JMP 유전체학 10 JMP 제품군의 최신 소프트웨어 릴리스가 출시되었습니다. 번식주기를 가속화하는 데 관심이있는 식물 육종가 또는 작물 과학자이거나 단일 세포 RNA-Seq 실험 분석에 관심이있는 번역 과학자 인 경우 새로운 분석을 이용할 수 있습니다.
JMP Genomics 10에서는 가장 정교한 도구 세트를 사용하여 과학적 문제를 해결하는 데 도움이되는 방법을 배우기 위해 드라이브를 테스트 할 수 있습니다.
먼저 새로운 기능 중 일부를 살펴 보겠습니다.
번역 과학
성좌도를 사용하여 유전자의 관계를 시각화합니다.
번역 과학자들은 새로운 Basic Single-Cell RNA-Seq 워크 플로우를 통해 많은 가치를 얻을 수 있습니다. 이를 통해 단일 세포 RNA-Seq 데이터 세트에 대한 표준 탐색을 수행하여 세포 수준에서 유전자 발현 패턴을 분석하여 차등 발현을 나타내는 세포 유형 클러스터를 쉽게 식별 할 수 있습니다. 이 새로운 기술은 면역학 및 종양학 연구에 특히 유용합니다. 또한 Feature-Barcode Matrices 수입업자, Variable Gene Selection 및 Dimension reduction embedding 방법 (t-SNE 및 UMAP)은 단일 세포 RNA-Seq 분석에 도움이되는 새로운 기능입니다. 데모에 관심이 있다면 Meijian Guan의 프레젠테이션을 확인하십시오. JMP 유전체학을 사용하여 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터 분석 .
그러나 JMP Genomics가 그의 과학적 연구를 얼마나 흥미롭게 하는지를 Meijian의 말로 받아들이지 마십시오. JMP Genomics가 제공하는 내용을보다 완벽하게 이해하려면 최신 간행물을보십시오. 번역 과학자 백신의 효능 평가 혈액 기반 바이오 마커 (및 후속 분석) 예측 유방암 식별 , 또는 특허 출원 피부 흑색 종 진단 , JMP Genomics는 사용자의 다양한 데이터 과학 도구에 새로운 기본 단일 세포 RNA-Seq 워크 플로우를 추가합니다.
농업 연구
JMP Genomics에 Population Admixture를 추가하면 통계 유전 학자들이 게놈 전체 연관 연구 (GWAS)의 유전 적 다양성을 설명하기 위해 조상의 기원을 추정하기위한 떨림에 또 다른 화살표를 제공합니다. 농업 연구의 경우, 게놈 선택 모델 업데이트는 교차 평가 및 자손 시뮬레이션을 향상시켜 고속 번식주기를 수행하여 유전자 변동성을 모델링하여보다 건강한 작물을 선택할 수 있도록합니다. 그만큼 최신 비디오 Luciano da Costa e Silva의 새로운 기능에 대해 설명합니다. 최신 소프트웨어에 대한 자세한 내용은 Kelci Miclaus 박사의 JMP On Air 세그먼트를 확인하십시오. JMP 유전체학을 이용한 식물 육종 .
이러한 새로운 분석 및 도구를 통해 과학자들은보다 강력한 작물을 가속화했습니다 (예 : hexaploidy 겨울 밀에서 질병 저항을 찾고 ) USDA National Small Grains Collection은 동물 및 인간 식품 공급을위한 다양한 곡물 학술 연구자들은 새로운 흰 강낭콩 식물 등록 높은 종자 수율과 곰팡이 및 내마모성을 결합합니다. 이 모든 프로젝트의 공통점은 무엇입니까? JMP Genomics에만 존재하는 수준의 소프트웨어 정교함.
JMP Genomics 10에서 제공하는 도구
이번 JMP Genomics 릴리스는 SAS, R 및 Python에보다 편리하게 액세스 할 수 있도록하는 최신 단계입니다. JMP Pro 15.1 및 SAS 9.4M6과 함께이 릴리스에는 새로운 모델 요약 및 Ensemble 유틸리티를 포함한 예측 모델링 기능이 향상되어 바이오 마커 검색을위한 기계 학습 응용 프로그램이 향상되었습니다. 새로운 애드 인 루틴은 널리 사용되는 R 및 Python 패키지를 통해 Genomic Bayesian 및 XGBoost 모델을 지원합니다.
이러한 모든 발전은 JMP 생명 과학 R & D 책임자 인 Russ Wolfinger가 이끄는 최고의 과학자 팀에 의해 가능해졌습니다. 그의 2012 년 미국 과학 발전 협회 선출 임상 시험 및 유전체학 분석에 다양한 모델을 적용하고 통계 분석의 다른 많은 영역에 대한 연구를 통해 그의 업적을 뒷받침합니다. 그의 가장 최근의 찬사는 Kaggle 대회에서 왔습니다. 가장 주목할만한 것은 몇 주 전에 개인 리더 보드에서 COVID-19의 글로벌 예측 . 그의 JMP 온에어 인터뷰 Kaggle 수상자로부터 얻은 교훈 , 이러한 경쟁에 대한 그의 경험에 대한 자세한 내용을 제공합니다.
최신 버전을 살펴보십시오 JMP 유전체학 .
