Este espacio comunitario está destinado a ser el centro de información de JMP Genomics. Esta información es para solo para uso interno y no debe copiarse en documentos separados; esta página es un trabajo en progreso y se actualizará cuando tengamos nueva información para compartir. gracias a Tracy Bailey, Drew Hayes, Lori Casto, Briana Codd, Ruth Hummel, Chris Kirchberg y Geoff Mann por proporcionar gran contenido, sugerencias y comentarios!
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Elevator Pitch para Farmacia y Biotecnología:
JMP Genomics lo ayuda a explorar visual e interactivamente poblaciones de células raras y complejas, detectar los patrones de expresión génica diferenciales en los tipos de células a través del análisis de agrupamiento, perfilar los cambios transcripcionales en las células inmunitarias para ayudar a desarrollar vacunas o tratamientos, y descubrir la dinámica evolutiva de la progresión tumoral y la metástasis. y resistencia al tratamiento. Ventajas competitivas: Análisis visuales e interactivos simples y avanzados, todo en un solo lugar sin programación.
Elevator Pitch para fitomejoradores y biocientíficos de cultivos:
Usando una base de investigación agronómica y algoritmos de vanguardia, los ciclos de mejoramiento de alto ritmo realizados en JMP Genomics permiten a los fitomejoradores y biocientíficos de cultivos impulsar la selección de cultivos más saludables al modelar la variabilidad genética, optimizar las opciones de mejoramiento, simular programas de mejoramiento de características múltiples y equilibrar compensaciones a través de rasgos deseables clave. Ventajas competitivas: Análisis visuales e interactivos simples y avanzados, todo en un solo lugar sin programación.
¿Cuáles son algunas palabras/frases clave que debo escuchar que indicarían un posible prospecto de JMP Genomics?
- Datos de secuenciación de próxima generación (NGS)
- Estudios de asociación amplia del genoma (GWAS)
- Mejoramiento de cultivos de alto ritmo
- Secuenciación de ARN de una sola célula
- Asociación de variantes
- Proteómica o Metabolómica
¿Cuáles son las preguntas comunes que puedo hacer para calificar a un prospecto de JMP Genomics?
Farmacia/Biotecnología
- ¿Está realizando secuenciación de células individuales para estudios de inmunología u oncología?
- ¿Está evaluando la eficacia de las vacunas?
- ¿Son reproducibles sus análisis de farmacogenómica?
- ¿Está tratando de optimizar sus ensayos o pruebas de diagnóstico? ?
Empresas Agrícolas
- ¿Está su empresa involucrada en la selección genómica con sus programas de mejoramiento?
- ¿Está tratando de mejorar el rendimiento de los cultivos?
- ¿Tiene dificultades para optimizar sus programas de mejoramiento?
- ¿Mejorar la resistencia a las enfermedades?
- ¿Es capaz de incluir todos los rasgos deseables en sus programas de mejoramiento?
- ¿Está interesado en el registro de una nueva planta?
¿Cuáles son los diferentes tipos de datos que normalmente se analizan en JMP Genomics?
Descripción general: datos de ADN, ARN, metabolitos y proteínas
Datos de chips genéticos: geoff a la lista de suministros.
- Datos de secuenciación de ARN de una sola célula
- Datos de expresión
- micromatriz
- RNA-seq
- Datos de secuenciación de última generación
- Datos variantes
- Datos de secuencia genética alineados (sin embargo, JMP G NO maneja datos de secuencia sin procesar)
- Estudios de asociación del genoma completo
- No solo datos genómicos: proteómica (proteínas), metabolómica (metabolitos)
- Para obtener más información sobre esto, consulte página de capacidades básicas.
¿Cuáles son los beneficios clave de JMP Genomics?
- En general, JMP Genomics puede mejorar la reproducibilidad de sus análisis con datos de genómica, proteómica y metabolómica.
- JMP Genomics es muy bueno analizando datos de alto rendimiento y alta dimensión.
- Mejore sus análisis de datos de secuenciación de ARN de una sola célula.
- Mejore sus análisis de diversidad genética y aplique la selección genómica con sus programas de fitomejoramiento.
- Utilice los mejores métodos de análisis predictivo y aprendizaje automático para los datos de secuenciación de próxima generación.
- Utilice el software líder para analizar datos de expresión de micromatrices.
¿Qué tipo de organizaciones o empresas utilizan JMP Genomics?
¿Qué tipo de roles/títulos/personajes son el público objetivo de JMP Genomics?
- Fitomejoradores (transmisión web)
- Científicos de cultivos ( Blog)
- Genetistas Cuantitativos
- Científicos traslacionales (Blog)
- Científicos en bioinformática
- Científicos de biomarcadores
- Investigadores Científicos
- Biólogos
- Bioquímicos
- Biólogos Moleculares
- genetistas
- estadísticos
- Epidemiólogos
- Doctor en Medicina
¿Cómo es un flujo de trabajo típico para los usuarios?
Para hacer experimentación científica reproducible, debe seguir un cierto protocolo de pasos. Los flujos de trabajo primarios/más comunes para JMP Genomics son los flujos de trabajo de "Expresión básica", "Seq de ARN básica", "Número de copia básica" y "Mosaico básico" que siguen principalmente los siguientes pasos con los datos:
- 1. Control de calidad (¿son precisos los datos?)
- 2. Normalización (¿es esto manzanas con manzanas?)
- 3. Diseño y modelo experimental (¿cómo se presenta su diseño?)
- 4. Expresión diferencial (¿Cómo se expresan de manera diferente/cambian los genes?)
- 5. Anotación (Identificación de los genes con grandes diferencias)
¿Cuánto cuesta JMP Genomics?
- JMP Genomics cuesta $ 14,900 para FYF (igual que JMP Clinical y JMP Pro)
- Descuentos por volumen disponibles.
- por favor refiérase a Página de precios de JMP Genomics para la información más reciente.
¿JMP Genomics tiene todas las características que tiene JMP Pro?
JMP Genomics se basa en JMP Pro. Se puede acceder a las capacidades a través de los menús; sin embargo, no hemos integrado estas capacidades dentro de los procesos, la interfaz y los métodos de modelado predictivo de JMP Genomic.
¿Cuándo JMP Genomics no es una buena opción para Genomics?
- Análisis bioinformático
- Procesamiento de secuencias sin procesar
- Alineaciones de secuencia
- Detección de variantes raras
- Análisis de red
- Análisis de ruta (excepto para análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes, GSEA)
- Análisis de panel de expresión pequeña (qPCR o microarrays dirigidos pequeños)
Estos tipos de paneles tienen alrededor de unos pocos cientos de genes y, por lo general, ya están analizados. JMP o JMP Pro pueden ser los mejores según la necesidad (DOE para optimización de paneles, creación e implementación de modelos predictivos, evaluación de paneles, resultados de un DOE para encontrar factores significativos y luego optimizar el proceso)
¿Quiénes son los principales competidores de JMP Genomics?
Hélice dorada
- Tiene menos análisis.
- Tiene menos visualizaciones estadísticas.
- Problema potencial: tiene una sucursal de servicios para hacer el trabajo para el cliente
Partek
- Tiene menos análisis, solo permite modelos de hasta 2 factores. Ej: puede comparar las diferencias de expresión entre hombres y mujeres, y entre el control, el tratamiento 1 y el tratamiento 2. JMPG permite muchos factores. Ej: además de la comparación de sexos y la comparación de tratamientos, también podemos incluir grupos de edad, grupos de dieta, etc. Tantos factores como necesite.
- Tiene menos visualizaciones estadísticas
- Problema potencial: tiene una canalización completa que permite a Partek realizar la alineación de secuencias, lo que JMP no puede hacer.
BioPython
- Propensos a errores, los programadores crean código único.
- Sin soporte técnico
- Problema potencial: los últimos métodos de aprendizaje automático están disponibles antes que JMPG
R Bioconductor
- Propensos a errores, los programadores crean código único.
- Sin soporte técnico.
- Los últimos métodos de aprendizaje automático están disponibles antes que JMPG
Qiagen Omnisoft y Workbench Solutions (Geoff para agregar notas) Aglient GeneSpring (Geoff para agregar notas)
¿Dónde está instalado JMP Genomics?
Debe instalarse en una PC local (Windows) para un entorno virtualizado (similar a JMP y JMP Pro).
¿Qué sucede si tengo un candidato fuerte para JMP Genomics? ¿Qué debo hacer?
- Averigüe si tienen presupuesto.
- Averigüe si tienen el tipo correcto de datos. Datos de secuencias de ARN/ADN alineados, típicamente. Los datos de metabolómica y proteómica no necesitan estar alineados.
- Programe la demostración.
¿Hay ejemplos de victorias en ventas de JMP Genomics que pueda conocer?
Puede leer acerca de las ganancias de ventas de JMP Genomics consultando el
lista de victorias de ventas aquí y usando Control+F para encontrar ganancias de Genomics.
¿Quién suele presentar demostraciones de JMP Genomics?
Algunos SE pueden hacer sus propias demostraciones de JMP Genomics a un nivel introductorio. Si es necesario, su SE trabajará con Chris Kirchberg o Valerie Nedbal para preparar la demostración. Si aún necesitan más apoyo, Chris o Valerie ayudarán con la demostración. Si no están disponibles, Luciano podrá ayudar.
¿Cuáles son algunos recursos de JMP Genomics que puedo ofrecer a un cliente potencial o potencial?
ENLACES RELACIONADOS:
Capacitación en genómica JMP
Recursos de genómica de JMP
Calendario de lanzamiento de JMP Genomics
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