Prueba de acuerdo por presencia/ausencia por mesHola,
Recopilé datos sobre la ocurrencia mensual de un parásito y la ocurrencia mensual de una lesión histológica en los tejidos donde infecta el parásito.El parásito es fuertemente estacional: la prevalencia máxima y las intensidades ocurren en marzo y abril.Las lesiones están más dispersas a lo largo del año, pero parecen ser más comunes en esos meses.Entonces, para cada (lesión o parásito), puedo construir una tabla de contingencia (2x12) para demostrar los meses en los que la prevalencia de lesiones y parásitos es más alta.Lo que me gustaría hacer es probar qué tan cerca están de acuerdo los parásitos y las lesiones.¿Existe una prueba de concordancia para comparar la prevalencia mensual de lesiones y parásitos?
Puedo ignorar el mes y construir una tabla de contingencia de parásito y lesión.Los resultados muestran un Kappa de 0,0248 con una P = 0,5804. Además, la prueba de simetría de Bowker (mayor que la tabla de contingencia 2x2) indica simetría de desacuerdo chisq =22.6, P <0.001.Tomaría estos resultados como que no existe una fuerte medida de concordancia entre la lesión y el parásito en general.Sin embargo, esto no tiene en cuenta el mes.
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mes¡Gracias por tu ayuda!
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesNo creo que usar el tipo de modelado nominal cause una singularidad en las pruebas de CMH, especialmente porque solo tiene dos niveles para X y para Y.
Sí, la hipótesis nula es que no hay asociación entre X e Y.
Sí, el análisis de contingencia no estratificado es altamente significativo (LRT chi cuadrado > 65, valor de p < 0,0001). (Tenga en cuenta que el chi cuadrado no se puede utilizar para evaluar la fuerza de la asociación, solo su significado).
Sí, la prueba CMH (Asociación General de Categorías) relevante es altamente significativa (chi cuadrado > 40, valor p < 0,0001). La estratificación ayuda a asegurar que la asociación esté consistentemente presente a través de los estratos, si esa pregunta debe ser respondida. La prueba CMH también relaja un poco el requisito de tamaño de muestra para la estadística de chi cuadrado, lo cual no es un problema en este caso. (No más del 20 % de las celdas con un recuento esperado inferior a 5).
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mes
Aquí está la tabla de contingencia y los resultados de CMH.Configuré la lesión y la presencia/ausencia de parásitos como ordinales y funcionó.Estratificado por mes.Creo que tenía mis columnas configuradas como nominales anteriormente.
Creo que la hipótesis nula es que no hay asociación entre lesiones y parásitos.Por lo tanto, parece que tengo una asociación muy significativa entre ellos.Entonces, lo que me pregunto es qué información adicional proporciona el CMH y la estratificación por encima de la ChiSquare estándar.
¡Gracias por tu ayuda!
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesMedidas Kappa acuerdo entre calificadores o calificaciones. Para la prueba de McNemar/Bowker de simetría , la hipótesis nula es que las probabilidades en la tabla cuadrada satisfacen simetría o que pag yo = pag Ji para todos los pares de celdas de la tabla.
Las pruebas de CMH son sobre asociación y la elección entre las cuatro alternativas depende del tipo de modelado de las variables X e Y. De la ayuda de JMP:
- La prueba de Cochran-Mantel-Haenszel descubre si existe una relación entre dos variables categóricas después de bloquear en una tercera clasificación.
- Correlación de Puntajes: Aplicable cuando tanto Y como X son ordinales o de intervalo. La hipótesis alternativa es que existe una asociación lineal entre Y y X en al menos un nivel de la variable de bloqueo.
- Puntuación de fila por categorías de columnas: Aplicable cuando Y es ordinal o de intervalo. La hipótesis alternativa es que, para al menos un nivel de la variable de bloqueo, las puntuaciones medias de los r las filas son desiguales.
- Col Score by Row Categories: Aplicable cuando X es ordinal o de intervalo. La hipótesis alternativa es que, para al menos un nivel de la variable de bloqueo, las puntuaciones medias de los C las columnas son desiguales.
- Asociación General de Categorías: Comprueba que para al menos un nivel de la variable de bloqueo, existe algún tipo de asociación entre X e Y.
La estadística de prueba se calcula esencialmente para cada estrato y se combina en la estadística de prueba general.
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesLa singularidad generalmente significa que el modelo detrás de esta prueba está sobreespecificado. Sería como incluir un término cuadrático en el predictor lineal cuando la variable X tiene solo dos niveles. Dichos datos no respaldan la estimación del modelo. ¿Puedes publicar la plataforma de Contingencia con tus datos antes y después de aplicar las pruebas CMH?
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesMarca,
Tengo otra pregunta o 2.También corrí estadísticas de concordancia general entre el parásito y la lesión, ignorando el mes.La puntuación Kappa fue alta (0,66) y significativa P<0,001. La prueba de Bowker también fue significativa chisq 5.4, P=0.196. ¿La prueba de Bowker confirma el Kappa?No estoy seguro de cómo tomar el resultado de Bowker, ya que parece que está probando el desacuerdo en lugar del acuerdo.¿Puedes explicar?
Además, después de pensar un poco en esto, no sé si importa que incluya el mes en el análisis.Quizás Kappa y Bowker serían suficientes.Sin embargo, me gustaría saber si la prueba CMH proporciona información útil adicional más allá de Kappa y Bowkers.
¡¡Gracias de nuevo!!
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesMarca,
Intenté ejecutar la prueba CMH con parásitos y lesiones como X e Y estratificados por mes.Las puntuaciones de correlación están en blanco en el cuadro de resultados, seguidas de un mensaje que indica que la estadística no se calculó porque la matriz de covarianza era singular.¿Qué significa eso?
¡Gracias!
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mes¡Estás muy por delante de mí! Sí, el nulo es ninguna asociación. Primero prueba la asociación general (no estratificada) con la plataforma de contingencia, luego selecciona CMH del triángulo rojo para la estratificación por mes.
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesOk, creo que es la prueba de Cochran Mantel Haenzsel a la que te refieres también.Encontré un ejemplo y entiendo cómo ejecutarlo ahora.Así que elegí la presencia/ausencia de lesión y parásito como X e Y y luego, en la ventana emergente, elegí el mes como variable de agrupación.¿Es por defecto que la hipótesis nula es que no hay correlación entre el parásito y la lesión?
¡Gracias!
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesHola,
Registré la presencia o ausencia de parásitos y lesiones para cada pez. El
proporción mensual de pescado con cada rangos de adolescentes bajos a 100% así que si yo
entender correctamente, ambos están en la misma escala
¿Qué son las pruebas de CMH y cómo las estratifico por mes?
¡Gracias!
Marca
Re: Test de acuerdo de presencia/ausencia por mesEl acuerdo es para Y y X con la misma escala. Su descripción menciona recuentos (lesiones, parásitos) pero no las escalas utilizadas para ninguno de los dos.
La asociación es más general. Puede crear una estrategia para su tabla de contingencia por mes. Una de las pruebas de CMH debería cubrir su hipótesis.
