표준 최소 제곱 혼합 모델을 실행할 때 "수렴 문제 있음: 반복 확인"이 나타나는 이유는 무엇입니까?안녕하세요 여러분,
저는 생물의학 박사과정 학생이고, 특정 세포 유형이 다양한 약물 치료 기간에 따라 증가한다는 가설을 세웁니다(예: PBS 대조를 치료 d12와 치료 d19와 비교). 저는 JMP pro12를 사용하고 표준 최소 제곱 모델을 실행했습니다. 이를 테스트하기 위해 두 가지 실험을 진행했고, 실험 코드를 랜덤 효과로 설정했습니다. 또 다른 효과는 치료입니다.
고정 효과 테스트 -> 효과 세부 사항 -> LS는 Tukeys HSD의 차이를 의미합니다. -> 순서 차이 보고서를 보고 치료법이 크게 다른지 확인하고 있습니다. 고정 효과 검정은 prob>f 열에 p 값 대신 점이 있고, Lower CL/Upper CL 열에도 점이 있습니다. 따라서 p-값(<0.0001)을 믿어야 할지 잘 모르겠습니다.
이것이 "수렴 문제: 반복 확인" 오류와 관련이 있을 수 있다고 생각합니까?
이 문제를 해결하는 방법을 알고 있나요? p 값을 신뢰하고 모든 그룹 간에 상당한 차이가 있다고 말할 수 있습니까? 아니면 내 데이터가 이 테스트에 적합하지 않습니까?
정말 감사합니다!
엠마
Re: 표준 최소 제곱 혼합 모델을 실행할 때 "수렴 문제 있음: 반복 확인"이 나타나는 이유는 무엇입니까?다 말이 되는군요, 엠마.
Re: 표준 최소 제곱 혼합 모델을 실행할 때 "수렴 문제 있음: 반복 확인"이 나타나는 이유는 무엇입니까?정말 도움이 되었습니다. 정말 감사합니다. 내 질문에 대해 JMP 기술 지원팀으로부터 다음과 같은 답변을 받았습니다.
안녕 엠마,
수렴 실패에 대한 귀하의 질문이 JMP 기술 지원팀에 전달되었습니다.
귀하의 모델을 검토하면서 몇 가지 사실을 발견했습니다.
마지막 반복에서 Expt에 대한 분산 구성 요소 추정치는 음수였으며 이는 해당 무작위 효과를 모델링하기 위한 Expt 간의 변동성에 대한 증거가 충분하지 않을 수 있음을 나타냅니다.
실제로 데이터를 플롯할 때 Expt 간의 차이에 대한 명백한 증거는 없는 것 같습니다. 그래프는 또한 소수의 데이터 행만 있는 치료 조합에 대한 추정치의 불확실성을 강조합니다.
이것이 불안정성과 해결책으로의 수렴 실패의 원인이라고 생각합니다.
모델 대화 상자(vc에 바인딩됨)에서 "무제한 분산 구성 요소"를 선택 취소하면 모델은 Expt 무작위 효과 분산이 0으로 추정되는 솔루션으로 수렴됩니다.
해당 모델은 Expt 무작위 효과를 제거하고 고정 처리 효과만 맞추는 모델과 동일합니다. 나는 이것이 합리적인 접근 방식이라고 생각합니다.
이 정보가 도움이 되기를 바랍니다. 후속 질문이 있거나 설명이 필요한 경우 알려주시기 바랍니다.
감사해요,
아담 모리스
JMP 기술 지원
Re: 표준 최소 제곱 혼합 모델을 실행할 때 "수렴 문제 있음: 반복 확인"이 나타나는 이유는 무엇입니까?몇 가지 다른 아이디어:
1. JMP에서는 통계 분석을 시작하기 전에 데이터를 그려야 한다고 항상 말합니다. 우리는 이를 위해 JMP를 설계했습니다. 반응과 치료를 그래프로 표시하면 큰 차이가 있는 것처럼 보입니까? 데이터가 합리적으로 보입니까? 이상한 특이점이 있나요?
2. 응답 분포를 플롯하고 싶습니다. 테이블의 스크린샷을 간략히 살펴보면 크기가 수십 배에 걸쳐 변화하는 것 같습니다. 따라서 반응의 변환은 모델링에 유용할 수 있습니다.Re: 표준 최소 제곱 혼합 모델을 실행할 때 "수렴 문제 있음: 반복 확인"이 나타나는 이유는 무엇입니까?안녕 엠마,
JMP 데이터 테이블을 첨부하면 도움이 될 것입니다.
Treatment와 Expt 사이의 상관관계가 궁금합니다. JMP 테이블을 제공할 수 있다면 이를 탐색하는 것이 훨씬 쉬울 것입니다.
감사해요,
필
