の相互評価ツールインJMPゲノミクス遺伝マーカーとスコアリングコードファイルを使用して、潜在的な交雑の評価が可能になります。 スコアリング コードは、対象の形質に対する多数のマーカーの影響を定量化する予測モデルを含む SAS ファイルです。 この例で使用されているスコアリング コード ファイルは、先週の投稿で作成されたものです。 JMP Genomics を使用した相互評価と子孫シミュレーション、パート 2: 育種価の予測モデリング。 交配する個体を含むデータセットはワイド形式であり、数値形式を使用して定義された二対立遺伝子マーカーを持っている必要があります。 この例の入力として使用されるデータセットは、投稿で作成されました。 JMP Genomics を使用した相互評価と子孫シミュレーション、パート 1: 育種試験データ用の BLUP 。 今週の例では、それぞれ約 3,500 個のマーカーを持つ 309 本のオオムギ系統のセット内のすべての可能な異系交雑を評価し、その評価に基づいて選択を行い、それらの選択に基づいて複数世代の交配をシミュレートします。
の相互評価JMP Genomics のツールをスコアリング コード ファイルと組み合わせると、血統データ セットから考えられるすべての交配を迅速に分析できます。 その結果、マーカー データに基づいて、対象となる疾患または形質に関する統計を含む新しいデータ セットが得られます。 注釈データセットを含めて、遺伝的連鎖を分析にさらに組み込むことができることに注意してください。 出力ウィンドウから目的の交配を選択し、子孫シミュレーションのさらなる反復に含めることができ、複数世代のシミュレートされた遺伝的選択が可能になります。
の相互評価JMP Genomics のツールを使用すると、遺伝マーカーとスコアリング コード ファイルを使用して潜在的な交配を評価できます。 スコアリング コードは、対象の形質に対する多数のマーカーの影響を定量化する予測モデルを含む SAS ファイルです。 この例で使用されているスコアリング コード ファイルは、先週の投稿で作成されたものです。 JMP Genomics を使用した相互評価と子孫シミュレーション、パート 2: 育種価の予測モデリング。 交配する個体を含むデータセットはワイド形式であり、数値形式を使用して定義された二対立遺伝子マーカーを持っている必要があります。 この例の入力として使用されるデータセットは、投稿で作成されました。 JMP Genomics を使用した相互評価と子孫シミュレーション、パート 1: 育種試験データ用の BLUP 。 今週の例では、それぞれ約 3,500 個のマーカーを持つ 309 本のオオムギ系統のセット内のすべての可能な異系交配を評価し、その評価に基づいて選択を行い、それらの選択に基づいて複数世代の交配をシミュレートします。
