Livello: intermedio
Thomas Walk, Manger DB Pipeline, grande allevamento vegetale, North Dakota State University
Ana Heilman Morales, Mangiatoia per pipeline di grandi dimensioni DB Manger, North Dakota State University
Richard Horsley, Capo Dipartimento, Professore, North Dakota State University
JMP offre una serie di strumenti utili, non solo per l'analisi autonoma, ma anche per l'integrazione nei sistemi di gestione e analisi dei dati esistenti. Nel corso degli anni, sono stati sviluppati strumenti specializzati di gestione e analisi dei dati per gli allevatori che gestiscono numerosi esperimenti che coinvolgono migliaia di linee di riproduzione sperimentali coltivate in più località nel corso di molti anni. Qui, riportiamo su una serie di componenti aggiuntivi JMP che sono stati sviluppati per eseguire query su un database MS SQL Server di allevamento vegetale e quindi analizzare i dati grezzi in modelli misti costruiti in JMP o ASReml, un pacchetto specializzato per la ricerca genetica. In questi componenti aggiuntivi, ogni query DB viene effettuata tramite una Nuova query SQL, con caselle di interfaccia utente fornite per selezionare i parametri di ricerca pertinenti. I risultati possono essere eseguiti tramite analisi di modelli misti direttamente in JMP o sottoposti ad analisi più specializzate in ASReml, che, in questo caso, viene avviato da JMP tramite RunProgram. Durante tutto il processo, le tabelle vengono suddivise o altrimenti gestite per accelerare l'analisi e preparare gli aggiornamenti del DB. L'output di ASReml viene letto nelle tabelle JMP tramite Parse XML. I componenti aggiuntivi sono separati in funzioni JSL per funzionalità modulare in un design orientato agli oggetti. Nel complesso, grazie alla gamma di metodi disponibili, alla capacità di standardizzare le attività in JSL e componenti aggiuntivi e alla facilità di creazione di interfacce utente, JMP è diventato un elemento centrale nella ricerca sull'allevamento delle piante presso NDSU. Speriamo che le funzionalità dimostrate in questa presentazione possano aiutare gli altri a capire come JMP potrebbe essere usato al meglio nelle loro situazioni.
