Blocca i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Ho una coltura cellulare, 5 blocchi DOE con 6 parametri di processo in ingresso. Il primo blocco indicava che la temperatura (uno dei 6 parametri di processo in ingresso) era fuori dal setpoint previsto, ma conosco il setpoint effettivo in cui sono state eseguite le condizioni. Questo invalida il mio intero modello? Oppure posso continuare? Oppure, è meglio fare un disegno a 4 blocchi e perdere alcune interazioni a due fattori?
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Il mio pensiero iniziale è quello di ricreare un design nuovo e separato con le esecuzioni eseguite, quindi utilizzare la piattaforma JM Confronta disegni per vedere quali sono le conseguenze dal punto di vista della valutazione del modello rispetto al progetto originale pianificato. Non sono sicuro del modello esatto che hai specificato, quindi alcuni termini potrebbero non essere stimabili o almeno avere correlazioni di stima dei parametri differenti. Ma il mio pensiero iniziale è che non sei in uno scenario "tutto è perduto". Una volta fatto con questo passaggio, procederei con la tua analisi come faresti normalmente con un occhio verso i livelli involontari all'interno di un blocco. Di nuovo, alcuni termini potrebbero essere problematici, ma potresti ancora essere in grado di realizzare i tuoi obiettivi sperimentali primari con questo nuovo design.
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Questa aberrazione non è un problema. Se capisco, il livello di temperatura nel primo blocco non è stato impostato correttamente ma è un valore noto. Corretta? In tal caso, è sufficiente aggiornare i valori di temperatura per quel blocco nella tabella dati prima di eseguire qualsiasi analisi.
Strano che la temperatura avrebbe dovuto essere lo stesso livello per l'intero blocco. Quel disegno è molto insolito. Hai reso la temperatura un fattore difficile da modificare? Intendi trama intera, non blocco?
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Grazie per la risposta @markbailey
"il livello di temperatura nel primo blocco non è stato impostato correttamente ma è un valore noto. Corretta?" -- Sì.
"la temperatura doveva essere allo stesso livello per l'intero blocco". - No. La temperatura aveva tre livelli (alto, basso e controllo), ma dopo che l'esperimento è stato completato, ci siamo resi conto che la temperatura era disattivata su tutti loro.
"Hai reso la temperatura un fattore difficile da modificare?" -- No.
"Intendi trama intera, non blocco?" - Non sono sicuro di cosa intendi per trama intera. Stiamo eseguendo cinque blocchi, ma questo blocco ha avuto un errore in tutte le sonde di temperatura. Pertanto, la temperatura che pensavamo di eseguire (indipendentemente dalla condizione, alta, bassa o controllo) non era la temperatura effettiva. Possiamo eseguire il back-calcolo della temperatura effettiva perché sappiamo quante temperature sono state disattivate per ogni condizione. Questo era il nostro primo blocco fuori dai cinque blocchi, ma abbiamo una tempistica ristretta e abbiamo solo il tempo per altri quattro blocchi, se si trovano all'interno di questo DOE o in un nuovo DOE che riduce alcune interazioni. Questo ha aiutato a chiarire la nostra situazione?
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Grazie per la risposta @P_Bartell .
Ho confrontato i due progetti (l'attuale blocco a 5 funziona con i quattro blocchi senza alcune interazioni secondarie, ma mostra solo che il design a 5 blocchi è più ottimale, il che ha senso perché include tutte le interazioni secondarie. Oppure, mi stai suggerendo di creare un design completamente nuovo?
Sono anche confuso con il tuo ultimo commento, cosa intendi per "livelli involontari all'interno di un blocco?"
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare) @Cricci Quello che stavo suggerendo nella mia risposta iniziale era di confrontare il progetto originariamente inteso con il progetto effettivamente eseguito. Non penso che vedrete caratteristiche drammatiche di valutazione del design tra i due disegni a 5 "blocchi". Poi come mio ex collega @markbailey suggerisce di analizzare il progetto effettivamente eseguito sostituendo i livelli effettivi nella matrice di progetto. Il mio commento sui "livelli involontari" si riferisce al singolo "blocco" che ha avuto le temperature a livelli non previsti. Ma @markbailey Le domande su una "trama intera" sono ben prese.
Ri: Bloccare i problemi del modello DOE come esecuzione dell'esperimento (coltura cellulare)Non c'è nessun problema qui. Volevo solo essere sicuro di aver capito il tuo design e come hai effettivamente condotto l'esperimento. Grazie per il chiarimento.
Quindi, è sufficiente aggiornare i livelli dei fattori nella tabella dei dati prima dell'analisi della regressione e della selezione del modello.
