Ho analizzato un set di dati di biomarker (LOG2 FC P) utilizzando un modello di adattamento lineare Repeat Measure come mostrato di seguito
Ora, vorrei confrontare i trattamenti (LEAD_TAG) in ogni punto temporale (Visit_Description) senza generare tutte le possibili coppie di confronto prodotte dal metodo HSME Differenze Tukey HSD (vedi grafico sotto):
- È possibile farlo?
- Importa? (Esiste cioè un "costo" per confrontare tutte le coppie [36 confronti] invece di quelle desiderate [6 confronti])
Ciao @Thierry_S ,
C'è un costo nell'uso del Tukey HSD metodo pairwise poiché la correzione applicata per mantenere l'alfa globale al livello indicato tiene conto del numero di confronti. Se hai bisogno di guardare solo 3, stai sostanzialmente pagando con potenza statistica correggendo per 36.
Vorrei utilizzare una delle opzioni Contrasto LSMeans, proprio accanto aTukey HSD nel triangolo rosso per la tua interazione tra trattamento e tempo. Puoi specificare tu stesso i contrasti lineari selezionando LSMeans Contrast tre volte o usando "Test Slice", che testerà automaticamente ogni fattore in una sezione lungo l'altro fattore. Nel tuo caso, ciò significa che avrai 6 test: tre test di tempo, uno per ciascun trattamento e tre test di trattamento, uno per volta. Sono gli ultimi tre che vuoi, e saranno etichettati di conseguenza (baseline, settimana 2, settimana 8) e testeranno se hai prove che ci sia un effetto del trattamento in un dato intervallo di tempo.
Si noti che questi test non verranno corretti per confronti multipli: i valori p riportati non sono corretti. Con tre confronti pianificati, una correzione Bonferroni sarà probabilmente più utile.
@julian
