Development 最近与客户就此类数据进行了一些很好的讨论。 因此,他们很好地理解了为什么光谱和色谱数据(以及 XRD 等类似数据)像现在这样难以用于 FDE。 希望他们能够找到解决方案,为 JMP Pro 的新应用和新用户打开这个大门!
回复:红外光谱和色谱功能数据的应用虽然很久以前:
补充一下 Phil/Mike/Bill 的评论:这种数据很难与 FDE 标准结相符。您要么想尝试傅里叶(尽管这可能会在一侧过度摆动),要么尝试 P-Splines,您可以在峰值变化周围调整结点。 这将有助于消除平滑的影响。 通常这并不重要,但如果您对峰的不同位置(高度、auc 等)感兴趣,这可能会变得很重要。
从我过去与地震和信号处理客户的工作来看,过滤噪声很重要,FDE 仍然缺乏良好的过滤技术。 我相信这将有助于数据处理。
但是,我会尝试一下,看看你(目前)能有多好。 虽然我喜欢非线性和 curfe fit 平台,但我也不相信他们会做得很好
回复:红外光谱和色谱功能数据的应用根据我与客户打交道的经验,红外光谱和色谱法是 FDE 的有用应用。 GSK 已经多次介绍了他们如何使用 FDE 来优化色谱方法(尽管他们无法分享演示文稿)。 我有另一个客户在看 FTIR 光谱。
在这两种情况下,他们都没有查看整个光谱/色谱图。 他们专注于感兴趣的特定区域/峰。
上面的例子对我来说看起来有点“忙”,我认为 FDE 可能会遇到困难。 但这实际上取决于具体情况——功能间变化的性质是什么,以及他们想从数据中找出什么。
在这些情况下,减去基线是常见的数据准备。 现在在 FDE 中没有简单的方法可以做到这一点,但希望会被添加。
查看 Root Integrated Function Square 作为 FDE 汇总统计数据之一,可能对曲线下面积有帮助。回复:红外光谱和色谱功能数据的应用嘿!
也许从不同的角度@Bill_Worley . PLS 书中的 NIR 数据是 IR 光谱的一个很好的例子,它可以很好地与 FDE 配合使用。 当光谱峰变得更尖锐时,进行真正良好追踪的能力就会下降。 该函数尝试舍入顶部/底部尖峰位。 我在一些 XRD 光谱、质谱和 NMR 上遇到过这个问题。 也就是说,您仍然可以从迹线中获得很多有用的信息(识别光谱中的活动区域等......请参阅 Pete 的发现讲座......) 我还发现,对于刚接触该主题的人来说,围绕 PLS 思考要容易得多。 我已经能够在 FDE 中获得牵引力,而 PLS 就在他们头上。
对于色谱法,尤其是 AUC 计算,您需要使用非线性或拟合曲线 (IMO)。 不过,您也许可以使用 FDE 来解决 Bill 提到的噪音……有点像数据清理步骤。
最好的,
米回复:红外光谱和色谱功能数据的应用海德,
您显示的红外光谱是纯化合物的。如果他们正在研究纯化合物,他们可能能够制定校准曲线。过去,PLS 已非常有效地用于光谱数据。如果您有 PLS 书,则对确定气体中的辛烷值有很好的描述。总而言之,Pete Hersh 在 Discovery 展示了在 FDE 中使用 NIR 数据的示例,您可以就此与他联系。
对于色谱法,时间点是特定化合物的洗脱时间。除非你想比较不同批次的曲线,否则我不确定 FDE 是这里的正确答案,但我以前错了。您提到的色谱法通常也有很多基线噪音。如果您从客户那里获得一些数据,很高兴与您一起解决这个问题。
最好的,
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