Datenexploration und -entdeckung in der Multi-Isotopen-Bildgebungs-Massenspektrometrie (MIMS) in der Krebsforschung (2020-EU-30MP-371)Level: Mittelstufe
Greg McMahon, Hauptforschungswissenschaftler, National Physical Laboratory
Die Multi-Isotopen-Bildgebungs-Massenspektrometrie (MIMS) kombiniert die stabile Isotopenmarkierung von biologischen Proben mit einer hochspektralen (subzellulären) Massenspektrometrie-Bildgebung und einer umfassenden statistischen Analyse der resultierenden Bilddaten. Die Bilder sind reich an Informationen, und die Verwendung von JMP ermöglicht eine schnelle und einfache Methode zum Analysieren der Daten auf Informationen, die entweder nur subtil im Bild enthalten sind, oder auf andere Informationen, die sich möglicherweise unterhalb der ersten "offensichtlichen" Informationsschicht befinden. Die Kombination von Graph Builder mit einfachen Datenverteilungen und lokalen Datenfiltern bietet eine Fülle von Informationen. Der Ansatz kann durch Anwendung von Clusteranalyse und multivariaten Statistiken erweitert werden. In dieser Präsentation werden wir ein Beispiel verwenden, das das metabolische Schicksal von 13C- und 18O-stabiler Isotopen-markierter Glucose in Brustkrebstumoren von Mäusen verfolgt, die so konstruiert sind, dass sie Zellen mit entweder hohen Konzentrationen des Myc-Onkogens enthalten, das ein Treiber für aggressives Brustkrebswachstum ist, oder niedrige Spiegel des Myc-Onkogens. Wir werden mit einigen Kommentaren zur Bedeutung der Ergebnisse für die Krebsforschung für den Nichtfachmann abschließen.
AusbrechenDatenexplorationDatenvisualisierungBetreff: Datenexploration und -entdeckung in der Multi-Isotopen-Bildgebungs-Massenspektrometrie (MIMS) in der Krebsforschung (2020-EU-30MP-371)Schöne Präsentation, @ GregMcMahon . Es ist großartig zu sehen, wie JMP in einer "reinen" Forschungsanwendung verwendet wird. Und ich finde es toll, dass Sie die einfachen Dinge (Distributionen, Graph Builder, dynamische Verknüpfung) am nützlichsten finden. Die einfachen Werkzeuge sind oft die mächtigsten.
Betreff: Datenexploration und -entdeckung in der Multi-Isotopen-Bildgebungs-Massenspektrometrie (MIMS) in der Krebsforschung (2020-EU-30MP-371)Danke Phil. Schauen Sie doch einfach mal vorbei, wenn Sie jemals in der Gegend sind.
Betreff: Datenexploration und -entdeckung in der Multi-Isotopen-Bildgebungs-Massenspektrometrie (MIMS) in der Krebsforschung (2020-EU-30MP-371)Das ist sehr nett, danke. Hoffentlich werde ich es irgendwann in der Zukunft schaffen, wenn wir alle wieder reisen können!
