Hallo zusammen,
Ich bin ein Biomedizin-Doktorand und vermute, dass ein bestimmter Zelltyp mit unterschiedlicher Dauer der medikamentösen Behandlung zunimmt (z. B. Vergleich der PBS-Kontrolle mit Tag 12 der Behandlung und Tag 19 der Behandlung). Ich habe JMP pro12 verwendet und ein Standardmodell der kleinsten Quadrate ausgeführt. Um dies zu testen, habe ich zwei Experimente durchgeführt und den Experimentcode als Zufallseffekt festgelegt. Der andere Effekt ist die Behandlung.
Ich schaue mir den Test mit fester Wirkung -> Wirkungsdetails -> LS bedeutet Unterschiede Tukeys HSD -> Bericht über geordnete Unterschiede an, um zu sehen, ob sich die Behandlungen erheblich unterscheiden. Der Fixed-Effect-Test hat einen Punkt anstelle des ap-Werts in der Spalte prob>f, und es gibt auch Punkte in den Spalten Unterer CL/Oberer CL. Ich bin mir daher nicht sicher, ob ich dem p-Wert (<0,0001) Glauben schenken soll.
Ich denke, das könnte mit dem Fehler „Konvergenz fraglich: Iterationen überprüfen“ zu tun haben?
Wissen Sie, wie man das beheben kann? Kann ich den p-Werten vertrauen und sagen, dass es signifikante Unterschiede zwischen allen meinen Gruppen gibt, oder sind meine Daten für diesen Test nicht geeignet?
Vielen Dank!
Emma


Wirklich hilfreich, vielen Dank. Ich habe vom technischen Support von JMP die folgende Antwort erhalten, die meiner Meinung nach meine Frage beantwortet hat:
Hallo Emma,
Ihre Frage bezüglich der fehlgeschlagenen Konvergenz wurde an den technischen Support von JMP weitergeleitet.
Bei der Untersuchung Ihres Modells sind mir einige Dinge aufgefallen:
Bei der letzten Iteration war die Schätzung der Varianzkomponente für Expt negativ, was darauf hindeutet, dass es möglicherweise nicht genügend Beweise für die Variabilität zwischen Expts gibt, um diesen zufälligen Effekt zu modellieren.
Tatsächlich scheint es bei der Darstellung der Daten keine offensichtlichen Hinweise auf einen Unterschied zwischen den Expts zu geben. Die Grafik verdeutlicht auch die Unsicherheit der Schätzungen für die Behandlungskombinationen, in denen es nur wenige Datenzeilen gibt.

Ich denke, dass dies die Ursache für die Instabilität und das Scheitern einer Lösung ist.
Beachten Sie, dass das Modell zu einer Lösung konvergiert, bei der die Expt-Zufallseffektvarianz auf Null geschätzt wird, wenn Sie im Modelldialog die Option „Unbegrenzte Varianzkomponenten“ deaktivieren (die VCs binden).
Dieses Modell wäre äquivalent zu dem Modell, bei dem Sie den Expt-Zufallseffekt entfernen und nur den festen Behandlungseffekt anpassen. Ich denke, das wäre hier ein vernünftiger Ansatz.
Ich hoffe, diese Informationen sind hilfreich. Bitte teilen Sie mir mit, wenn Sie weitere Fragen haben oder eine Klärung benötigen.
Danke,
Adam Morris
Technischer JMP-Support