JMP Genomics 10 , die neueste Softwareversion in der JMP-Produktfamilie, ist da und es gibt viel zu freuen. Wenn Sie ein Pflanzenzüchter oder Pflanzenwissenschaftler sind, der an der Beschleunigung von Brutzyklen interessiert ist, oder ein Translationswissenschaftler, der an der Analyse von Einzelzell-RNA-Seq-Experimenten interessiert ist, stehen Ihnen neue Analysen zur Verfügung.
In JMP Genomics 10 können Sie mit den modernsten Tools eine Probefahrt durchführen, um zu erfahren, wie Sie Ihre wissenschaftlichen Probleme lösen können.
Schauen wir uns zunächst einige der neuen Funktionen an.
Translationale Wissenschaft
Visualisieren Sie die Beziehungen von Genen mithilfe von Konstellationsdiagrammen.
Translationale Wissenschaftler werden viel Wert auf den neuen Basic Single-Cell RNA-Seq-Workflow legen. Mit dieser Funktion können Sie eine Standardexploration für einen Einzelzell-RNA-Seq-Datensatz durchführen, um Genexpressionsmuster auf zellulärer Ebene zu analysieren und so die Identifizierung von Zelltypclustern zu erleichtern, die eine unterschiedliche Expression aufweisen. Diese neue Technologie ist besonders nützlich in immunologischen und onkologischen Studien. Darüber hinaus sind ein Importeur von Feature-Barcode-Matrizen, variable Genauswahl und Einbettungsmethoden zur Dimensionsreduktion (t-SNE und UMAP) neue Funktionen zur Unterstützung der Einzelzell-RNA-Seq-Analyse. Wenn Sie an einer Demo interessiert sind, lesen Sie unbedingt die Präsentation von Meijian Guan. Analyse von Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten mit JMP Genomics .
Aber nehmen Sie nicht nur Meijians Wort dafür, wie interessant JMP Genomics seine wissenschaftliche Forschung macht. Schauen Sie sich einige aktuelle Veröffentlichungen an, um ein umfassenderes Verständnis der Funktionen von JMP Genomics zu erhalten. Für Übersetzungswissenschaftler, die es sind Bewertung der Wirksamkeit von Impfstoffen Vorhersage von blutbasierten Biomarkern (und eines anschließenden Assays) für Identifizierung von Brustkrebs , oder Anmeldung von Patenten an Hautmelanom diagnostizieren , JMP Genomics erweitert das Arsenal der Data Science-Tools der Benutzer um einen neuen Basic Single-Cell RNA-Seq-Workflow.
Agronomische Forschung
Die Hinzufügung von Population Admixture zu JMP Genomics gibt statistischen Genetikern einen weiteren Pfeil in ihrem Köcher zur Abschätzung der Herkunft der Vorfahren, um die genetische Vielfalt in genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) zu berücksichtigen. Für die agronomische Forschung verbessern Aktualisierungen des Genomselektionsmodells die Kreuzbewertungs- und Nachkommensimulationen, um schnelle Zuchtzyklen durchzuführen, und unterstützen die Auswahl gesünderer Pflanzen durch Modellierung der genetischen Variabilität. Das neuestes Video von Luciano da Costa e Silva beschreibt diese neuen Funktionen. Weitere Informationen zu unserer Software finden Sie im JMP On Air-Segment von Dr. Kelci Miclaus: Pflanzenzüchtung mit JMP Genomics .
Mit diesen neuen Analysen und Werkzeugen haben Wissenschaftler robustere Pflanzen beschleunigt (zum Beispiel wenn auf der Suche nach Krankheitsresistenz bei Hexaploidie-Winterweizen ) hat die USDA National Small Grains Collection diversifiziertes Getreide für die Versorgung mit tierischen und menschlichen Nahrungsmitteln und akademische Forscher haben registrierte neue weiße Kidneybohnenpflanzen die hohe Samenerträge mit Schimmel- und Seuchenresistenz verbinden. Was haben all diese Projekte gemeinsam? Ein Grad an Software-Raffinesse, der nur in JMP Genomics vorhanden ist.
Die Tools, die Sie in JMP Genomics 10 erhalten
Diese Version von JMP Genomics ist der neueste Schritt in Richtung unseres Versprechens, einen bequemeren Zugriff auf SAS, R und Python zu ermöglichen. Mit JMP Pro 15.1 und SAS 9.4M6 bietet die Version Verbesserungen bei der prädiktiven Modellierung, einschließlich einer neuen Modellzusammenfassung und eines neuen Ensemble-Dienstprogramms zur Verbesserung der Anwendungen für maschinelles Lernen für die Erkennung von Biomarkern. Neue Add-In-Routinen ermöglichen auch Genomic Bayesian- und XGBoost-Modelle über beliebte R- und Python-Pakete.
All diese Fortschritte werden von einem Team erstklassiger Wissenschaftler unter der Leitung von Russ Wolfinger, JMP Life Sciences Director of R & D, ermöglicht. Seine Wahl in die American Association for the Advancement of Science im Jahr 2012 stützt seine Leistungen auf die Anwendung gemischter Modelle auf klinische Studien und Genomanalysen sowie auf die Forschung in vielen anderen Bereichen der statistischen Analyse. Seine jüngsten Auszeichnungen stammen von Kaggle-Wettbewerben, insbesondere vor wenigen Wochen, als er den ersten Platz in der privaten Rangliste für belegte globale Prognose von COVID-19 . Sein JMP On Air Interview, Lehren aus einem Kaggle-Gewinner gibt weitere Einzelheiten zu seinen Erfahrungen mit diesen Wettbewerben.
Schauen Sie sich die neueste Version von an JMP Genomics .
