你好，
我正在處理非常大的數據集，其中我們進行了許多不同的研究（study_id），在其中比較了各種“ test_article”與對照（即PBS）。這是在多個副本（subject_id）中完成的。在每個研究中，對於每個subject_id，我們都在對多達50000種不同類型的測量（蔬菜）進行測量。 每次測量的結果均以log2的形式報告（通過同一項研究的對照組平均值對特定受試者的測量值進行標準化，但我認為測量的性質並不那麼重要）。
在一個小的數據集上，我將對每個蔬菜進行單向方差分析（每個研究一個），以比較治療效果（test_article），然後再進行Dunnett的治療。在大數據上，由於兩個原因（多次測量-因此需要進行FDR）似乎變得難以處理，並且無法（即不知道如何）僅報告p值並繞過圖形階段（這不切實際）對於那麼多的測試）。
“響應篩選”似乎是一個更好的選擇，但是缺少定義參考對照組的選項，因為我對知道測試文章A是否優於B感興趣，而僅當test_article中的任何一個與測試文章不同時才感興趣。控制。
最後，我希望能夠對該過程進行編碼以提高可重複性。
我已經附上了數據集的一個玩具示例。
任何建議將不勝感激。
塞巴斯蒂安
