在運行標準最小平方法混合模型時，為什麼會出現「收斂有問題：檢查迭代」？大家好，
我是一名生物醫學博士生，並假設特定細胞類型隨著藥物治療時間的不同而增加（例如，將 PBS 對照與治療第 12 天和第 19 天進行比較）。 我使用了 JMP pro12 並運行了標準最小二乘模型。 我進行了兩個實驗來測試這一點，並將實驗程式碼設定為隨機效應。 另一個作用是治療。
我正在查看固定效果測試 -> 效果詳細資訊 -> LS 表示差異 Tukeys HSD -> 有序差異報告，以查看處理是否顯著不同。 固定效應檢定在 prob>f 列中有一個點而不是 ap 值，且 Lower CL/Upper CL 列中也有點。 因此，我不確定是否相信 p 值（<0.0001）。
我認為這可能與“收斂有問題：檢查迭代”錯誤有關？
你知道如何解決這個問題嗎？ 我是否可以相信 p 值並說我的所有組之間存在顯著差異，或者我的數據不適合此測試？
多謝！
艾瑪
回覆：為什麼在運行標準最小平方法混合模型時會出現「收斂有問題：檢查迭代」？這一切都有道理，艾瑪。
回覆：為什麼在運行標準最小平方法混合模型時會出現「收斂有問題：檢查迭代」？真的很有幫助，非常感謝。 我收到 JMP 技術支援的以下回复，我認為它已經回答了我的問題：
嗨艾瑪，
您有關收斂失敗的問題已轉交給 JMP 技術支援。
在檢查你的模型時，我注意到了一些事情：
在最後一次迭代中，Expt 的變異數分量估計值為負，這表明 Expt 之間可能沒有足夠的變異證據來對隨機效應進行建模。
事實上，在繪製數據時，似乎沒有明顯的證據表明 Expt 之間存在任何差異。 該圖還強調了只有幾行數據的治療組合估計的不確定性。
我認為這就是不穩定和無法收斂到解決方案的原因。
請注意，如果您在模型對話方塊中取消選擇「無界方差分量」（綁定 vc），則模型將收斂到 Expt 隨機效應變異數估計為零的解。
此模型相當於刪除 Expt 隨機效應並僅擬合固定治療效應的模型。 我認為這是一個合理的方法。
我希望這些資訊對你有用。 如果您有後續問題或需要澄清，請告訴我。
謝謝，
亞當·莫里斯
JMP 技術支持
回覆：為什麼在運行標準最小平方法混合模型時會出現「收斂有問題：檢查迭代」？其他一些想法：
1. 在 JMP，我們總是說您應該在進行統計分析之前繪製資料。 我們為此設計了 JMP。 當您繪製您的反應與治療的圖表時，看起來是否有很大差異？ 數據看起來合理嗎？ 有什麼奇怪的異常值嗎？
2. 我想繪製響應的分佈圖。 從快速查看表格的螢幕截圖來看，它似乎在數量級上變化。 因此響應的轉換可能對建模有用。回覆：為什麼在運行標準最小平方法混合模型時會出現「收斂有問題：檢查迭代」？嗨艾瑪，
如果您能附上 JMP 資料表將會有所幫助。
我想知道 Treatment 和 Expt 之間的相關性，如果您可以提供 JMP 表，那麼探索這一點會容易得多。
謝謝，
菲爾
