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Zellwachstum 4P-Modell

Hallo zusammen,

 

Ich habe einige Zeitverlaufsdaten des Zellwachstums (Säugetier) und möchte diese anpassen, um die Zellteilung und Sterberate zu ermitteln. JMP verfügt über ein integriertes Modell namens „Cell Growth 4P“ in der Option „Fit Curve“, das für die meisten meiner Daten ziemlich gut zu funktionieren scheint. Für eine der Gruppen zeigte das Modell jedoch negative Teilungs- und Sterberaten. Ansonsten sieht die Passform ziemlich gut aus. Ich habe dazu ein paar Fragen:

 

1. Gibt es eine Möglichkeit, Parametergrenzen mit der Funktion „Kurve anpassen“ festzulegen? Ich möchte die Untergrenzen für beide oben genannten Sätze auf Null festlegen, um zu vermeiden, dass dasselbe Problem auftritt.

 

2. Ich habe auch die Option „Nichtlineare Anpassung“ ausprobiert, da ich damit Parametergrenzen festlegen kann. Ich habe jedoch versucht, die gleiche Gleichung wie oben für „Zellwachstum 4P“ einzugeben, konnte aber keine annähernd so gute Anpassung wie die Ergebnisse der Anpassungskurve erzielen. Meistens scheinen sich die Anpassungsparameter nur sehr wenig von den anfänglichen Eingabewerten zu unterscheiden. Welche Einstellungen kann ich ändern, um dies zu unterstützen?

 

3. Gibt es eine weniger relevante Frage? Gibt es überhaupt eine Literaturquelle für diese Zellwachstums-4P-Gleichung?

 

Danke schön!

Betreff: Zellwachstum 4P-Modell

Vielen Dank für Ihren Vorschlag. Ich habe ihnen eine E-Mail mit einigen Beispieldaten geschickt.

Betreff: Zellwachstum 4P-Modell

Ist es für Sie möglich, die Daten, die die problematische Anpassung und das von Ihnen verwendete nichtlineare Modell aufweisen, an den technischen Support von JMP zu senden ( support@jmp.com )? Ich habe sie nach dem Verhalten gefragt, auf das Sie gestoßen sind, aber sie erkennen es nicht anhand ihrer Beispiele.

Betreff: Zellwachstum 4P-Modell

Ich füge hier das Vorher und Nachher eines Versuchs bei. Ich habe auch angegeben, wie die Passform mithilfe der Option „Kurve anpassen“ aussehen würde.

Das Seltsame ist, dass die nichtlineare Anpassung immer noch zu einer äußerst ungenauen Anpassung führen würde, selbst wenn ich die aus den Ergebnissen der Anpassungskurve abgeleiteten Werte eingebe. Eine zunehmende Anzahl von Iterationen hat keine Auswirkung, da die Konvergenz immer bei der zweiten Iteration zu erfolgen scheint. Ich habe auch versucht, das Konvergenzkriterium zu reduzieren, aber auch das hilft nicht.

Betreff: Zellwachstum 4P-Modell

In Bezug auf die nichtlineare Plattform: Konvergierte der Algorithmus zu einer Lösung? Sie könnten versuchen, die maximale Anzahl von Iterationen zu erhöhen oder die Konvergenzkriterien zu lockern. Alternativ können unterschiedliche Startpunkte basierend auf Domänenwissen verwendet werden.Es besteht auch die Möglichkeit, eine Rastersuche durchzuführen, um alternative Startpunkte zu untersuchen.