这个社区空间旨在成为 JMP Genomics 信息的中心。 这个信息是为了仅供内部使用并且不应复制到单独的文档中 - 此页面正在进行中,当我们有新信息要共享时会更新。 谢谢至Tracy Bailey、Drew Hayes、Lori Casto、Briana Codd、Ruth Hummel、Chris Kirchberg 和 Geoff Mann感谢您提供精彩的内容、建议和反馈!
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制药和生物技术电梯演讲:
JMP Genomics 帮助您直观地以交互方式探索复杂和稀有细胞群,通过聚类分析检测不同细胞类型的差异基因表达模式,分析免疫细胞的转录变化以帮助开发疫苗或治疗,并揭示肿瘤进展、转移的进化动力学和治疗抵抗力。竞争优势:简单和高级的可视化和交互式分析全部集中在一个地方,无需编程。
植物育种者和作物生物科学家的电梯间距:
以农学研究和前沿算法为基础,在 JMP Genomics 中执行的高速育种周期允许植物育种者和作物生物科学家通过对遗传变异性建模、优化育种选择、模拟多性状育种计划和平衡来推动选择更健康的作物权衡关键的理想特征。 竞争优势:简单和高级的可视化和交互式分析全部集中在一个地方,无需编程。
我应该听哪些关键词/短语表明潜在的 JMP Genomics 前景?
- 下一代测序数据 (NGS)
- 全基因组关联研究 (GWAS)
- 作物的高速育种
- 单细胞RNA测序
- 变异关联
- 蛋白质组学或代谢组学
我可以问哪些常见问题来确定 JMP Genomics 潜在客户的资格?
制药/生物技术
- 您是否正在为免疫学或肿瘤学研究进行单细胞测序?
- 您在评估疫苗的功效吗?
- 您的药物基因组学分析是否可重现?
- 您是否正在尝试优化您的化验或诊断测试?
农业公司
- 贵公司是否参与了育种计划的基因组选择?
- 你想提高作物产量吗?
- 您是否难以优化您的育种计划?
- 提高抗病能力?
- 您能否在您的育种计划中包含所有理想的性状?
- 您对新工厂注册感兴趣吗?
JMP Genomics 通常分析哪些不同类型的数据?
一般描述:DNA、RNA、代谢物和蛋白质数据
遗传芯片数据 - geoff 供应清单。
- 单细胞RNA测序数据
- 表达数据
- 微阵列
- RNA序列
- 新一代测序数据
- 变异数据
- 比对基因序列数据(但是,JMP G 不处理原始序列数据)
- 全基因组关联研究
- 不仅仅是基因组学数据:蛋白质组学(蛋白质)、代谢组学(代谢物)
- 有关此的更多信息,请参阅核心能力页面。
JMP Genomics 的主要优势是什么?
- 总体而言,JMP Genomics 可以提高您使用基因组学、蛋白质组学和代谢组学数据进行分析的可重复性。
- JMP Genomics 非常擅长分析高通量、高维数据。
- 改进对单细胞 RNA 测序数据的分析。
- 改进您的遗传多样性分析,并将基因组选择应用于您的植物育种计划。
- 对下一代测序数据使用顶级预测分析和机器学习方法。
- 使用领先的软件分析微阵列表达数据。
哪些类型的组织或公司使用 JMP Genomics?
JMP Genomics 的目标受众是什么类型的角色/头衔/角色?
- 植物育种者(网播)
- 作物科学家 (博客)
- 数量遗传学家
- 转化科学家(博客)
- 生物信息学科学家
- 生物标记科学家
- 研究科学家
- 生物学家
- 生物化学家
- 分子生物学家
- 遗传学家
- 统计学家
- 流行病学家
- 医学博士
用户的典型工作流程是什么样的?
为了进行可重复的科学实验,您必须遵循特定的步骤协议。 JMP Genomics 的主要/最常见工作流程是“基本表达”、“基本 RNA-seq”、“基本拷贝数”和“基本平铺”工作流程,主要遵循以下数据步骤:
- 1.质量控制(数据准确吗?)
- 2.归一化(这是同类产品吗?)
- 3. 实验设计和模型(你的设计是如何布局的?)
- 4.差异表达(基因如何表达不同/改变?)
- 5. Annotation(识别差异较大的基因)
JMP 基因组学多少钱?
- JMP Genomics FYF 为 14,900 美元(与 JMP Clinical 和 JMP Pro 相同)
- 提供批量折扣。
- 请参阅JMP Genomics 定价页面获取最新信息。
JMP Genomics 是否具有 JMP Pro 的所有功能?
JMP Genomics 基于 JMP Pro 构建。 这些功能可通过菜单访问,但我们尚未将这些功能集成到 JMP Genomic 的预测建模流程、界面和方法中。
JMP Genomics 什么时候不适合 Genomics?
- 生物信息学分析
- 原始序列处理
- 序列比对
- 罕见变异检测
- 网络分析
- 通路分析(基因集富集分析、GSEA 除外)
- 小型表达面板分析(qPCR 或小型靶向微阵列)
这些类型的面板大约有几百个基因,通常已经过分析。 JMP 或 JMP Pro 可能是最好的,具体取决于需要(DOE 用于面板优化、预测模型创建和部署、面板评估、DOE 的结果以找到重要因素然后优化过程)
JMP Genomics的主要竞争对手有哪些?
黄金螺旋
- 分析较少。
- 具有较少的统计可视化。
- 潜在问题:有一个服务部门为客户做这项工作
帕泰克
- 分析较少,只允许模型最多 2 个因素。 例如:您可以比较男性和女性之间以及对照组、治疗 1 和治疗 2 之间的表达差异。 JMPG 考虑了许多因素。 例如:除了性别比较和治疗比较之外,我们还可以包括年龄组、饮食组等。您需要多少因素。
- 具有较少的统计可视化
- 潜在问题:具有完整的管道允许 Partek 执行序列比对,这是 JMP 无法执行的。
生物蟒蛇
- 容易出错,程序员创建一次性代码。
- 无技术支持
- 潜在问题:最新的机器学习方法比 JMPG 更快可用
R生物导体
- 容易出错,程序员创建一次性代码。
- 没有技术支持。
- 最新的机器学习方法比 JMPG 更快可用
Qiagen Omnisoft 和 Workbench Solutions(Geoff 添加注释) Aglient GeneSpring(Geoff 添加注释)
JMP Genomics 安装在哪里?
必须在本地 PC (Windows) 上安装到虚拟化环境(类似于 JMP 和 JMP Pro)。
如果我有一个强有力的 JMP Genomics 候选人怎么办——我该怎么办?
- 看看他们是否有预算。
- 看看他们是否有正确的数据类型。 对齐的 RNA/DNA 序列数据,通常。 代谢组学和蛋白质组学数据不需要对齐。
- 安排演示。
是否有 JMP Genomics 的销售成功案例可供我学习?
您可以通过参考了解 JMP Genomics 的销售胜利
销售胜利列表在这里并使用 Control+F 查找 Genomics 获胜。
JMP Genomics 演示通常由谁进行?
一些 SE 能够在入门级进行自己的 JMP Genomics 演示。 如果需要,您的 SE 将与 Chris Kirchberg 或 Valerie Nedbal 一起为演示做准备。 如果他们仍然需要更多支持,Chris 或 Valerie 将帮助完成演示。 如果他们不在,Luciano 将能够提供帮助。
我可以为潜在客户或客户提供哪些 JMP Genomics 资源?
相关链接:
JMP 基因组学培训
JMP 基因组学资源
JMP Genomics 发布时间表
JMP Genomics 10 的新功能