DOE響應以最大化“負”和“正”類別變量之間的變化我是jmp的新手,正在嘗試優化生化分析。我有多個類別變量和連續變量來嘗試優化我正在使用的緩衝區。然後,我想將“目標”添加為變量(因此該變量具有正數或負數)。沒有這個“目標”,我想使響應最小化,而我想使響應最大化(總的來說,我要使倍數變化最大化)。
在執行此操作之前,先生成沒有此“目標”變量的條件,然後通過重複運行並增加一列來操縱實驗設計。但是,這在嘗試分析數據時變得很困難,因為如果獲得“負數”的均值並從“正數”的均值中減去它,我感覺好像正在丟失信息。我希望就如何指定所需的響應提供一些建議。
回复:能源部的回應,以最大限度地提高“負”和“正”類別變量之間的變化我假設您將為DOE中的每種處理運行一條標準曲線。因此,您將能夠擬合劑量響應曲線,例如4PLC。您可以使用多個響應。您可以最大化上漸近線,最小化下漸近線。然後定位其他參數以獲得所需的動態範圍,以實現所需的靈敏度和特異性。
您是否對響應進行了定量測量?您是否只有樣品的陰性和陽性狀態?
我可能會離開...
回复:能源部的回應,以最大限度地提高“負”和“正”類別變量之間的變化謝謝 @馬克貝利的建議。
就標準曲線而言,是的,我將使用一定量的具有相同響應的已知試劑進行單獨的對照反應。因此,我可以將所有值轉換為已知試劑的x單位。
我可以使用多個響應,但是我不確定如何將帶有“目標”的那些最大化,而將那些沒有“目標”的那些最小化。
是的,我將有定量的輸出(在這種情況下為熒光),此時我還可以滴定目標,但是我覺得那可能會使情況復雜化(因為理想情況下,我只是在最大化正負之間的差異)。
要嘗試擺脫含糊其詞的含義,也許會有助於解釋我的方法。我正在開發一種針對特定疾病的診斷檢測方法。我正在優化所使用的緩衝液,以便當患者樣品為“陽性”時,可以輕鬆地將其與“陰性”患者樣品區分開。我當前的設計是具有標準交互以及RSM的自定義設計。我的反應一式三份。我正在考慮將“正”或“負”用作額外的類別變量,因為在我當前的方法中,我生成的運行中沒有“正”和“負”(並在以後將其添加為額外的列),但是最終我遇到了匯總我的“陽性”重複三次,然後減去“陰性”重複次數的平均值。這似乎不是執行此操作的最佳方法(我丟失了有關標準偏差的信息等),而我希望將jmp的原始數據用於創建優化模型。
我只需要找到一種指定最佳響應的好方法,或者指定此特定用例中最需要的方法。
回复:能源部的回應,以最大限度地提高“負”和“正”類別變量之間的變化您的標準曲線和控製樣本用於質量控制,而不是實際優化的一部分,對嗎?
您需要高靈敏度和特異性。該性能將來自較低的背景(漸近線較低)和較小的標準偏差(空白樣本)。您的樣本緩衝區將影響這些參數。邏輯模型中的其他參數同樣可以用作響應。應盡量減少拐點,以使您更敏感(在較低濃度下信號更多)。斜率或功率參數應最大化,以便在分析物增加較小的情況下獲得更多信號。
調整目標可能不是最簡單的方法,但另一種方法是“選擇贏家”而不是優化。您的診斷是二進制的,但您的測定是定量的。通過專注於定量特徵,您將獲得最高的靈敏度和特異性。然後,您可以根據樣品類型(負/正)的邏輯回歸模型與分析物濃度的ROC曲線,權衡優化分析的靈敏度和特異性。