Cet espace communautaire est censé être la plaque tournante des informations JMP Genomics. Ces informations sont pour usage interne uniquement et ne doivent pas être copiés dans des documents séparés - cette page est un travail en cours et sera mise à jour lorsque nous aurons de nouvelles informations à partager. Merci de Tracy Bailey, Drew Hayes, Lori Casto, Briana Codd, Ruth Hummel, Chris Kirchberg et Geoff Mann pour avoir fourni un excellent contenu, des suggestions et des commentaires !
OUVRE TOUT FERME TOUT
Elevator Pitch pour la Pharma et la Biotech :
JMP Genomics vous aide à explorer visuellement et de manière interactive des populations de cellules complexes et rares, à détecter les modèles d'expression génique différentiels entre les types de cellules grâce à l'analyse de regroupement, à établir le profil des changements transcriptionnels dans les cellules immunitaires pour aider à développer des vaccins ou des traitements, et à découvrir la dynamique évolutive de la progression tumorale et des métastases. , et la résistance au traitement. Avantages concurrentiels : Analyses visuelles et interactives simples et avancées en un seul endroit sans programmation.
Elevator Pitch pour les sélectionneurs de plantes et les bioscientifiques des cultures :
S'appuyant sur une base de recherche agronomique et d'algorithmes de pointe, les cycles de sélection à rythme élevé exécutés dans JMP Genomics permettent aux sélectionneurs de plantes et aux bioscientifiques des cultures de piloter la sélection de cultures plus saines en modélisant la variabilité génétique, en optimisant les choix de sélection, en simulant des programmes de sélection à caractères multiples et en équilibrant compromis entre les principaux traits souhaitables. Avantages concurrentiels : Analyses visuelles et interactives simples et avancées en un seul endroit sans programmation.
Quels sont les mots/phrases clés que je devrais écouter et qui indiqueraient un prospect potentiel pour JMP Genomics ?
- Données de séquençage de nouvelle génération (NGS)
- Études d'association à l'échelle du génome (GWAS)
- Sélection rapide des cultures
- Séquençage d'ARN unicellulaire
- Variante d'association
- Protéomique ou Métabolomique
Quelles sont les questions courantes que je peux poser pour qualifier un prospect JMP Genomics ?
Pharma/Biotech
- Effectuez-vous un séquençage de cellule unique pour des études d'immunologie ou d'oncologie ?
- Évaluez-vous l'efficacité des vaccins?
- Vos analyses pharmacogénomiques sont-elles reproductibles ?
- Essayez-vous d'optimiser vos dosages ou vos tests de diagnostic ?
Entreprises agricoles
- Votre entreprise est-elle impliquée dans la sélection génomique avec vos programmes de sélection ?
- Essayez-vous d'améliorer le rendement des cultures?
- Vous rencontrez des difficultés pour optimiser vos programmes d'élevage ?
- Améliorer la résistance aux maladies?
- Êtes-vous en mesure d'inclure tous les traits souhaitables dans vos programmes d'élevage ?
- Êtes-vous intéressé par l'enregistrement de nouvelles plantes?
Quels sont les différents types de données généralement analysés dans JMP Genomics ?
Description générale : données sur l'ADN, l'ARN, les métabolites et les protéines
Données de la puce génétique - Geoff fournira la liste.
- Données de séquençage d'ARN unicellulaire
- Données d'expression
- Micropuce
- ARN-seq
- Données de séquençage de nouvelle génération
- Données de variante
- Données de séquence génétique alignées (toutefois, JMP G NE traite PAS les données de séquence brutes)
- Études d'association à l'échelle du génome
- Pas seulement des données génomiques : protéomique (protéines), métabolomique (métabolites)
- Pour plus d'informations à ce sujet, reportez-vous à page des capacités de base.
Quels sont les principaux avantages de JMP Genomics ?
- Dans l'ensemble, JMP Genomics peut améliorer la reproductibilité de vos analyses avec des données de génomique, de protéomique et de métabolomique.
- JMP Genomics est très efficace pour analyser des données à haut débit et de grande dimension.
- Améliorez vos analyses de données de séquençage d'ARN unicellulaire.
- Améliorez vos analyses de diversité génétique et appliquez la sélection génomique à vos programmes de sélection végétale.
- Utilisez les meilleures méthodes d'analyse prédictive et d'apprentissage automatique pour les données de séquençage de nouvelle génération.
- Utilisez le logiciel leader pour analyser les données d'expression des puces à ADN.
Quel type d'organisations ou d'entreprises utilise JMP Genomics ?
Quel type de rôles/titres/personas est le public cible de JMP Genomics ?
- Sélectionneurs de plantes (webdiffusion)
- Scientifiques des cultures ( Blog)
- Généticiens quantitatifs
- Scientifiques translationnels (Blog)
- Scientifiques en bioinformatique
- Scientifiques des biomarqueurs
- Chercheurs scientifiques
- Biologistes
- Biochimistes
- Biologistes moléculaires
- Généticiens
- Statisticiens
- Épidémiologistes
- Médecin
À quoi ressemble un flux de travail typique pour les utilisateurs ?
Afin de faire une expérimentation scientifique reproductible, vous devez suivre un certain protocole d'étapes. Les workflows principaux/les plus courants pour JMP Genomics sont les workflows "Basic Expression", "Basic RNA-seq", "Basic Copy Number" et "Basic Tuling" qui suivent principalement les étapes suivantes avec les données :
- 1. Contrôle de la qualité (les données sont-elles exactes ?)
- 2. Normalisation (est-ce des pommes avec des pommes ?)
- 3. Conception et modèle expérimentaux (comment votre conception est-elle présentée ?)
- 4. Expression différentielle (Comment les gènes s'expriment différemment/changent ?)
- 5. Annotation (Identifier les gènes avec de grandes différences)
Combien coûte JMP Genomics ?
- JMP Genomics coûte 14 900 $ pour FYF (identique à JMP Clinical et JMP Pro)
- Remises sur volume disponibles.
- Veuillez vous référer au Page de tarification de JMP Genomics pour les dernières informations.
JMP Genomics possède-t-il toutes les fonctionnalités de JMP Pro ?
JMP Genomics est basé sur JMP Pro. Les fonctionnalités sont accessibles via les menus, mais nous n'avons pas intégré ces fonctionnalités dans les processus, l'interface et les méthodes de modélisation prédictive de JMP Genomic.
Quand JMP Genomics n'est-il pas adapté à la génomique ?
- Analyse bioinformatique
- Traitement des séquences brutes
- Alignements de séquence
- Détection de variantes rares
- Analyse de réseau
- Analyse des voies (sauf pour l'analyse de l'enrichissement de l'ensemble de gènes, GSEA)
- Analyse par petit panel d'expression (qPCR ou petits microréseaux ciblés)
Ces types de panels comptent environ quelques centaines de gènes et sont généralement déjà analysés. JMP ou JMP Pro peut être le meilleur selon le besoin (DOE pour l'optimisation du panel, la création et le déploiement de modèles prédictifs, l'évaluation du panel, les résultats d'un DOE pour trouver les facteurs significatifs puis le processus d'optimisation)
Quels sont les principaux concurrents de JMP Genomics ?
Hélice dorée
- A moins d'analyses.
- A moins de visualisations statistiques.
- Problème potentiel : dispose d'une succursale de services pour effectuer le travail pour le client
Partek
- A moins d'analyses, n'autorise que les modèles jusqu'à 2 facteurs. Ex : vous pouvez comparer les différences d'expression entre les hommes et les femmes, et entre le contrôle, le traitement 1 et le traitement 2. JMPG permet de nombreux facteurs. Ex : en plus de la comparaison des sexes et de la comparaison des traitements, nous pouvons également inclure des groupes d'âge, des groupes de régime, etc. Autant de facteurs que nécessaire.
- A moins de visualisations statistiques
- Problème potentiel : un pipeline complet permet à Partek d'effectuer un alignement de séquence, ce que JMP ne peut pas faire.
BioPython
- Sujets aux erreurs, les programmeurs créent un code unique.
- Pas de support technique
- Problème potentiel : les dernières méthodes d'apprentissage automatique sont disponibles plus tôt que JMPG
R Bioconducteur
- Sujets aux erreurs, les programmeurs créent un code unique.
- Pas de support technique.
- Les dernières méthodes d'apprentissage automatique sont disponibles plus tôt que JMPG
Qiagen Omnisoft et Workbench Solutions (Geoff pour ajouter des notes) Aglient GeneSpring (Geoff pour ajouter des notes)
Où JMP Genomics est-il installé ?
Doit être installé sur un PC local (Windows) dans un environnement virtualisé (similaire à JMP et JMP Pro).
Que dois-je faire si j'ai un bon candidat pour JMP Genomics ?
- Découvrez s'ils ont un budget.
- Découvrez s'ils ont le bon type de données. Données de séquence d'ARN/ADN alignées, généralement. Les données de métabolomique et de protéomique n'ont pas besoin d'être alignées.
- Programmez la démo.
Y a-t-il des exemples de ventes gagnées pour JMP Genomics pour que je me renseigne ?
Vous pouvez en savoir plus sur les ventes remportées par JMP Genomics en vous référant au
liste des ventes gagnées ici et en utilisant Control + F pour trouver les gains de la génomique.
Qui présente généralement les démos JMP Genomics ?
Certains SE sont capables de faire leurs propres démos JMP Genomics à un niveau d'introduction. Si nécessaire, votre SE travaillera avec Chris Kirchberg ou Valerie Nedbal pour préparer la démo. S'ils ont encore besoin de plus de soutien, Chris ou Valérie aideront avec la démo. S'ils ne sont pas disponibles, Luciano pourra vous aider.
Quelles ressources JMP Genomics puis-je proposer à un prospect ou à un client ?
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