Questo spazio comunitario è pensato per essere il fulcro delle informazioni di JMP Genomics. Questa informazione è per solo per uso interno e non deve essere copiato in documenti separati: questa pagina è un lavoro in corso e verrà aggiornata quando avremo nuove informazioni da condividere. Grazie a Tracy Bailey, Drew Hayes, Lori Casto, Briana Codd, Ruth Hummel, Chris Kirchberg e Geoff Mann per aver fornito ottimi contenuti, suggerimenti e feedback!
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Elevator Pitch per il settore farmaceutico e biotecnologico:
JMP Genomics ti aiuta a esplorare visivamente e in modo interattivo popolazioni cellulari complesse e rare, rilevare i modelli di espressione genica differenziali tra i tipi di cellule attraverso l'analisi di clustering, delineare i cambiamenti trascrizionali nelle cellule immunitarie per aiutare a sviluppare vaccini o trattamenti e scoprire le dinamiche evolutive della progressione del tumore, metastasi e resistenza al trattamento. Vantaggi competitivi: analisi visive e interattive semplici e avanzate in un unico posto senza programmazione.
Elevator Pitch per coltivatori di piante e bioscienziati delle colture:
Utilizzando una base di ricerca agronomica e algoritmi all'avanguardia, i cicli di allevamento ad alto ritmo eseguiti in JMP Genomics consentono ai coltivatori di piante e ai bioscienziati delle colture di guidare la selezione di colture più sane modellando la variabilità genetica, ottimizzando le scelte di allevamento, simulando programmi di allevamento a più tratti e bilanciando compromessi tra i principali tratti desiderabili. Vantaggi competitivi: analisi visive e interattive semplici e avanzate in un unico posto senza programmazione.
Quali sono alcune parole/frasi chiave che dovrei ascoltare per indicare un potenziale potenziale cliente di JMP Genomics?
- Dati di sequenziamento di nuova generazione (NGS)
- Genome Wide Association Studies (GWAS)
- Allevamento ad alto ritmo delle colture
- Sequenziamento dell'RNA a singola cellula
- Associazione variante
- Proteomica o Metabolomica
Quali sono le domande più comuni che posso porre per qualificare un potenziale cliente JMP Genomics?
farmaceutico/biotecnologico
- Stai eseguendo il sequenziamento di singole cellule per studi di immunologia o oncologia?
- State valutando l'efficacia dei vaccini?
- Le vostre analisi di farmacogenomica sono riproducibili?
- Stai cercando di ottimizzare i tuoi test o test diagnostici ?
Aziende Agricole
- La tua azienda è coinvolta nella selezione genomica con i tuoi programmi di allevamento?
- Stai cercando di migliorare la resa delle colture?
- Hai difficoltà a ottimizzare i tuoi programmi di allevamento?
- Migliorare la resistenza alle malattie?
- Sei in grado di includere tutti i tratti desiderabili nei tuoi programmi di allevamento?
- Sei interessato alla registrazione di un nuovo impianto?
Quali sono i diversi tipi di dati generalmente analizzati in JMP Genomics?
Descrizione generale: dati su DNA, RNA, metaboliti e proteine
Dati del chip genetico - Geoff alla lista dei fornitori.
- Dati di sequenziamento dell'RNA a singola cellula
- Dati di espressione
- Microarray
- RNA-seq
- Dati di sequenziamento di nuova generazione
- Dati varianti
- Dati di sequenza genetica allineati (tuttavia, JMP G NON gestisce i dati di sequenza non elaborati)
- Studi di associazione genome wide
- Non solo dati di genomica: proteomica (proteine), metabolomica (metaboliti)
- Per maggiori informazioni su questo fare riferimento a pagina delle capacità principali.
Quali sono i principali vantaggi di JMP Genomics?
- In generale, JMP Genomics può migliorare la riproducibilità delle tue analisi con dati di genomica, proteomica e metabolomica.
- JMP Genomics è molto bravo nell'analisi di dati ad alta produttività e ad alta dimensione.
- Migliora le tue analisi dei dati di sequenziamento dell'RNA a singola cellula.
- Migliora le tue analisi della diversità genetica e applica la selezione genomica con i tuoi programmi di miglioramento genetico delle piante.
- Usa i migliori metodi di analisi predittiva e machine learning per i dati di Next Gen Sequencing.
- Utilizza il software leader per l'analisi dei dati di espressione di microarray.
Che tipo di organizzazioni o aziende utilizzano JMP Genomics?
Che tipo di ruoli/titoli/personaggi sono i destinatari di JMP Genomics?
- Allevatori di piante (webcast)
- Scienziati del raccolto ( blog)
- Genetisti quantitativi
- Scienziati traslazionali (blog)
- Scienziati di bioinformatica
- Scienziati di biomarcatori
- Ricercatori
- Biologi
- Biochimici
- Biologi Molecolari
- Genetisti
- Statistici
- Epidemiologi
- Medico
Che aspetto ha un tipico flusso di lavoro per gli utenti?
Per fare esperimenti scientifici riproducibili, devi seguire un certo protocollo di passaggi. I flussi di lavoro principali/più comuni per JMP Genomics sono I flussi di lavoro "Espressione di base", "RNA-seq di base", "Numero di copie di base" e "Tiling di base" seguono principalmente i seguenti passaggi con i dati:
- 1. Controllo di qualità (i dati sono accurati?)
- 2. Normalizzazione (è da mele a mele?)
- 3. Progettazione sperimentale e modello (come è strutturato il tuo progetto?)
- 4. Espressione differenziale (come i geni si esprimono in modo diverso/cambiano?)
- 5. Annotazione (identificazione dei geni con grandi differenze)
Quanto costa JMP Genomics?
- JMP Genomics costa $ 14.900 per FYF (come JMP Clinical e JMP Pro)
- Sconti sul volume disponibili.
- Si prega di fare riferimento al Pagina dei prezzi di JMP Genomics per le ultime informazioni.
JMP Genomics dispone di tutte le funzionalità di JMP Pro?
JMP Genomics è basato su JMP Pro. Le funzionalità sono accessibili tramite i menu, tuttavia non abbiamo integrato queste funzionalità nei processi, nell'interfaccia e nei metodi di modellazione predittiva di JMP Genomic.
Quando JMP Genomics non è adatto a Genomics?
- Analisi bioinformatica
- Elaborazione della sequenza grezza
- Allineamenti di sequenza
- Rilevamento di varianti rare
- Analisi di rete
- Pathway Analysis (ad eccezione di Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)
- Analisi del pannello di piccole espressioni (qPCR o piccoli microarray mirati)
Questi tipi di pannelli sono circa poche centinaia di geni e in genere sono già analizzati. JMP o JMP Pro possono essere i migliori a seconda delle necessità (DOE per l'ottimizzazione del panel, creazione e distribuzione di modelli predittivi, valutazione del panel, risultati di un DOE per trovare fattori significativi e quindi processo di ottimizzazione)
Chi sono i principali concorrenti di JMP Genomics?
Elica d'oro
- Ha meno analisi.
- Ha meno visualizzazioni statistiche.
- Problema potenziale: ha una filiale di servizi per svolgere il lavoro per il cliente
Partec
- Ha meno analisi, consente solo modelli fino a 2 fattori. Es: puoi confrontare le differenze di espressione tra Maschi e Femmine e tra Controllo, Trattamento 1 e Trattamento 2. JMPG tiene conto di molti fattori. Es: oltre al confronto del sesso e al confronto del trattamento, possiamo includere anche gruppi di età, gruppi dietetici, ecc. Tutti i fattori di cui hai bisogno.
- Ha meno visualizzazioni statistiche
- Problema potenziale: la pipeline completa consente a Partek di eseguire l'allineamento della sequenza, cosa che JMP non può fare.
BioPython
- Soggetto a errori, i programmatori creano codice una tantum.
- Nessun supporto tecnico
- Problema potenziale: i metodi di machine learning più recenti sono disponibili prima di JMPG
R Bioconduttore
- Soggetto a errori, i programmatori creano codice una tantum.
- Nessun supporto tecnico.
- Gli ultimi metodi di apprendimento automatico sono disponibili prima di JMPG
Soluzioni Qiagen Omnisoft e Workbench (Geoff per aggiungere note) Aglient GeneSpring (Geoff per aggiungere note)
Dove è installato JMP Genomics?
Deve essere installato su un PC locale (Windows) in ambiente virtualizzato (simile a JMP e JMP Pro).
E se ho un candidato valido per JMP Genomics, cosa devo fare?
- Scopri se hanno budget.
- Scopri se hanno il giusto tipo di dati. Dati di sequenza RNA/DNA allineati, in genere. I dati di metabolomica e proteomica non devono essere allineati.
- Pianifica la demo.
Ci sono esempi di vendite vinte per JMP Genomics che devo conoscere?
Chi presenta in genere le demo di JMP Genomics?
Alcuni SE sono in grado di eseguire le proprie demo di JMP Genomics a livello introduttivo. Se necessario, il tuo SE collaborerà con Chris Kirchberg o Valerie Nedbal per preparare la demo. Se hanno ancora bisogno di ulteriore supporto, Chris o Valerie ti aiuteranno con la demo. Se non sono disponibili, Luciano sarà in grado di aiutare.
Quali sono alcune risorse di JMP Genomics che posso offrire a un potenziale cliente o cliente?
LINK CORRELATI:
Formazione sulla genomica di JMP
Risorse per la genomica di JMP
Programma di rilascio di JMP Genomics
Novità di JMP Genomics 10
