Modello 4P di crescita cellulareCiao a tutti,
Ho alcuni dati sull'andamento temporale della crescita cellulare (di mammifero) e vorrei adattarli per ottenere la divisione cellulare e il tasso di morte. JMP dispone di un modello integrato denominato "Cell Growth 4P" nell'opzione "Adatta curva" che sembra funzionare abbastanza bene per la maggior parte dei miei dati. Tuttavia, per uno dei gruppi, il modello ha mostrato divisioni e tassi di mortalità negativi. Per il resto la vestibilità sembra piuttosto buona. Ho alcune domande a riguardo:
1. Esiste un modo per impostare i limiti dei parametri con la funzione Adatta curva? Vorrei impostare i limiti inferiori per entrambi i tassi di cui sopra su zero per evitare di incorrere nello stesso problema.
2. Ho provato anche l'opzione Adattamento non lineare poiché mi consente di specificare i limiti dei parametri. Tuttavia, ho provato a inserire la stessa equazione di Cell Growth 4P sopra, ma non sono riuscito a ottenere che l'adattamento fosse buono quanto i risultati di Fit Curve. Nella maggior parte dei casi, i parametri di adattamento sembrano spostarsi molto poco dai valori di input iniziali. Quali impostazioni posso modificare per facilitare questa operazione?
3. Passando ad una nota meno correlata, posso comunque trovare la fonte bibliografica per questa equazione Cell Growth 4P?
Grazie!
Ri: Modello 4P per la crescita cellulareGrazie per il tuo suggerimento, sono andato avanti e ho inviato loro un'e-mail con alcuni dati di esempio.
Ri: Modello 4P per la crescita cellulareÈ possibile inviare i dati che mostrano l'adattamento problematico e il modello non lineare utilizzato al supporto tecnico JMP ( support@jmp.com )? Ho chiesto loro del comportamento che hai riscontrato ma non lo vedono con i loro esempi.
Ri: Modello 4P per la crescita cellulareAllego qui il prima e il dopo di un tentativo. Ho incluso anche l'aspetto dell'adattamento utilizzando l'opzione Adatta curva.
La cosa strana è che, anche se inserisco i valori derivati dai risultati della curva di adattamento, l'adattamento non lineare convergerebbe comunque in un adattamento estremamente impreciso. L'aumento del numero di iterazioni non fa nulla poiché sembra sempre convergere alla seconda iterazione. Ho anche provato a ridurre il criterio di convergenza, ma neanche questo aiuta.
Ri: Modello 4P per la crescita cellularePer quanto riguarda la piattaforma non lineare, l'algoritmo è convergente su una soluzione? Potresti provare ad aumentare il numero massimo di iterazioni o ad allentare i criteri di convergenza; in alternativa utilizzando diversi punti di partenza in base alla conoscenza del dominio.C'è anche un'opzione per eseguire una ricerca sulla griglia per indagare su punti di partenza alternativi.
