JMP Génomique est un outil spécialisé mais vaste pour analyser les données génétiques, génomiques et autres données « -omiques ».
Qu'il s'agisse d'analyse d'expression, de GWAS, de modélisation prédictive ou de sélection végétale, JMP Genomics dispose d'un outil pour répondre à ce besoin.
Cette série d'articles de blog traite de l'évaluation croisée et de la simulation de descendance pour la sélection de l'orge. Nous commençons par des données d'essais issus d'essais sur le terrain, effectuons un BLUP, créons des modèles pour prédire les valeurs de sélection, évaluons leur efficacité avec une validation croisée et, finalement, choisissons le meilleur modèle pour simuler plusieurs générations d'un programme de sélection en utilisant l'évaluation croisée et la simulation de descendance.
Les deux premières séries d'articles de cette série de blogs traitaient Association génétique et Analyse des expressions . Cliquez sur les liens pour accéder à ces publications. Vous trouverez ci-dessous les grandes lignes de l'ensemble d'évaluation croisée et de simulation de descendance, en commençant par l'article de cette semaine, Partie 1 : BLUP pour les données d'essais de sélection .
Aperçu de la série
Consolidation des données d'essai
- Évaluation croisée et simulation de descendance avec JMP Genomics, partie 1 : BLUP pour les données d'essais de sélection
Sélection du modèle
- Évaluation croisée et simulation de descendance avec JMP Genomics, Partie 2 : Modélisation prédictive des valeurs de sélection
Simulation d'élevage
- Évaluation croisée et simulation de descendance avec JMP Genomics, Partie 3 : évaluation croisée, sélection et simulation de descendance
JMP Génomique est un outil spécialisé mais vaste pour analyser les données génétiques, génomiques et autres données « -omiques ».
Qu'il s'agisse d'analyse d'expression, de GWAS, de modélisation prédictive ou de sélection végétale, JMP Genomics dispose d'un outil pour répondre à ce besoin.
