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Conjunto de datos multivariante

Hola,

 

Me preguntaba si podría obtener ayuda para saber cómo analizar el conjunto de datos adjunto utilizando JMP (no JMP Pro).

 

Hubo un cambio de gestión aplicado en un grupo de 59 granjas diferentes. Esto ocurrió a fines de mayo, por lo que abril y mayo fue el antiguo régimen "Tratamiento 1" y julio y agosto fue el nuevo régimen "Tratamiento 2",

 

Queremos saber si este cambio afectó significativamente el peso corporal, la producción de huevo, la desviación del peso corporal objetivo y la desviación de la producción de huevo objetivo, en general y también en dos períodos de tiempo específicos (30-45 semanas) y más de 45 semanas. Nos gustaría conocer los efectos separados e interactivos de:

 

Edad, raza, tratamiento, "problema" de la granja

 

Tenga en cuenta lo siguiente:

• Cada fila es un valor promedio para una granja
• No todas las granjas tienen datos de peso corporal disponibles.
• Algunas veces se midió la misma granja antes y después del cambio de régimen, en otras, el rendimiento solo se midió después del cambio de régimen
• Las aves en el Tratamiento 2 serán mayores y la edad afectará el rendimiento.
• La raza no está equilibrada, es decir, hay muchas menos repeticiones en la raza tipo 4
• Nos gustaría saber el efecto del estado de "granja de problemas"

 

Cualquier ayuda sería apreciada

 

Gracias por adelantado

Abbie

Re: conjunto de datos multivarianteHola abbie

Debería comenzar haciendo una "limpieza de datos". Debe asegurarse de que sus datos numéricos estén asignados a columnas numéricas (no como datos de caracteres). Ver https://www.jmp.com/support/help/en/15.0/?os=mac&source=application#page/jmp/view-or-change-column-information.shtml por ayuda Luego comenzaría con el generador de gráficos y exploraría sus datos ( https://www.jmp.com/support/help/en/15.0/?os=mac&source=application#page/jmp/graph-builder-2.shtml# ) Después de eso, puede pasar a pruebas específicas para detectar diferencias si es necesario.

KarenRe: conjunto de datos multivariante

Solo para agregar que puede cambiar el tipo de datos y el tipo de modelado para columnas multilpe.

 

Seleccione todas las columnas relevantes (en este caso las nominales que deberían ser numéricas / continuas)

Cols> Estandarizar atributos

 

Luego vaya a Atributos y seleccione Tipo de datos> Tipo numérico y de modelado> Continuo.

Re: conjunto de datos multivarianteTambién es una buena idea usar Cols> Recode para agregar un valor "No" donde la granja de problemas no es "Sí" (en lugar de simplemente el valor perdido). Suponiendo que pueda ser una variable de interés, querrá tener los valores "Sí" y "No" para usarlo.Re: conjunto de datos multivariante

Estoy un poco confundido porque dijiste que cada fila es una granja pero extraje solo los datos en 1 granja (anonimizado como "V3_0"):

 

Tratamiento Mes Número de casa de la granja Problema Granja Edad de la ave Raza
Tratamiento 1 de abril V3_0 H2 no 57 Lohmann
Tratamiento 1 de abril V3_0 H2 no 58 Lohmann
Tratamiento 1 de abril V3_0 H2 no 59 Lohmann
Tratamiento 1 de abril V3_0 H2 no 60 Lohmann
Tratamiento 1 de mayo V3_0 H2 no 61 Lohmann
Tratamiento 1 de mayo V3_0 H2 no 62 Lohmann
Tratamiento 1 de mayo V3_0 H2 no 63 Lohmann
Tratamiento 1 de mayo V3_0 H2 no 64 Lohmann
Tratamiento 2 de julio V3_0 H2 no 70 Lohmann
Tratamiento 2 de julio V3_0 H2 no 71 Lohmann
Tratamiento 2 de julio V3_0 H2 no 72 Lohmann
Tratamiento 2 de julio V3_0 H2 no 73 Lohmann

 

Puedo ver varias filas para la misma granja, mes y casa. Sin embargo, parece que la edad de las aves es diferente. Entonces, ¿cada fila es un pájaro? ¿O un grupo de pájaros de la misma edad?

Re: conjunto de datos multivariante

Así que ahora entiendo que cada fila es por 1 semana dentro de cada mes.

 

Creo que el mejor enfoque es ajustar un modelo de respuesta (he visto solo el% de producción de huevo, pero lo mismo sería para cualquier otra respuesta) versus Bird Age (sabes que esto tiene un efecto en tus respuestas, por lo que considerarías esto una "covariable") y un mes. Si hay una diferencia significativa entre abril, mayo (tratamiento 1) y julio, agosto (tratamiento 2), eso es coherente con el efecto del tratamiento.

 

Sin embargo... ¡advertencia importante! ...

 

Esto no probaría que el tratamiento es un efecto importante. El efecto observado también podría deberse a algún efecto estacional (por ejemplo, la producción de huevos es generalmente menor en julio y agosto porque es más caliente). A partir de estos datos, no hay forma de separar el tratamiento de un efecto estacional o algún otro cambio incontrolado entre mayo y julio. Necesitaría datos que cubran varios años para comprender el efecto estacional.

 

Con todo lo dicho, miré a los modelos adecuados. También agregué un efecto aleatorio para que la granja tenga en cuenta las diferencias incontroladas entre las granjas. (Anonimé la granja). Y algunas granjas tienen varias casas y podría haber una variación incontrolada entre ellas, así que agregué un efecto aleatorio de casa, anidado dentro de la granja (Casa [Granja]).

 

Ejemplo de efectos randon anidados: https://www.jmp.com/support/help/14-2/two-factor-nested-random-effects-model.shtml

 

También agregué Problem Farm and Breed como factores para estimar los efectos de estos factores potencialmente importantes.

 

Los modelos con efectos fijos y aleatorios se conocen como modelos "mixtos". Usando JMP Pro también exploré un modelo mixto más complejo que permite una variación aleatoria del efecto de la edad de las aves entre granjas.

 

La tabla de datos adjunta tiene ambos modelos como scripts. Solo será posible ejecutar el modelo mixto más complejo ("Fit Mixed") en JMP Pro. 

 

El modelo mixto estándar indica un efecto significativo del mes: la producción de huevos es menor en julio y agosto frente a abril y mayo.

 

El modelo mixto más complejo encaja mejor. No cambia la conclusión sobre el efecto del mes. Sin embargo, en este modelo, Breed y Problem Farm no son significativos.

 

...Espero que todo esto ayude. El modelado mixto no es un método fácil de usar.

 

Además de estos enfoques de modelado, también recomendaría el uso de análisis de datos exploratorios para observar la calidad de los datos. Algunos de los resultados registrados para la producción de huevos son muy diferentes de los demás (también agregué un script de análisis de Distribución en la tabla). Sería una buena idea verificar que estos resultados sean correctos.

 

Re: conjunto de datos multivariante

Si necesita mirar otras variables de respuesta (peso del huevo, peso corporal), puede ejecutar el mismo modelo: desde el menú del triángulo rojo en% de producción del huevo de respuesta> Diálogo del modelo. Puede agregar cualquier otra respuesta al rol Y en este diálogo de modelo.

 

Desde el mismo menú de triángulo rojo también puede guardar una columna de fórmula de predicción en la tabla de datos: Guardar columnas> Fórmula de predicción.

 

Y puede ver la expresión de predicción: Estimaciones> Mostrar expresión de predicción.