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Importation et analyse de données spectrales

Salut,

un de mes clients de une société pharmaceutique explore JMP PRO, mais elle a du mal à ouvrir les données d'origine générées par son équipement

ils m'ont dit que ce sont des données spectrales, mais dans un type de données spécial " Certificats PKCS #7 " dont je n'ai aucune idée

 

Deviner le type spécial de fichier devrait pouvoir être lu dans JMP via JSL ou un autre complément ou ....

essayer de joindre le fichier factice reçu du client " Données spectrales factices 280819.spc " mais toujours avec erreur de téléchargement : le contenu de la pièce jointe ne correspond pas à son type de fichier

Veuillez demander conseil, toute suggestion / réflexion : comment importer les données dans JMP, quel type d'analyse est généralement effectué, toute information pertinente, etc.

merci et bonne journée

 

Objet : Importation et analyse de données spectrales

Bonjour à tous,

 

Juste pour mettre à jour le statut et le résultat de mon côté. Pas de nouvelles excitantes fondamentalement

n'hésitez pas à sauter la partie postérieure.

 

comme suggéré, il semble qu'il existe de nombreuses ressources ouvertes et gratuites possibles pour ouvrir le fichier .spc.

J'en ai essayé plusieurs ces dernières semaines :

 

1 : Agence de protection de l'environnement des États-Unis --> résultat de recherche débordé qui me fait totalement perdre

 

2: "spc2csv.exe" --> téléchargement infructueux (suppression automatique une fois le téléchargement terminé), ne mentionne même pas le travail ou non. J'ai abandonné après trois essais

 

3: "Spectrum Viewer" semble le convertisseur le plus potentiel possible, a réussi à installer l'exe, mais un code d'erreur est apparu (je suppose que cela est dû à la compatibilité du système car j'utilise le système x64bits alors que l'exe est pour x32bits) soupir ~

envoyé par e-mail au support technique EDAX, mais avec le moins d'espoir

4: Python Code -> c'est mon dernier essai car je suis très nouveau sur python, à la fin j'ai trouvé que ce code est pour python 2.7 UNIQUEMENT (alors que le python actuel est 3.7 )

 

 

 

Conclusion: laissez ces choses professionnelles aux professionnels, il doit y avoir une grande valeur ajoutée pour ces entreprises qui conçoivent l'équipement/logiciel qui n'est pas si facile pour une personne ordinaire (comme moi) à réaliser en si peu de temps

 

C'est aussi ce que j'ai toujours utilisé pour répondre à mes clients JMP qui souhaitent développer eux-mêmes la fonctionnalité PRO

(ils veulent des fonctionnalités PRO mais ne veulent pas payer pour cela)

 

Mais il faudra continuer à explorer les techniques d'analyse par exemple PLS... dans ce domaine.

Merci et bonne journée à tous

 

Broche

 

Objet : Importation et analyse de données spectrales

Salut Pin,

Une fois vos données importées dans JMP, vous disposez de plusieurs options d'analyse.PLS est souvent utilisé pour l'analyse spectrale.Consultez Gasoline.jmp dans les exemples de fichiers de données.Il s'agit de données NIR utilisées pour prédire l'indice d'octane dans le gaz.Vous pouvez également exploiter FDE avec vos données spectrales.@peterhersh a montré une façon d'utiliser FDE et j'ai une autre façon de FDE et PLS ou GenReg pour construire un modèle prédictif à partir des données spectrales.

J'espère que cela t'aides,

Facture

Objet : Importation et analyse de données spectrales

@wendytseng , Salut wedy,

J'apprends encore, commencez par télécharger Phthon (Je posterai mon résultat ici une fois que je l'aurai)

 

Le domaine pharmaceutique est assez nouveau pour moi, j'ai vraiment besoin de temps et d'efforts pour le comprendre.

Ce serait une bonne idée que certains de nos SE qui sont familiers dans le domaine pharmaceutique puissent partager plus de pratique

 

Objet : Importation et analyse de données spectrales

Le site d'assistance ThermoFisher dispose d'un FAQ à propos de cette question. Voici un extrait :

 

" Comment utiliser un spectromètre Antaris pour l'analyse de processus en ligne ?
Si l'environnement du processus contient de l'eau, du CIP, de la poussière, des produits chimiques à haute température, corrosifs ou explosifs, l'analyseur doit être placé dans une zone sûre ou enfermé dans une enceinte stabilisée pour l'environnement. Les fibres optiques vont de l'analyseur NIR aux sondes ou aux cellules d'écoulement installées dans les tuyaux de processus de production, les réservoirs, les trémies, les convoyeurs, les réacteurs, etc. Les fibres optiques transportent la lumière de la source NIR vers la fenêtre d'échantillonnage de la sonde, puis transportent la lumière après qu'elle a interagi avec l'échantillon vers le détecteur de l'analyseur NIR. L'extrémité de la sonde aura une fenêtre ou un entrefer pour l'analyse en réflexion ou en transmission. Le produit analysé doit être autonettoyant ou la sonde conçue pour se nettoyer automatiquement par de l'air à haute pression. L'ordinateur qui contrôle l'analyseur NIR est également situé dans la zone de sécurité avec le logiciel Thermo Scientific RESULT exportant les résultats NIR vers des fichiers texte ou Microsoft Excel, LIMS, OPC ou par 4-20mA . "

 

Vous pourrez peut-être obtenir les données dans un fichier Excel.

Objet : Importation et analyse de données spectrales

@BROCHE Curieux de savoir si vous avez eu de la chance avec le code Python.J'ai un client qui vient de m'envoyer une question similaire.Mais son fichier est un .spa

 

"L'instrument que j'utilise (ThermoFisher NIR (near Infrared) Spectral Analyzer) génère le fichier de données spectrales dans un format de fichier .spa, que je n'ai pas réussi à faire lire par JMP.Je pense que .spa est le format de fichier natif (et propriétaire?) De TF, ce qui est malheureux, si c'est vrai.

 

Savez-vous si l'un de vos clients, en particulier ceux du secteur pharmaceutique, utilise des analyseurs de spectre TF et s'il a réussi à utiliser JMP pour analyser les données des fichiers .spa ? »

Objet : Importation et analyse de données spectralesMerci beaucoup Ian.
Testera le code Python et mettra à jour plus tard s'il fonctionne ou nonObjet : Importation et analyse de données spectrales

En ce qui concerne l'analyse, je me sens obligé de mentionner ce livre (qui pourrait utiliser une mise à jour). Je suis sûr qu'ils connaissent les méthodes qui s'y trouvent. Bien sûr, il existe également d'autres options, y compris peut-être FDE.

Objet : Importation et analyse de données spectrales

Pin m'a envoyé le fichier directement, et c'est ce type . Comme indiqué ici, il s'agit d'un fichier binaire propriétaire, donc le lire directement dans JMP ne serait pas trivial. Wikipédia me dit qu'il y a Code Python pour lire le fichier, l'utilisation de l'interface JMP-Python peut donc fournir le chemin de moindre résistance. Cela pourrait en valoir la peine car je pense que c'est une sorte de norme pour les données spectroscopiques. . .

Objet : Importation et analyse de données spectrales

À la recherche de ' Certificats PKCS #7 ' me conduit à des choses comme cette , qui ne sont (probablement . . . ) pas pertinents. Pour obtenir une aide utile, quelqu'un devrait essayer de charger votre fichier '.spc' dans JMP. Essayez de changer l'extension de fichier en une extension qui sera acceptée, par exemple '.jsl'.