このコミュニティ スペースは、JMP Genomics 情報のハブとなることを目的としています。 この情報は内部でのみ使用別のドキュメントにコピーしないでください。このページは進行中の作業であり、共有する新しい情報があれば更新されます。 ありがとうございましたトレイシー・ベイリー、ドリュー・ヘイズ、ロリ・カスト、ブリアナ・コッド、ルース・ハメル、クリス・カーチバーグ、ジェフ・マンすばらしいコンテンツ、提案、フィードバックを提供していただきありがとうございます。
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製薬およびバイオテクノロジーのエレベーター ピッチ:
JMP Genomics は、複雑で希少な細胞集団を視覚的かつインタラクティブに探索し、クラスタリング分析を通じて細胞タイプ間で異なる遺伝子発現パターンを検出し、免疫細胞の転写変化をプロファイリングしてワクチンや治療の開発を支援し、腫瘍の進行と転移の進化的ダイナミクスを明らかにするのに役立ちます。 、および治療抵抗。競争上の優位性: シンプルで高度な視覚的およびインタラクティブな分析をすべて 1 か所でプログラミングせずに実行できます。
植物育種家と作物生物科学者のためのエレベーター ピッチ:
農業研究の基盤と最先端のアルゴリズムを使用して、JMP Genomics で実行されるペースの速い育種サイクルにより、植物育種家や作物生物科学者は、遺伝的多様性のモデル化、育種選択の最適化、複数形質育種プログラムのシミュレーション、およびバランス調整によって、より健康な作物の選択を促進できます。主要な望ましい特性間のトレードオフ。 競争上の優位性: シンプルで高度な視覚的およびインタラクティブな分析をすべて 1 か所でプログラミングせずに実行できます。
JMP Genomics の潜在的な見込み客を示す、聞くべきキーワード/フレーズは何ですか?
- 次世代シーケンシングデータ (NGS)
- ゲノムワイド関連研究 (GWAS)
- 作物のハイペース育種
- シングルセル RNA シーケンス
- バリアントの関連付け
- プロテオミクスまたはメタボロミクス
JMP Genomics の見込み顧客を評価するためによくある質問は何ですか?
製薬/バイオテクノロジー
- 免疫学または腫瘍学研究のためにシングルセルシーケンシングを行っていますか?
- ワクチンの有効性を評価していますか？
- ファーマコゲノミクス解析は再現可能ですか?
- アッセイまたは診断テストを最適化しようとしていますか? ?
農業会社
- あなたの会社は育種プログラムのゲノム選択に関与していますか?
- 作物の収量を改善しようとしていますか?
- 繁殖プログラムの最適化に苦労していませんか?
- 耐病性の向上？
- 繁殖プログラムに望ましい形質をすべて含めることができますか?
- 植物の新規登録に興味がありますか？
JMP Genomics で一般的に分析されるさまざまな種類のデータは何ですか?
一般的な説明: DNA、RNA、代謝物、およびタンパク質のデータ
Genetic Chip データ - リストを提供するジェフ。
- シングルセル RNA シーケンスデータ
- 発現データ
- マイクロアレイ
- RNA シーケンス
- 次世代シーケンシングデータ
- バリアント データ
- アラインされた遺伝子配列データ (ただし、JMP G は生の配列データを処理しません)
- ゲノムワイド関連研究
- ゲノミクス データだけでなく、プロテオミクス (タンパク質)、メタボロミクス (代謝産物)
- 詳細については、次を参照してください。コア機能ページ。
JMP Genomics の主な利点は何ですか?
- 全体的な JMP Genomics は、ゲノミクス、プロテオミクス、およびメタボロミクス データを使用して分析の再現性を向上させることができます。
- JMP Genomics は、ハイスループットで高次元のデータの分析に非常に優れています。
- 単一細胞 RNA シーケンス データの解析を改善します。
- 遺伝的多様性の分析を改善し、植物育種プログラムでゲノム選択を適用します。
- 次世代シーケンシング データに最高の予測分析と機械学習手法を使用します。
- マイクロアレイの発現データを解析するための最先端のソフトウェアを使用してください。
JMP Genomics を使用している組織や企業はどのようなものですか?
JMP Genomics の対象読者は、どのような役割/役職/ペルソナですか?
- 植物育種家(ウェブキャスト)
- 作物科学者 (ブログ）
- 量的遺伝学者
- トランスレーショナル サイエンティスト(ブログ)
- バイオインフォマティクス科学者
- バイオマーカー科学者
- 研究者
- 生物学者
- 生化学者
- 分子生物学者
- 遺伝学者
- 統計学者
- 疫学者
- 医師
ユーザーにとって典型的なワークフローはどのようなものですか?
再現性のある科学実験を行うには、特定の手順に従う必要があります。 JMP Genomics の主要な/最も一般的なワークフローは、「基本的な発現」、「基本的な RNA-seq」、「基本的なコピー数」、および「基本的なタイリング」のワークフローで、主にデータを使用して次の手順に従います。
- 1. 品質管理（データは正確か？）
- 2. ノーマライゼーション (これはりんごとりんごですか?)
- 3. 実験デザインとモデル (デザインはどのようにレイアウトされていますか?)
- 4. 差次的発現 (遺伝子はどのように異なる/変化しているか?)
- 5. アノテーション（差異の大きい遺伝子の特定）
JMPゲノミクスはいくらですか？
- JMP Genomics は FYF で 14,900 ドル (JMP Clinical および JMP Pro と同じ)
- ボリュームディスカウントあり。
- を参照してください。 JMP Genomics 価格ページ最新情報については。
JMP Genomics には、JMP Pro のすべての機能がありますか?
JMP Genomics は、JMP Pro 上に構築されています。 これらの機能はメニューからアクセスできますが、これらの機能は JMP Genomic の予測モデリング プロセス、インターフェース、メソッドに統合されていません。
JMP GenomicsがGenomicsに適していないのはどのような場合ですか?
- バイオインフォマティクス分析
- 生シーケンス処理
- 配列アラインメント
- レアバリアントの検出
- ネットワーク分析
- パスウェイ解析 (Gene Set Enrichment Analysis、GSEA を除く)
- 小規模発現パネル分析 (qPCR または小規模ターゲット マイクロ アレイ)
これらのタイプのパネルは約数百の遺伝子であり、通常はすでに分析されています。 必要に応じて、JMP または JMP Pro が最適な場合があります (パネル最適化のための DOE、予測モデルの作成と展開、パネル評価、重要な要因を見つけるための DOE の結果、およびプロセスの最適化)
JMP Genomics の主な競合他社は?
ゴールデンヘリックス
- 分析が少ない。
- 統計的な視覚化が少ない。
- 潜在的な問題: 顧客のために作業を行うサービス ブランチがある
パルテック
- 分析が少なく、最大 2 因子までのモデルのみが許可されます。 例：オスとメス、コントロール、処理1、処理2の発現の違いを比較できます。 JMPG では多くの要因が考慮されます。 例: 性別の比較と治療の比較に加えて、年齢グループ、食事グループなども含めることができます。必要な数の要素を含めることができます。
- 統計的な視覚化が少ない
- 潜在的な問題: パイプラインが完全であるため、JMP では実行できないシーケンス アラインメントを Partek で実行できます。
バイオパイソン
- エラーが発生しやすく、プログラマーは 1 回限りのコードを作成します。
- 技術サポートなし
- 潜在的な問題: 最新の機械学習手法が JMPG よりも早く利用可能になる
R 生体伝導体
- エラーが発生しやすく、プログラマーは 1 回限りのコードを作成します。
- 技術サポートなし。
- JMPGよりも早く最新の機械学習手法が利用可能に
Qiagen Omnisoft and Workbench Solutions (Geoff がメモを追加) Aglient GeneSpring (Geoff がメモを追加)
JMP Genomics はどこにインストールされていますか?
仮想化環境へのローカル PC (Windows) にインストールする必要があります (JMP および JMP Pro と同様)。
JMP Genomics の有力な候補者がいる場合はどうすればよいですか?
- 予算があるかどうかを調べます。
- 彼らが正しい種類のデータを持っているかどうかを調べてください。 通常、アラインされた RNA/DNA 配列データ。 メタボロミクスとプロテオミクスのデータを揃える必要はありません。
- デモをスケジュールします。
JMP Genomics の販売実績の例はありますか?
JMP Genomics の販売実績については、
販売実績一覧はこちらそして、Control+F を使用してゲノミクスの勝利を見つけます。
通常、JMP Genomics のデモを行うのは誰ですか?
一部の SE は、入門レベルで独自の JMP Genomics デモを行うことができます。 必要に応じて、SE が Chris Kirchberg または Valerie Nedbal と協力してデモの準備を行います。 さらにサポートが必要な場合は、Chris または Valerie がデモをお手伝いします。 利用できない場合は、ルチアーノがお手伝いします。
見込み客や顧客に提供できる JMP Genomics のリソースにはどのようなものがありますか?
関連リンク：
JMPゲノミクストレーニング
JMPゲノミクスのリソース
JMP Genomics リリース スケジュール
JMP Genomics 10 の新機能
