細胞増殖4Pモデルこんにちは、みんな、
細胞増殖 (哺乳類) の時間経過データがあり、それらを当てはめて細胞分裂と死亡率を取得したいと考えています。 JMP には、「Fit Curve」オプションに「Cell Growth 4P」という名前の組み込みモデルがあり、ほとんどのデータで非常にうまく機能するようです。 ただし、グループの 1 つについては、モデルは負の分裂率と死亡率を示しました。 それ以外の場合、フィット感はかなり良いようです。 これに関していくつか質問があります:
1. フィットカーブ機能を使用してパラメータ境界を設定する方法はありますか? 同じ問題が発生するのを避けるために、上記のレートの両方の下限をゼロに設定したいと思います。
2. パラメータ制限を指定できるため、非線形フィット オプションも試しました。 ただし、上記の Cell Growth 4P と同じ方程式を入力してみましたが、Fit Curve の結果ほど良好なフィットを得ることができませんでした。 ほとんどの場合、フィット パラメーターは初期入力値からほとんど変化しないように見えます。 これを解決するにはどの設定を変更すればよいでしょうか?
3. あまり関係のない話ですが、この細胞増殖 4P 方程式の文献情報源を見つけることはできますか?
ありがとう！
Re:細胞増殖4Pモデルご提案に感謝し、サンプル データを電子メールで送信しました。
Re:細胞増殖4Pモデル問題のある近似を示すデータと使用した非線形モデルを JMP テクニカル サポートに送信していただけますか ( support@jmp.com ）？ あなたが遭遇した行動について彼らに尋ねましたが、彼らは自分たちの例からそれを理解していませんでした。
Re:細胞増殖4Pモデルここに試みの前後を添付します。 また、[フィット カーブ] オプションを使用してフィットがどのように見えるかについても説明しました。
奇妙なことに、フィット カーブの結果から得られた値を入力したとしても、非線形フィットは依然として非常に不正確なフィットに収束してしまうのです。 常に 2 回目の反復で収束するように見えるため、反復回数を増やしても何も起こりません。 収束基準を下げてみましたが、それも役に立ちませんでした。
Re:細胞増殖4Pモデル非線形プラットフォームに関して - アルゴリズムは解決策に収束しましたか? 最大反復回数を増やすか、収束基準を緩和してみてください。あるいは、ドメイン知識に基づいて異なる開始点を使用します。グリッド検索を実行して代替の開始点を調査するオプションもあります。
