运行标准最小二乘混合模型时，为什么会出现“收敛有问题：检查迭代”？大家好，
我是一名生物医学博士生，并假设特定细胞类型随着药物治疗时间的不同而增加（例如，将 PBS 对照与治疗第 12 天和第 19 天进行比较）。 我使用了 JMP pro12 并运行了标准最小二乘模型。 我进行了两个实验来测试这一点，并将实验代码设置为随机效应。 另一个作用是治疗。
我正在查看固定效果测试 -> 效果详细信息 -> LS 表示差异 Tukeys HSD -> 有序差异报告，以查看处理是否显着不同。 固定效应检验在 prob>f 列中有一个点而不是 ap 值，并且 Lower CL/Upper CL 列中也有点。 因此，我不确定是否相信 p 值（<0.0001）。
我认为这可能与“收敛有问题：检查迭代”错误有关？
你知道如何解决这个问题吗？ 我是否可以相信 p 值并说我的所有组之间存在显着差异，或者我的数据不适合此测试？
多谢！
艾玛
回复：为什么在运行标准最小二乘混合模型时会出现“收敛有问题：检查迭代”？这一切都有道理，艾玛。
回复：为什么在运行标准最小二乘混合模型时会出现“收敛有问题：检查迭代”？真的很有帮助，非常感谢。 我收到 JMP 技术支持的以下回复，我认为它已经回答了我的问题：
嗨艾玛，
您有关收敛失败的问题已转交给 JMP 技术支持。
在检查你的模型时，我注意到了一些事情：
在最后一次迭代中，Expt 的方差分量估计值为负，这表明 Expt 之间可能没有足够的变异证据来对随机效应进行建模。
事实上，在绘制数据时，似乎没有明显的证据表明 Expt 之间存在任何差异。 该图还强调了只有几行数据的治疗组合估计的不确定性。
我认为这就是不稳定和无法收敛到解决方案的原因。
请注意，如果您在模型对话框中取消选择“无界方差分量”（绑定 vc），则模型将收敛到 Expt 随机效应方差估计为零的解。
该模型相当于删除 Expt 随机效应并仅拟合固定治疗效应的模型。 我认为这是一个合理的方法。
我希望这些信息对你有用。 如果您有后续问题或需要澄清，请告诉我。
谢谢，
亚当·莫里斯
JMP 技术支持
回复：为什么在运行标准最小二乘混合模型时会出现“收敛有问题：检查迭代”？其他一些想法：
1. 在 JMP，我们总是说您应该在进行统计分析之前绘制数据。 我们为此设计了 JMP。 当您绘制您的反应与治疗的图表时，看起来是否存在很大差异？ 数据看起来合理吗？ 有什么奇怪的异常值吗？
2. 我想绘制响应的分布图。 从快速查看表格的屏幕截图来看，它似乎在数量级上变化。 因此响应的转换可能对建模有用。回复：为什么在运行标准最小二乘混合模型时会出现“收敛有问题：检查迭代”？嗨艾玛，
如果您能附上 JMP 数据表将会有所帮助。
我想知道 Treatment 和 Expt 之间的相关性，如果您可以提供 JMP 表，那么探索这一点会容易得多。
谢谢，
菲尔
