細胞生長4P模型大家好,
我有一些細胞生長(哺乳動物)的時間過程數據,想擬合它們以獲得細胞分裂和死亡率。 JMP 在“擬合曲線”選項中有一個名為“細胞生長 4P”的內置模型,該模型似乎對我的大多數數據都運行良好。 然而,對於其中一組,該模型顯示出負分裂率和死亡率。 其他方面看起來很合身。 我對此有幾個問題:
1. 有沒有辦法使用“擬合曲線”功能設置參數範圍? 我想將上述兩個速率的下限設置為零,以避免遇到同樣的問題。
2. 我還嘗試了“非線性擬合”選項,因為它允許我指定參數限制。 然而,我嘗試輸入與上面的細胞生長 4P 相同的方程,但無法獲得與擬合曲線結果一樣好的擬合結果。 大多數時候,擬合參數似乎與初始輸入值相比變化很小。 我可以更改哪些設置來幫助解決此問題?
3. 順便說一句,我是否可以找到此細胞生長 4P 方程的文獻來源?
謝謝你!
回复:細胞生長 4P 模型感謝您的建議,我繼續向他們發送了一封包含一些示例數據的電子郵件。
回复:細胞生長 4P 模型您是否可以將顯示有問題的擬合的數據以及您使用的非線性模型發送給 JMP 技術支持( support@jmp.com )? 我向他們詢問了您遇到的行為,但他們沒有從他們的示例中看到這一點。
回复:細胞生長 4P 模型我在這裡附上嘗試之前和之後的情況。 我還包括使用“擬合曲線”選項的擬合效果。
奇怪的是,即使我輸入從擬合曲線結果導出的值,非線性擬合仍然會收斂到極不准確的擬合。 增加迭代次數不會產生任何作用,因為它似乎總是在第二次迭代時收斂。 我還嘗試降低收斂標準,但這也沒有幫助。
回复:細胞生長 4P 模型關於非線性平台 - 算法是否收斂於解決方案? 您可以嘗試增加最大迭代次數,或者放寬收斂標準;或者根據領域知識使用不同的起點。還有一個選項可以執行網格搜索來調查替代起點。