Esplorazione e scoperta di dati nella spettrometria di massa per imaging multi-isotopo (MIMS) nella ricerca sul cancro (2020-EU-30MP-371)Livello: intermedio
Greg McMahon, Principal Research Scientist, National Physical Laboratory
La spettrometria di massa per imaging multi-isotopo (MIMS) combina un'etichettatura isotopica stabile di campioni biologici con imaging per spettrometria di massa ad alta risoluzione spaziale (sub-cellulare) e analisi statistiche estese dei dati immagine risultanti. Le immagini sono ricche di informazioni e l'uso di JMP consente un metodo rapido e semplice per analizzare i dati per informazioni che sono semplicemente sottilmente contenute nell'immagine o altre informazioni che potrebbero trovarsi al di sotto del primo "ovvio" livello di informazioni. La combinazione di Graph Builder con semplici distribuzioni di dati e filtri di dati locali fornisce moltissime informazioni. L'approccio può essere esteso mediante l'applicazione di analisi dei cluster e statistiche multivariate. In questa presentazione, useremo un esempio per tracciare il destino metabolico di isotopo stabile 13C e 18O marcato con glucosio nei tumori del carcinoma mammario del topo progettato per contenere cellule con alti livelli di oncogene Myc, che è un motore per la crescita aggressiva del carcinoma mammario, oppure bassi livelli di oncogene Myc. Concluderemo con alcuni commenti sul significato dei risultati in termini di ricerca sul cancro per i non esperti.
ScoppiareEsplorazione dei datiVisualizzazione datiRi: Esplorazione dei dati e scoperta nella spettrometria di massa per imaging multi-isotopo (MIMS) nella ricerca sul cancro (2020-EU-30MP-371)Bella presentazione, @GregMcMahon . Fantastico vedere come viene utilizzato JMP in un'applicazione di ricerca "pura". E adoro il fatto che siano le cose semplici (Distribuzioni, Graph Builder, collegamento dinamico) che trovi più utili. Gli strumenti semplici sono spesso i più potenti.
Ri: Esplorazione dei dati e scoperta nella spettrometria di massa per imaging multi-isotopo (MIMS) nella ricerca sul cancro (2020-EU-30MP-371)Grazie Phil. Sentiti libero di entrare se ti trovi in zona.
Ri: Esplorazione dei dati e scoperta nella spettrometria di massa per imaging multi-isotopo (MIMS) nella ricerca sul cancro (2020-EU-30MP-371)È molto gentile, grazie. Spero di poterlo fare in futuro, quando saremo tutti in grado di viaggiare di nuovo!
