Modèle 4P de croissance cellulaireSalut tout le monde,
J'ai des données temporelles sur la croissance cellulaire (mammifères) et j'aimerais les ajuster pour obtenir la division cellulaire et le taux de mortalité. JMP dispose d'un modèle intégré nommé "Cell Growth 4P" dans l'option "Fit Curve" qui semble fonctionner plutôt bien pour la plupart de mes données. Cependant, pour l’un des groupes, le modèle a montré des taux de division et de mortalité négatifs. Sinon, la coupe semble plutôt bonne. J'ai quelques questions à ce sujet:
1. Existe-t-il un moyen de définir les limites des paramètres avec la fonction Ajuster la courbe ? J'aimerais fixer les limites inférieures des deux taux ci-dessus à zéro pour éviter de rencontrer ce même problème.
2. J'ai également essayé l'option Ajustement non linéaire car elle me permet de spécifier les limites des paramètres. Cependant, j'ai essayé de saisir la même équation que Cell Growth 4P ci-dessus, mais je n'ai pas réussi à obtenir un ajustement aussi bon que les résultats de Fit Curve. La plupart du temps, les paramètres d’ajustement semblent très peu s’écarter des valeurs d’entrée initiales. Quels paramètres puis-je modifier pour résoudre ce problème ?
3. Sur une note moins pertinente, puis-je trouver la source documentaire de cette équation de croissance cellulaire 4P ?
Merci!
Re : Modèle 4P de croissance cellulaireMerci pour votre suggestion, je suis allé de l'avant et leur ai envoyé un e-mail avec quelques exemples de données.
Re : Modèle 4P de croissance cellulaireEst-il possible d'envoyer les données présentant l'ajustement problématique et le modèle non linéaire que vous utilisez au support technique JMP ( support@jmp.com ) ? Je leur ai posé des questions sur le comportement que vous avez rencontré mais ils ne le voient pas avec leurs exemples.
Re : Modèle 4P de croissance cellulaireJe joins ici l'avant et l'après d'une tentative. J'ai également inclus à quoi ressemblerait l'ajustement en utilisant l'option Fit Curve.
Ce qui est étrange, c'est que même si je mets les valeurs dérivées des résultats de la courbe d'ajustement, l'ajustement non linéaire convergerait toujours vers un ajustement extrêmement inexact. Augmenter le nombre d'itérations ne fait rien puisqu'il semble toujours converger à la deuxième itération. J'ai également essayé de réduire le critère de convergence mais cela n'aide pas non plus.
Re : Modèle 4P de croissance cellulaireConcernant la plateforme non linéaire, l'algorithme a-t-il convergé vers une solution ? Vous pouvez essayer d'augmenter le nombre maximum d'itérations ou d'assouplir les critères de convergence ; en utilisant alternativement différents points de départ basés sur la connaissance du domaine.Il existe également une option permettant d'effectuer une recherche dans une grille pour rechercher des points de départ alternatifs.
