Analisi dell'espressione con JMP GenomicsGenomica di JMP è uno strumento specializzato ma ampio per l'analisi di dati genetici, genomici e altri dati "-omici".
Che si tratti di analisi dell'espressione, GWAS, modellazione predittiva o miglioramento genetico delle piante, JMP Genomics dispone di uno strumento per soddisfare le esigenze.
La seconda serie di post del blog della nostra serie riguarda i dati di espressione. Importiamo i dati da un file di testo, creiamo un file di progettazione sperimentale che delinea i dettagli dell'esperimento ed eseguiamo un'analisi dell'espressione.
È possibile accedere a ogni puntata della serie di seguito non appena diventa disponibile. La prima serie si è concentrata su Associazione genetica con JMP Genomics .
Profilo della serie
Progetto
- Analisi delle espressioni con JMP Genomics, parte 1: disegno sperimentale
Importare
- Analisi delle espressioni con JMP Genomics, parte 2: importazione dei dati delle espressioni dai file di testo
Analisi delle espressioni
- Analisi delle espressioni con JMP Genomics, parte 3: flusso di lavoro delle espressioni di base
- Controllo di qualità
- Normalizzazione
- Analisi/Modello
JMP Genomics è uno strumento specializzato ma ampio per l'analisi di dati genetici, genomici e altri dati "-omici".
Che si tratti di analisi dell'espressione, GWAS, modellazione predittiva o miglioramento genetico delle piante, JMP Genomics dispone di uno strumento per soddisfare le esigenze.
Ri: Analisi dell'espressione con JMP GenomicsCiao @irinastl ,
JMP Genomics non viene eseguito in modo nativo su MacOS poiché JMP Genomics utilizza SAS in background per elaborare e analizzare i dati di espressione e genotipo. SAS (Desktop SAS/Analytics Pro) non può essere installato su MacOS poiché non è mai stato sviluppato per quel sistema operativo e, a causa di questo vincolo e dipendenza, non funzionerà mai in modo nativo su Mac.
È possibile utilizzare software Virtual Desktop come VMWare o Parallels per eseguire un sistema operativo Windows su Mac e installare JMP Genomics. Un'altra alternativa è utilizzare Bootcamp sul Mac e installare un sistema operativo Windows in modo che funzioni in modo nativo sull'hardware.Una terza opzione è installarlo su un server remoto (come AWS, Citrix o Windows Server OS) e installarlo lì con accesso remoto.
Spero che questo aiuti a spiegare perché.
Migliore,
Ri: Analisi dell'espressione con JMP GenomicsPerché JMPG non è ancora disponibile per i MAC?
