Même si ce n'est pas statistiquement significatif, puis-je effectuer un test de comparaison multiple tel que le LSD ?J'ai mené un modèle ANOVA à 2 voies avec des blocs et chaque effet principal était significatif, mais l'interaction n'était pas significative (A). Cependant, lorsque j'ai vérifié le LSD, il montre des différences entre les interactions (B). Quand je vois le graphique de tracé (C), il semble qu'il y ait des différences visuelles. Par conséquent, j'ai testé des tranches sur l'interaction, et j'ai trouvé une différence sur les TR dans le génotype 3, et j'ai également trouvé une différence sur les génotypes dans TR-3 (D).
Dans ce cas, puis-je accepter le résultat LSD et dire que l'interaction "génotype 1 x TR-1" (47,876676) est supérieure à l'interaction "génotype 3 x TR-3" (36,327143) comme le résultat LSD (B) l'indique ?
Ma question est... même si ce n'est pas statistiquement significatif, si le résultat LSD fournit une lettre différente (a,b,c..), puis-je utiliser le résultat ?
Merci,
A) ANOVA
LSD
C) Graphique de tracé
D) Tranches d'essai
Re : Même si ce n'est pas statistiquement significatif, puis-je effectuer un test de comparaison multiple tel que le LSD ?Cher. Dan Obermiller
Merci beaucoup pour vos commentaires. Cela me fait réfléchir davantage sur le principe de mes expériences.
Merci beaucoup,
Sincèrement,
JKRe : Même si ce n'est pas statistiquement significatif, puis-je effectuer un test de comparaison multiple tel que le LSD ?Parfois, tout test statistique peut conduire à des résultats statistiquement significatifs même s'il n'y a pas de réelle différence. N'oubliez pas qu'il s'agit d'une confiance de 95 %, pas de 100 %. Donc, si vous deviez effectuer 20 tests, l'un d'entre eux serait probablement statistiquement significatif en se basant uniquement sur le hasard.
Étant donné que l'ANOVA indique que l'interaction n'est pas significative, pourquoi effectueriez-vous un test de comparaison multiple pour déterminer où se situent les différences ? Vous avez une réponse là.
Il y a une citation célèbre (j'oublie l'auteur) selon laquelle beaucoup de gens utilisent les statistiques plus comme support que comme éclairage. Faites attention à ne pas tomber dans ce piège. Les statistiques devraient être pour l'éclairage. Je vous encourage à considérer ce que les données vous disent. Si vous pensez que les différences devraient être importantes et qu'elles ne le sont pas, pourquoi pas ? L'erreur dans la méthode de test est-elle trop grande ? Peut-être que la taille de l'échantillon était trop petite ? Peut-être que les changements de facteurs n'étaient pas suffisamment importants pour surmonter la variabilité inhérente au processus ? Peut-être que le protocole expérimental n'a pas été suivi ?
L'expérimentation est une chose merveilleuse car elle donne presque toujours de nouvelles pistes à explorer et à expliquer.
Re : Même si ce n'est pas statistiquement significatif, puis-je effectuer un test de comparaison multiple tel que le LSD ?Cher. Dan Obermiller
Merci beaucoup pour votre réponse. Cela m'aide vraiment à comprendre. J'ai une question suivante.
Vous avez mentionné ' pour utiliser la méthode Tukey-Kramer HSD' et le résultat est le ci-dessous
Si j'utilise Tukey HSD, puis-je dire que le résultat de 'Genotype1 x TR-1' est supérieur à celui de 'Genotype3 x TR-3'?
Parce que TR-3 est un traitement extrême que j'ai imposé. Par conséquent, dans mon bon sens, cela semble impossible si l'on dit que tous les résultats des interactions sont les mêmes.Génotype1 x TR-1 est 47,876676 et Génotype3 x TR-3 est 36,327143. La différence est supérieure à 10, et c'est une énorme différence dans ma valeur d'expérience. Donc, je me demande si j'utilise Tukey HSD, puis-je accepter la différence entre Genotype1 x TR-1 'et' Genotype3 x TR-3', même si l'ANOVA n'est pas significative?
De plus, si ce cas est acceptable, pourriez-vous expliquer pourquoi Tukey HSD est acceptable mais pas le LSD ?
Merci beaucoup,
Sincèrement,
JK
Re : Même si ce n'est pas statistiquement significatif, puis-je effectuer un test de comparaison multiple tel que le LSD ?Cette situation n'est pas rare lors de l'utilisation du LSD. L'approche LSD ne prend en compte que les taux d'erreur de comparaison par paires (chaque comparaison est à votre niveau de confiance spécifié, généralement 95%). Le LSD ne contrôle PAS le taux d'erreur global de l'expérience. Ainsi, avec 9 niveaux d'interaction, votre taux d'erreur expérimental (avec le LSD) est en fait plus proche de 0,95 ^ 9 = 0,63 ou 63 % de confiance sur TOUTES vos conclusions. En d'autres termes, le LSD peut trouver des différences qui ne sont pas réelles. Vous ne pouvez être sûr qu'à environ 63 % que les différences que vous avez trouvées sont réelles. Pour cette raison, la plupart des gens n'envisagent d'utiliser le LSD que si l'ANOVA globale est significative. Étant donné que votre interaction n'était pas significative, vous ne devriez pas utiliser de LSD aux niveaux d'interaction.
Une autre approche que beaucoup utilisent consiste à utiliser la méthode Tukey-Kramer HSD qui contrôle le taux d'erreur expérimental et évite généralement ce problème.
