Combinación de datos de dos ensayosHola,
Por favor, ¿podría obtener consejos para analizar el siguiente conjunto de datos? En un ensayo, los animales recibieron alimento en diferentes formas (redondo frente a cuadrado) y concentraciones (100, 80, 60%). Esto se probó dos veces (Prueba 1 y Prueba 2: todo se mantuvo similar entre ambas pruebas). Los animales se mantienen en corrales, por lo que cada parámetro de rendimiento (peso corporal, etc.) se mide como un promedio del corral.
Quiero combinar los resultados de los Ensayos 1 y 2 y determinar los efectos de:
Ensayo
Formulario de alimentación
Concentración de alimentación
Tratamiento
Edad
Bolígrafo
¿Alguien puede aconsejarme si Pen y Trial deben considerarse efectos aleatorios? Son los tres efectos que he destacado los que más me interesan. Intenté ejecutar el análisis, pero mis resultados hasta ahora no tienen mucho sentido, por lo que agradecería cualquier ayuda. Tengo JMP, no JMP Pro.
@Phil_Kay
Gracias
abbie
Re: Combinar datos de dos ensayosEs curioso cómo cuando comienzan estos análisis, siempre hay información que no se informa... Tenga en cuenta qué herramientas de análisis, qué preguntas puede responder, qué conclusiones puede sacar, su capacidad para extrapolar resultados, etc. TODO DEPENDE DE CÓMO ¡TÚ TIENES LOS DATOS!
La muestra de 32 aves es una muestra aleatoria de las aves dentro de cada corral. En realidad, no está rastreando el mismo conjunto de aves a lo largo del tiempo. ¿Es su sistema de medición preciso y estable? ¿Alguna vez midió el mismo pájaro a la misma edad más de una vez?
Primero, determinaría si la variación que ve en las variables de respuesta tiene un significado práctico. Luego haría un análisis multivariado de las Y múltiples. ¿Espera que alguna de las Y se correlacione (o no)? ¿Por qué?
El peso está altamente correlacionado con 1. Consumo de alimento, 2. FCR 3. Aumento de peso y 4. Uniformidad aunque algunos de los patrones en los datos son de interés.
Color/Marcar por columna: la edad expone que las relaciones se ven significativamente afectadas por la edad.
Hacer el análisis multivariante POR EDAD puede ser más esclarecedor. Ejemplo para Edad = 7
Matriz de diagrama de dispersión
Observe arriba que hay poca relación entre el peso y el consumo de alimento. Y Peso y FCR ahora están negativamente correlacionados.
Entiendo que probaste la concentración en 3 niveles, pero no por qué hiciste esto. Tienes más información sobre la concentración que sobre la forma. No es algo malo, solo hay que darse cuenta de que el estudio está sesgado.
Tiene algunas diferencias de prueba a prueba (particularmente con respecto a la variación dentro del tratamiento). Usted dice que los juicios "todo se mantuvo idéntico". Esto es, por supuesto, es imposible. La clave es comprender qué cambió entre los ensayos. Creo que deberías tratar el juicio como un bloque en el análisis. Y dado que no sabemos qué cambió entre los ensayos, asígnele un efecto aleatorio en el modelo. Dado que es probable que tenga algún conocimiento de que las aves aumentarán de peso a medida que envejecen, las preguntas son cómo los factores (concentración y forma) impactan el rendimiento (Y's). Si tuviera algunos datos históricos: peso sobre edad, podría ver el delta entre los efectos "históricos" y del tratamiento. Es posible que pueda ver la tasa de aumento de peso (pendiente de la línea). También parece que los efectos son diferentes a medida que las aves envejecen.
Intentaría ajustar el modelo POR EDAD.
Re: Combinar datos de dos ensayosHola,
Gracias por la respuesta.
Había 318 animales por corral, cada semana se pesan 32 aves por corral. Esto da la columna de "peso" de peso corporal.
Las hipótesis que quiero probar son:
¿La forma del alimento (redondo versus cuadrado) afecta el rendimiento (peso, FCR, uniformidad, ganancia de peso y consumo de alimento)?
¿La concentración de alimento afecta el rendimiento (como se indicó anteriormente)?
Hay 3 niveles de concentración porque se aplicaron tres niveles diferentes (100, 80 y 60%). En total hubo 6 tratamientos:
1. Gránulos redondos de concentración 100%
2. Gránulos cuadrados de concentración 100%
3. Gránulos redondos de concentración al 80%
4. Gránulos cuadrados de concentración al 80%
5. Gránulos redondos de concentración al 60%
6. Gránulos cuadrados de concentración al 60%
La misma prueba se repitió dos veces, con esta configuración, y todo se mantuvo idéntico. Lo que quiero medir son los efectos de la forma y la concentración del alimento en el rendimiento de las aves de ambos ensayos combinados, teniendo en cuenta la variación entre los ensayos. Me gustaría saber si los factores afectan el rendimiento y, de ser así, a qué edad ocurre.
Gracias,
abbie
Re: Combinar datos de dos ensayosAbbie, no veo nada con respecto a la importancia práctica. ¿Cuánto aumento de peso tiene valor científico? No veo una columna titulada peso corporal, así que supongo que el peso de la columna es el peso corporal.
Realmente no estoy seguro de qué preguntas está tratando de responder o qué hipótesis está investigando. No estoy muy seguro de cómo estás midiendo el peso. Me parece recordar que está promediando el peso por corral... Si va a calcular un promedio, también debe considerar la variación dentro del corral. ¿No está seguro de que el promedio sea la estadística adecuada? ¿Cuántos animales hay por corral? ¿Qué sucede si tiene un animal realmente grande y el resto pequeño? Entonces el promedio no es una medida apropiada de tendencia central.
Algunos de mis pensamientos:
1. Parece razonable que los animales aumenten de peso con la edad. ¿Cuál es la cantidad prevista de aumento de peso? O tal vez, ¿cuál es la cantidad histórica de aumento de peso con la edad?
2. También lo es su pregunta: ¿La concentración o forma del alimento afecta el aumento de peso (más allá del aumento de peso "normal")?
Graficar los datos es una excelente manera de comenzar. Adjunto un gráfico sencillo que muestra el peso por prueba y edad, codificado por pluma.
Peso vs. Edad (días) separados por Prueba
Obviamente, tiene una variación de bolígrafo a bolígrafo (puede haber un patrón sistemático aquí).
Mirando esa variación (dentro del tratamiento, por lo que no está influenciado por la concentración o la forma)
R de peso dentro del tratamiento
Tan obvias diferencias de edad y variación de pluma a pluma. No parece ser mucho debido a los factores que manipulaste, concentración y forma. Esto podría deberse a la configuración del nivel de esos factores (no estoy seguro de por qué eligió 3 niveles para la concentración a menos que predijera algún efecto no lineal) o no tienen ningún efecto.
Puede ajustar el modelo por edad para eliminar este gran efecto.
Re: Combinar datos de dos ensayosGracias @statman @DanP
Adjunté el archivo JMP e hice los cambios sugeridos.
He ejecutado un modelo mixto con Prueba y Pluma como efectos aleatorios, luego Forma, Concentración, Edad, Forma x Edad y Concentración x Edad en los datos. Cualquier otro parámetro (uniformidad, FCR, etc.) es una variable de respuesta.
He ejecutado esto en los datos de peso corporal y ahora el análisis tiene sentido para mí. ¿Estaría en lo correcto al interpretar eso para el peso corporal:
Hubo efectos significativos de todo excepto Edad x Forma. De los dos efectos aleatorios, "bolígrafo" tuvo un efecto significativo, pero "Prueba" no.
¿Es correcto mi análisis y es este el enfoque correcto a seguir, en lugar de un análisis de medidas repetidas? ¿Hay algún otro análisis que recomendarías?
Gracias
abbie
Re: Combinar datos de dos ensayosHaciéndose eco de Dan, ¿por qué no adjuntas el archivo JMP? En su archivo de Excel, hay varias columnas que no han sido definidas por su breve descripción. Debes definir cada columna (y si es una x o una ay). Para cada variable de respuesta, deberá proporcionar cuánto de un cambio en la métrica importa desde una perspectiva científica (importancia práctica).
Después de eso, estaremos encantados de echar un vistazo.
Re: Combinar datos de dos ensayosAntes de dar mi opinión a su pregunta, algunas cosas que noté en un vistazo muy rápido a sus datos.
¡Primero, introduzca sus datos en JMP! Los archivos de Excel son buenos, pero los archivos JMP son mejores, ¡especialmente cuando se trata de análisis! 
Noté que tienes más de 2 formas de alimentación. También tienes PRILL y POLVO. Estos parecen tipos de ensayos "complementarios", lo que significa que no formaban parte del diseño original. Asumiré que eliminará estas filas de la tabla ya que de todos modos no hay muchos datos en esos formularios.
Una vez que se han eliminado las perlas y el polvo, no es necesaria la columna de tratamiento. Es una combinación de Concentración y Forma. Por lo tanto, solo usar Concentración y Forma hace que el tratamiento sea redundante y no necesario.
Un efecto aleatorio es un efecto en el que la elección del nivel se elige al azar de un conjunto más grande. Me parece que Pen sería aleatorio. Tiene una gran selección de bolígrafos y los que se utilizan para estas pruebas se eligen al azar.
Prueba también suena como un efecto aleatorio para mí. Ciertamente podría hacer más senderos, por lo que los dos que ejecutó son una "selección" de un conjunto más grande.
Usted afirma que su análisis no tenía sentido. La comunidad estará mucho más equipada para ayudarlo si proporciona el archivo JMP con sus análisis y con preguntas más específicas sobre lo que no tiene sentido para usted.
Re: Combinar datos de dos ensayosDisculpas, se adjuntó el archivo incorrecto. Utilice este en su lugar.
Muchas gracias,
abbie
