Exploration et découverte de données en spectrométrie de masse par imagerie multi-isotopique (MIMS) dans la recherche sur le cancer (2020-EU-30MP-371)Niveau : Intermédiaire
Greg McMahon, chercheur scientifique principal, Laboratoire national de physique
La spectrométrie de masse par imagerie multi-isotopique (MIMS) combine le marquage isotopique stable d'échantillons biologiques avec une imagerie par spectrométrie de masse (subcellulaire) à haute résolution spatiale et une analyse statistique approfondie des données d'image résultantes. Les images sont riches en informations, et l'utilisation de JMP offre une méthode rapide et simple d'analyse des données pour rechercher des informations qui sont soit subtilement contenues dans l'image, soit d'autres informations qui peuvent se trouver en dessous de la première couche d'informations « évidente ». La combinaison de Graph Builder avec des distributions de données simples et des filtres de données locaux fournit une richesse d'informations. L'approche peut être étendue par l'application de l'analyse groupée et des statistiques multivariées. Dans cette présentation, nous utiliserons un exemple de suivi du devenir métabolique du glucose marqué par les isotopes stables 13C et 18O dans les tumeurs du cancer du sein de souris conçues pour contenir des cellules avec des niveaux élevés de l'oncogène Myc, qui est un moteur de la croissance agressive du cancer du sein, ou faibles niveaux de l’oncogène Myc. Nous terminerons par quelques commentaires sur l'importance des résultats en termes de recherche sur le cancer pour le non-expert.
ÉclaterExploration des donnéesVisualisation de donnéesObjet : Exploration et découverte de données en spectrométrie de masse par imagerie multi-isotopique (MIMS) dans la recherche sur le cancer (2020-EU-30MP-371)C'est très gentil, merci. J'espère que je pourrai le faire à un moment donné dans le futur, lorsque nous pourrons tous voyager à nouveau !
Objet : Exploration et découverte de données en spectrométrie de masse par imagerie multi-isotopique (MIMS) dans la recherche sur le cancer (2020-EU-30MP-371)Merci Phil. N'hésitez pas à passer si jamais vous êtes dans le coin.
Objet : Exploration et découverte de données en spectrométrie de masse par imagerie multi-isotopique (MIMS) dans la recherche sur le cancer (2020-EU-30MP-371)Belle présentation, @GregMcMahon .C'est formidable de voir comment JMP est utilisé dans une application de recherche "pure". Et j'aime le fait que ce soient les éléments simples (distributions, générateur de graphiques, liens dynamiques) que vous trouvez les plus utiles. Les outils simples sont souvent les plus puissants.
