Aunque no es estadísticamente significativo, ¿puedo realizar pruebas de comparación múltiple como LSD?Realicé un modelo ANOVA de 2 vías con bloques y cada efecto principal fue significativo, pero la interacción no fue significativa (A). Sin embargo, cuando verifiqué el LSD, muestra diferencias entre la interacción (B). Cuando veo el gráfico de trama (C), parece que hay algunas diferencias visuales. Por lo tanto, probé rebanadas sobre la interacción, y encontré diferencias sobre los TR dentro del genotipo 3, y también encontré diferencias sobre los genotipos dentro del TR-3 (D).
En este caso, ¿puedo aceptar el resultado de LSD y decir que la interacción "genotipo 1 x TR-1" (47.876676) es mayor que la interacción "genotipo 3 x TR-3" (36.327143) como indica el resultado de LSD (B)?
Mi pregunta es... aunque no sea estadísticamente significativo, si el resultado de LSD proporciona una letra diferente (a, b, c ..), ¿puedo usar el resultado?
Gracias,
A) ANOVA
LSD
C) Gráfico de trama
D) Rebanadas de prueba
Re: Aunque no es estadísticamente significativo, ¿puedo realizar pruebas de comparación múltiple como LSD?Esta situación no es infrecuente cuando se usa LSD. El enfoque LSD solo considera las tasas de error de comparación por pares (cada comparación está en su nivel de confianza especificado, generalmente 95%). El LSD NO controla la tasa de error general por experimento. Entonces, con 9 niveles de interacción, su tasa de error experimental (con LSD) está realmente más cerca de 0.95 ^ 9 = 0.63 o 63% de confianza en TODAS sus conclusiones. En otras palabras, LSD puede encontrar diferencias que no son reales. Solo puede estar aproximadamente 63% seguro de que las diferencias que encontró son reales. Por esta razón, la mayoría de las personas considera usar LSD solo si el ANOVA general es significativo. Como su interacción no fue significativa, no debe usar LSD en los niveles de interacción.
Otro enfoque que muchos usan es usar el método Tukey-Kramer HSD que controla la tasa de error experimental y típicamente evitaría este problema.
Re: Aunque no es estadísticamente significativo, ¿puedo realizar pruebas de comparación múltiple como LSD?Querido. Dan Obermiller
Muchas gracias por su respuesta. Realmente me ayuda a entender. Tengo una siguiente pregunta.
Mencionaste ' usar el método HSD Tukey-Kramer 'y el resultado es el siguiente
Si uso Tukey HSD, ¿puedo decir que el resultado de 'Genotype1 x TR-1' es mayor que el de 'Genotype3 x TR-3'?
Porque TR-3 es un tratamiento extremo que impuse. Por lo tanto, en mi sentido común, parece imposible si se dice que todos los resultados de las interacciones son iguales. Genotype1 x TR-1 es 47.876676 y Genotype3 x TR-3 es 36.327143. La diferencia es más de 10, y es una gran diferencia en mi valor de experimentar. Entonces, me pregunto si uso Tukey HSD, ¿puedo aceptar la diferencia entre Genotype1 x TR-1 'y' Genotype3 x TR-3 ', aunque el ANOVA no sea significativo?
Además, si ese caso es aceptable, ¿podría explicar por qué Tukey HSD es aceptable pero LSD no?
Muchas gracias,
Sinceramente,
JK
Re: Aunque no es estadísticamente significativo, ¿puedo realizar pruebas de comparación múltiple como LSD?Ocasionalmente, cualquier prueba estadística puede conducir a resultados estadísticamente significativos, incluso si no hay una diferencia real. Recuerde, es 95% de confianza, no 100%. Entonces, si realizara 20 pruebas, una de ellas probablemente sería estadísticamente significativa en función de la casualidad.
Debido a que ANOVA dijo que la interacción no es significativa, ¿por qué realizaría una prueba de comparación múltiple para determinar dónde están las diferencias? Tienes una respuesta allí.
Hay una cita famosa (me olvido del autor) de que muchas personas usan las estadísticas más como apoyo que como iluminación. Tenga cuidado de no caer en esa trampa. Las estadísticas deben ser para iluminación. Le animo a que considere lo que le dicen los datos. Si cree que las diferencias deberían ser significativas y no lo son, ¿por qué no? ¿El error en el método de prueba es demasiado grande? ¿Quizás el tamaño de la muestra era demasiado pequeño? ¿Quizás los cambios en los factores no fueron de una magnitud lo suficientemente grande como para superar la variabilidad inherente en el proceso? ¿Quizás no se siguió el protocolo experimental?
La experimentación es algo maravilloso, ya que casi siempre ofrece nuevas vías para explorar y explicar.
Re: Aunque no es estadísticamente significativo, ¿puedo realizar pruebas de comparación múltiple como LSD?Querido. Dan Obermiller
Muchas gracias por sus comentarios. Me hace pensar más sobre el principio de mis experimentos.
Muchas gracias,
Sinceramente,
JK
